MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	TTTA	2	8	231	238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012166	GGAT	2	8	850	857	25 %	25 %	50 %	0 %	224984011
3	NC_012166	ATAG	2	8	965	972	50 %	25 %	25 %	0 %	224984011
4	NC_012166	ATTT	2	8	1139	1146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012166	TAAT	2	8	1359	1366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012166	TTAA	2	8	1437	1444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012166	AATT	2	8	1749	1756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012166	TGAT	2	8	1774	1781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012166	CAAC	2	8	1969	1976	50 %	0 %	0 %	50 %	224984012
10	NC_012166	AAAC	2	8	2211	2218	75 %	0 %	0 %	25 %	224984013
11	NC_012166	TCAA	2	8	2246	2253	50 %	25 %	0 %	25 %	224984013
12	NC_012166	GTTT	2	8	2333	2340	0 %	75 %	25 %	0 %	224984014
13	NC_012166	CAAA	2	8	2642	2649	75 %	0 %	0 %	25 %	224984015
14	NC_012166	TCAA	2	8	2786	2793	50 %	25 %	0 %	25 %	224984015
15	NC_012166	ATTA	2	8	2840	2847	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
16	NC_012166	AGAA	2	8	2952	2959	75 %	0 %	25 %	0 %	224984015
17	NC_012166	AAAT	2	8	2991	2998	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
18	NC_012166	CTTC	2	8	3147	3154	0 %	50 %	0 %	50 %	224984015
19	NC_012166	TAAA	2	8	3585	3592	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
20	NC_012166	TTAA	2	8	3689	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
21	NC_012166	AGAA	2	8	4127	4134	75 %	0 %	25 %	0 %	224984016
22	NC_012166	ATAA	2	8	4138	4145	75 %	25 %	0 %	0 %	224984016
23	NC_012166	ATGG	2	8	4245	4252	25 %	25 %	50 %	0 %	224984016
24	NC_012166	TGAT	2	8	4360	4367	25 %	50 %	25 %	0 %	224984017
25	NC_012166	TCAT	2	8	4867	4874	25 %	50 %	0 %	25 %	224984017
26	NC_012166	TAAA	2	8	4888	4895	75 %	25 %	0 %	0 %	224984017
27	NC_012166	AAAG	2	8	5140	5147	75 %	0 %	25 %	0 %	224984018
28	NC_012166	CATA	2	8	5477	5484	50 %	25 %	0 %	25 %	224984018
29	NC_012166	TTAA	2	8	5763	5770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012166	TATT	2	8	5999	6006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012166	AGAA	2	8	6054	6061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012166	AATT	2	8	6227	6234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012166	TATT	2	8	6849	6856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012166	ATAA	2	8	7299	7306	75 %	25 %	0 %	0 %	224984020
35	NC_012166	GCAT	2	8	7348	7355	25 %	25 %	25 %	25 %	224984020
36	NC_012166	GGAT	2	8	7391	7398	25 %	25 %	50 %	0 %	224984020
37	NC_012166	TTAT	2	8	7486	7493	25 %	75 %	0 %	0 %	224984021
38	NC_012166	ATTT	2	8	8152	8159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012166	TTAG	2	8	8583	8590	25 %	50 %	25 %	0 %	224984023
40	NC_012166	ATTT	2	8	8676	8683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012166	ATTT	2	8	8750	8757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012166	ATAA	2	8	8758	8765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012166	AATT	2	8	9688	9695	50 %	50 %	0 %	0 %	224984024
44	NC_012166	CAAT	2	8	9925	9932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012166	AGAA	2	8	10198	10205	75 %	0 %	25 %	0 %	224984026
46	NC_012166	AATA	2	8	10218	10225	75 %	25 %	0 %	0 %	224984026
47	NC_012166	AATT	2	8	10516	10523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012166	ATTT	2	8	10684	10691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012166	ACCA	2	8	10760	10767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012166	ATGA	2	8	10804	10811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012166	GGAT	2	8	11693	11700	25 %	25 %	50 %	0 %	224984031
52	NC_012166	ATTT	2	8	11982	11989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012166	TAAT	2	8	12202	12209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012166	TTAA	2	8	12288	12295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012166	AAAT	2	8	12529	12536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012166	AGTA	2	8	12555	12562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012166	AATT	2	8	12600	12607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012166	TGAT	2	8	12625	12632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012166	CAAC	2	8	12819	12826	50 %	0 %	0 %	50 %	224984033
