MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	ATTAA	2	10	552	561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012166	TTGAT	2	10	1092	1101	20 %	60 %	20 %	0 %	224984011
3	NC_012166	AAAAT	2	10	1196	1205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012166	ATTTT	2	10	1854	1863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012166	TATAT	2	10	4055	4064	40 %	60 %	0 %	0 %	224984016
6	NC_012166	ATTTT	2	10	6246	6255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012166	TAATT	2	10	6398	6407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012166	TTATT	2	10	7169	7178	20 %	80 %	0 %	0 %	224984020
9	NC_012166	ATTTT	2	10	7413	7422	20 %	80 %	0 %	0 %	224984021
10	NC_012166	ACTAA	2	10	8250	8259	60 %	20 %	0 %	20 %	224984022
11	NC_012166	ATAAA	2	10	8439	8448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012166	AAAAT	2	10	8847	8856	80 %	20 %	0 %	0 %	224984024
13	NC_012166	CGGAG	2	10	9403	9412	20 %	0 %	60 %	20 %	224984024
14	NC_012166	GAAAA	2	10	10487	10496	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012166	TTTGT	2	10	10602	10611	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012166	AAAAC	2	10	11827	11836	80 %	0 %	0 %	20 %	224984031
17	NC_012166	TTGAT	2	10	11935	11944	20 %	60 %	20 %	0 %	224984031
18	NC_012166	AAAAT	2	10	12039	12048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012166	ATTTT	2	10	12704	12713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012166	TATAT	2	10	14893	14902	40 %	60 %	0 %	0 %	224984035
21	NC_012166	ATTTT	2	10	17083	17092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012166	TAATT	2	10	17235	17244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012166	ATTTT	2	10	18251	18260	20 %	80 %	0 %	0 %	224984041
24	NC_012166	ACTAA	2	10	19086	19095	60 %	20 %	0 %	20 %	224984042
25	NC_012166	ATAAA	2	10	19275	19284	80 %	20 %	0 %	0 %	224984042
26	NC_012166	TATAA	2	10	19635	19644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012166	GAAAA	2	10	21270	21279	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012166	TTTGT	2	10	21376	21385	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012166	AGGAA	2	10	21984	21993	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012166	CAAAA	2	10	22085	22094	80 %	0 %	0 %	20 %	224984049
31	NC_012166	ATTAA	2	10	22583	22592	60 %	40 %	0 %	0 %	224984050
32	NC_012166	TAATA	2	10	23368	23377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012166	TGCTA	2	10	23701	23710	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012166	ATATA	2	10	24324	24333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012166	TAAAA	2	10	25852	25861	80 %	20 %	0 %	0 %	224984056
36	NC_012166	TTAAT	2	10	26503	26512	40 %	60 %	0 %	0 %	224984058
37	NC_012166	CATTT	2	10	26880	26889	20 %	60 %	0 %	20 %	224984059
38	NC_012166	ACTTA	2	10	27380	27389	40 %	40 %	0 %	20 %	224984061
39	NC_012166	TATTT	2	10	27770	27779	20 %	80 %	0 %	0 %	224984061
40	NC_012166	TCTAG	2	10	28687	28696	20 %	40 %	20 %	20 %	224984063
41	NC_012166	CCATT	2	10	30853	30862	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012166	TTATT	2	10	31156	31165	20 %	80 %	0 %	0 %	224984069
43	NC_012166	ATATT	2	10	32181	32190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012166	TACTT	2	10	32445	32454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.