MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	ATTTTG	2	12	783	794	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224984011
2	NC_012166	TTTTTA	2	12	1590	1601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012166	ATTTTT	4	24	2517	2540	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012166	AAACTA	2	12	3095	3106	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984015
5	NC_012166	AAAAAT	2	12	3301	3312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984015
6	NC_012166	ATTAAA	2	12	4760	4771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
7	NC_012166	ATAAAA	2	12	5047	5058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984018
8	NC_012166	TAAAGA	2	12	5214	5225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984018
9	NC_012166	AAAAGA	2	12	5343	5354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984018
10	NC_012166	TAAAGA	2	12	5535	5546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984018
11	NC_012166	TTTCTT	2	12	7454	7465	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984021
12	NC_012166	ATTTTG	2	12	7687	7698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224984021
13	NC_012166	GATAAA	2	12	8945	8956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984024
14	NC_012166	AGGTTG	2	12	9009	9020	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	224984024
15	NC_012166	TTTTTA	2	12	12441	12452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224984032
16	NC_012166	ATTTTT	2	12	13367	13378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012166	AAACTA	2	12	13933	13944	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984034
18	NC_012166	AAAAAT	2	12	14139	14150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984034
19	NC_012166	ATTAAA	2	12	15598	15609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984036
20	NC_012166	ATAAAA	2	12	15885	15896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984037
21	NC_012166	TAAAGA	2	12	16052	16063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984037
22	NC_012166	AAAAGA	2	12	16181	16192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984037
23	NC_012166	TTTCTT	2	12	18292	18303	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984041
24	NC_012166	ATTTTG	2	12	18525	18536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224984041
25	NC_012166	GATAAA	2	12	19778	19789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984044
26	NC_012166	AGGTTG	2	12	19842	19853	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	224984044
27	NC_012166	CTTAAA	2	12	22363	22374	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012166	TTAAAA	2	12	22700	22711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984050
29	NC_012166	TAGCAA	2	12	22784	22795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012166	ATCACA	2	12	30230	30241	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012166	TAATTT	2	12	31837	31848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.