MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	TA	4	8	284	291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012169	AT	3	6	311	316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012169	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012169	AT	3	6	1032	1037	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
5	NC_012169	TA	3	6	1042	1047	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
6	NC_012169	AT	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
7	NC_012169	AT	3	6	1162	1167	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
8	NC_012169	TA	3	6	1189	1194	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
9	NC_012169	AT	3	6	1474	1479	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
10	NC_012169	TC	3	6	2610	2615	0 %	50 %	0 %	50 %	224796545
11	NC_012169	TC	3	6	3283	3288	0 %	50 %	0 %	50 %	224796545
12	NC_012169	AT	3	6	5279	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	224796542
13	NC_012169	AC	3	6	5456	5461	50 %	0 %	0 %	50 %	224796542
14	NC_012169	AT	3	6	6641	6646	50 %	50 %	0 %	0 %	224796538
15	NC_012169	AT	3	6	7038	7043	50 %	50 %	0 %	0 %	224796537
16	NC_012169	AT	3	6	7187	7192	50 %	50 %	0 %	0 %	224796537
17	NC_012169	TC	3	6	7620	7625	0 %	50 %	0 %	50 %	224796537
18	NC_012169	TA	3	6	8100	8105	50 %	50 %	0 %	0 %	224796544
19	NC_012169	CT	3	6	9047	9052	0 %	50 %	0 %	50 %	224796530
20	NC_012169	AT	3	6	9846	9851	50 %	50 %	0 %	0 %	224796530
21	NC_012169	TC	3	6	10138	10143	0 %	50 %	0 %	50 %	224796531
22	NC_012169	AT	4	8	10249	10256	50 %	50 %	0 %	0 %	224796531
23	NC_012169	TA	3	6	11046	11051	50 %	50 %	0 %	0 %	224796534
24	NC_012169	AT	3	6	11516	11521	50 %	50 %	0 %	0 %	224796536
25	NC_012169	TA	3	6	11785	11790	50 %	50 %	0 %	0 %	224796536
26	NC_012169	TA	3	6	11797	11802	50 %	50 %	0 %	0 %	224796536
27	NC_012169	TA	3	6	12117	12122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012169	AT	3	6	12149	12154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012169	AT	3	6	12177	12182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012169	AT	5	10	13042	13051	50 %	50 %	0 %	0 %	224796529
31	NC_012169	AT	3	6	14065	14070	50 %	50 %	0 %	0 %	224796541
32	NC_012169	AT	3	6	14083	14088	50 %	50 %	0 %	0 %	224796541
33	NC_012169	AT	3	6	14839	14844	50 %	50 %	0 %	0 %	224796547
34	NC_012169	TA	3	6	14974	14979	50 %	50 %	0 %	0 %	224796547
35	NC_012169	TA	3	6	15224	15229	50 %	50 %	0 %	0 %	224796547
36	NC_012169	TA	4	8	16465	16472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012169	TA	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.