MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	T	6	6	971	976	0 %	100 %	0 %	0 %	224796535
2	NC_012169	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
3	NC_012169	A	7	7	1068	1074	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
4	NC_012169	A	7	7	1226	1232	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
5	NC_012169	A	6	6	1263	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
6	NC_012169	A	6	6	1343	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
7	NC_012169	A	9	9	1385	1393	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
8	NC_012169	T	8	8	1530	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	224796535
9	NC_012169	A	6	6	1608	1613	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
10	NC_012169	A	6	6	1654	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
11	NC_012169	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
12	NC_012169	A	9	9	1864	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
13	NC_012169	A	6	6	1965	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
14	NC_012169	T	6	6	1980	1985	0 %	100 %	0 %	0 %	224796533
15	NC_012169	A	6	6	1990	1995	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
16	NC_012169	A	6	6	2112	2117	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
17	NC_012169	A	7	7	2170	2176	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
18	NC_012169	A	6	6	2215	2220	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
19	NC_012169	A	6	6	2552	2557	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
20	NC_012169	A	7	7	2623	2629	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
21	NC_012169	T	6	6	2740	2745	0 %	100 %	0 %	0 %	224796545
22	NC_012169	T	6	6	3063	3068	0 %	100 %	0 %	0 %	224796545
23	NC_012169	A	6	6	3165	3170	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
24	NC_012169	A	7	7	3690	3696	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
25	NC_012169	A	6	6	3747	3752	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
26	NC_012169	A	6	6	3805	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
27	NC_012169	A	8	8	3987	3994	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
28	NC_012169	A	7	7	4147	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
29	NC_012169	T	6	6	4408	4413	0 %	100 %	0 %	0 %	224796543
30	NC_012169	A	6	6	4842	4847	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
31	NC_012169	A	6	6	4878	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
32	NC_012169	A	7	7	5230	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
33	NC_012169	T	6	6	5340	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	224796542
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36	NC_012169	A	6	6	6323	6328	100 %	0 %	0 %	0 %	224796538
37	NC_012169	A	6	6	6352	6357	100 %	0 %	0 %	0 %	224796538
38	NC_012169	A	6	6	6620	6625	100 %	0 %	0 %	0 %	224796538
39	NC_012169	T	6	6	6646	6651	0 %	100 %	0 %	0 %	224796538
40	NC_012169	A	8	8	6693	6700	100 %	0 %	0 %	0 %	224796538
41	NC_012169	A	7	7	6706	6712	100 %	0 %	0 %	0 %	224796538
42	NC_012169	A	7	7	7355	7361	100 %	0 %	0 %	0 %	224796537
43	NC_012169	A	6	6	7559	7564	100 %	0 %	0 %	0 %	224796537
44	NC_012169	A	8	8	7874	7881	100 %	0 %	0 %	0 %	224796537
45	NC_012169	A	6	6	8042	8047	100 %	0 %	0 %	0 %	224796544
46	NC_012169	T	6	6	8093	8098	0 %	100 %	0 %	0 %	224796544
47	NC_012169	T	7	7	8290	8296	0 %	100 %	0 %	0 %	224796544
48	NC_012169	T	6	6	8325	8330	0 %	100 %	0 %	0 %	224796544
49	NC_012169	T	6	6	8491	8496	0 %	100 %	0 %	0 %	224796544
50	NC_012169	T	6	6	8559	8564	0 %	100 %	0 %	0 %	224796544
51	NC_012169	A	6	6	8687	8692	100 %	0 %	0 %	0 %	224796544
52	NC_012169	A	7	7	8808	8814	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
53	NC_012169	A	7	7	8816	8822	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
54	NC_012169	A	6	6	8928	8933	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
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59	NC_012169	A	7	7	9314	9320	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
60	NC_012169	A	6	6	9513	9518	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
61	NC_012169	A	6	6	9605	9610	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
62	NC_012169	T	6	6	9774	9779	0 %	100 %	0 %	0 %	224796530
63	NC_012169	A	7	7	9935	9941	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
64	NC_012169	A	6	6	9998	10003	100 %	0 %	0 %	0 %	224796531
65	NC_012169	A	7	7	10082	10088	100 %	0 %	0 %	0 %	224796531
66	NC_012169	A	6	6	10474	10479	100 %	0 %	0 %	0 %	224796534
67	NC_012169	A	6	6	10868	10873	100 %	0 %	0 %	0 %	224796534
68	NC_012169	A	8	8	11094	11101	100 %	0 %	0 %	0 %	224796534
69	NC_012169	T	7	7	11322	11328	0 %	100 %	0 %	0 %	224796536
70	NC_012169	A	6	6	11593	11598	100 %	0 %	0 %	0 %	224796536
71	NC_012169	T	6	6	11729	11734	0 %	100 %	0 %	0 %	224796536
72	NC_012169	A	6	6	11935	11940	100 %	0 %	0 %	0 %	224796536
73	NC_012169	A	8	8	11951	11958	100 %	0 %	0 %	0 %	224796536
74	NC_012169	A	6	6	12277	12282	100 %	0 %	0 %	0 %	224796529
75	NC_012169	T	6	6	12500	12505	0 %	100 %	0 %	0 %	224796529
76	NC_012169	T	6	6	12931	12936	0 %	100 %	0 %	0 %	224796529
77	NC_012169	A	6	6	12973	12978	100 %	0 %	0 %	0 %	224796529
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81	NC_012169	A	7	7	13425	13431	100 %	0 %	0 %	0 %	224796539
82	NC_012169	A	8	8	13440	13447	100 %	0 %	0 %	0 %	224796539
83	NC_012169	T	8	8	13464	13471	0 %	100 %	0 %	0 %	224796539
84	NC_012169	A	7	7	13474	13480	100 %	0 %	0 %	0 %	224796539
85	NC_012169	T	6	6	13518	13523	0 %	100 %	0 %	0 %	224796539
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90	NC_012169	T	7	7	14125	14131	0 %	100 %	0 %	0 %	224796541
91	NC_012169	T	7	7	14175	14181	0 %	100 %	0 %	0 %	224796541
92	NC_012169	T	7	7	14215	14221	0 %	100 %	0 %	0 %	224796541
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103	NC_012169	T	9	9	15294	15302	0 %	100 %	0 %	0 %	224796547
104	NC_012169	A	6	6	15364	15369	100 %	0 %	0 %	0 %	224796546
105	NC_012169	T	6	6	15371	15376	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
106	NC_012169	T	6	6	15554	15559	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
107	NC_012169	T	9	9	15563	15571	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
108	NC_012169	T	9	9	15599	15607	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
109	NC_012169	T	8	8	15621	15628	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
110	NC_012169	T	9	9	15712	15720	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
111	NC_012169	T	6	6	15778	15783	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
112	NC_012169	T	8	8	15803	15810	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
113	NC_012169	T	8	8	15827	15834	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
114	NC_012169	A	7	7	15835	15841	100 %	0 %	0 %	0 %	224796546
115	NC_012169	T	7	7	15849	15855	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
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118	NC_012169	T	7	7	15975	15981	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
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120	NC_012169	A	6	6	16069	16074	100 %	0 %	0 %	0 %	224796546
121	NC_012169	T	6	6	16105	16110	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
122	NC_012169	T	6	6	16342	16347	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.