MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	TTGAT	2	10	1092	1101	20 %	60 %	20 %	0 %	224984011
2	NC_012166	TATAT	2	10	4055	4064	40 %	60 %	0 %	0 %	224984016
3	NC_012166	TTATT	2	10	7169	7178	20 %	80 %	0 %	0 %	224984020
4	NC_012166	ATTTT	2	10	7413	7422	20 %	80 %	0 %	0 %	224984021
5	NC_012166	ACTAA	2	10	8250	8259	60 %	20 %	0 %	20 %	224984022
6	NC_012166	AAAAT	2	10	8847	8856	80 %	20 %	0 %	0 %	224984024
7	NC_012166	CGGAG	2	10	9403	9412	20 %	0 %	60 %	20 %	224984024
8	NC_012166	AAAAC	2	10	11827	11836	80 %	0 %	0 %	20 %	224984031
9	NC_012166	TTGAT	2	10	11935	11944	20 %	60 %	20 %	0 %	224984031
10	NC_012166	TATAT	2	10	14893	14902	40 %	60 %	0 %	0 %	224984035
11	NC_012166	ATTTT	2	10	18251	18260	20 %	80 %	0 %	0 %	224984041
12	NC_012166	ACTAA	2	10	19086	19095	60 %	20 %	0 %	20 %	224984042
13	NC_012166	ATAAA	2	10	19275	19284	80 %	20 %	0 %	0 %	224984042
14	NC_012166	CAAAA	2	10	22085	22094	80 %	0 %	0 %	20 %	224984049
15	NC_012166	ATTAA	2	10	22583	22592	60 %	40 %	0 %	0 %	224984050
16	NC_012166	TAAAA	2	10	25852	25861	80 %	20 %	0 %	0 %	224984056
17	NC_012166	TTAAT	2	10	26503	26512	40 %	60 %	0 %	0 %	224984058
18	NC_012166	CATTT	2	10	26880	26889	20 %	60 %	0 %	20 %	224984059
19	NC_012166	ACTTA	2	10	27380	27389	40 %	40 %	0 %	20 %	224984061
20	NC_012166	TATTT	2	10	27770	27779	20 %	80 %	0 %	0 %	224984061
21	NC_012166	TCTAG	2	10	28687	28696	20 %	40 %	20 %	20 %	224984063
22	NC_012166	TTATT	2	10	31156	31165	20 %	80 %	0 %	0 %	224984069

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.