60	NC_012166	AAAC	2	8	13060	13067	75 %	0 %	0 %	25 %	224984033
61	NC_012166	TCAA	2	8	13096	13103	50 %	25 %	0 %	25 %	224984033
62	NC_012166	CAAA	2	8	13480	13487	75 %	0 %	0 %	25 %	224984034
63	NC_012166	TCAA	2	8	13624	13631	50 %	25 %	0 %	25 %	224984034
64	NC_012166	ATTA	2	8	13678	13685	50 %	50 %	0 %	0 %	224984034
65	NC_012166	AGAA	2	8	13790	13797	75 %	0 %	25 %	0 %	224984034
66	NC_012166	AAAT	2	8	13829	13836	75 %	25 %	0 %	0 %	224984034
67	NC_012166	CTTC	2	8	13985	13992	0 %	50 %	0 %	50 %	224984034
68	NC_012166	TAAA	2	8	14423	14430	75 %	25 %	0 %	0 %	224984034
69	NC_012166	TTAA	2	8	14527	14534	50 %	50 %	0 %	0 %	224984034
70	NC_012166	AGAA	2	8	14965	14972	75 %	0 %	25 %	0 %	224984035
71	NC_012166	ATAA	2	8	14976	14983	75 %	25 %	0 %	0 %	224984035
72	NC_012166	ATGG	2	8	15083	15090	25 %	25 %	50 %	0 %	224984035
73	NC_012166	TGAT	2	8	15198	15205	25 %	50 %	25 %	0 %	224984036
74	NC_012166	TCAT	2	8	15705	15712	25 %	50 %	0 %	25 %	224984036
75	NC_012166	TAAA	2	8	15726	15733	75 %	25 %	0 %	0 %	224984036
76	NC_012166	AAAG	2	8	15978	15985	75 %	0 %	25 %	0 %	224984037
77	NC_012166	CATA	2	8	16315	16322	50 %	25 %	0 %	25 %	224984037
78	NC_012166	TATT	2	8	16836	16843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012166	AGAA	2	8	16891	16898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012166	AATT	2	8	17064	17071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012166	TATT	2	8	17685	17692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012166	CTAA	2	8	17996	18003	50 %	25 %	0 %	25 %	224984040
83	NC_012166	TACT	2	8	18004	18011	25 %	50 %	0 %	25 %	224984040
84	NC_012166	ATAA	2	8	18137	18144	75 %	25 %	0 %	0 %	224984040
85	NC_012166	GCAT	2	8	18186	18193	25 %	25 %	25 %	25 %	224984040
86	NC_012166	GGAT	2	8	18229	18236	25 %	25 %	50 %	0 %	224984040
87	NC_012166	TTAT	2	8	18324	18331	25 %	75 %	0 %	0 %	224984041
88	NC_012166	ATTT	2	8	18987	18994	25 %	75 %	0 %	0 %	224984042
89	NC_012166	ATTT	2	8	19509	19516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012166	ATTT	2	8	19583	19590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012166	ATAA	2	8	19591	19598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012166	ACGA	2	8	20163	20170	50 %	0 %	25 %	25 %	224984044
93	NC_012166	AATT	2	8	20521	20528	50 %	50 %	0 %	0 %	224984044
94	NC_012166	TCCA	2	8	20586	20593	25 %	25 %	0 %	50 %	224984044
95	NC_012166	CAAT	2	8	20765	20772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012166	AGAA	2	8	21038	21045	75 %	0 %	25 %	0 %	224984046
97	NC_012166	AATA	2	8	21058	21065	75 %	25 %	0 %	0 %	224984046
98	NC_012166	AATA	2	8	21188	21195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012166	ATTT	2	8	21458	21465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012166	ACCA	2	8	21534	21541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012166	ATGA	2	8	21578	21585	50 %	25 %	25 %	0 %	224984047
102	NC_012166	ATGA	2	8	22127	22134	50 %	25 %	25 %	0 %	224984049
103	NC_012166	TAAA	2	8	22152	22159	75 %	25 %	0 %	0 %	224984049
104	NC_012166	CTTA	2	8	22398	22405	25 %	50 %	0 %	25 %	224984050
105	NC_012166	AAAT	2	8	22731	22738	75 %	25 %	0 %	0 %	224984050
106	NC_012166	ACTA	2	8	22820	22827	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012166	AAAT	2	8	22867	22874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012166	AGCA	2	8	22970	22977	50 %	0 %	25 %	25 %	224984051
109	NC_012166	GTTT	2	8	23046	23053	0 %	75 %	25 %	0 %	224984051
110	NC_012166	AATT	2	8	23254	23261	50 %	50 %	0 %	0 %	224984052
111	NC_012166	TATC	2	8	23358	23365	25 %	50 %	0 %	25 %	224984052
112	NC_012166	ATAA	2	8	23518	23525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012166	AATA	2	8	23579	23586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012166	ACAA	2	8	24244	24251	75 %	0 %	0 %	25 %	224984054
115	NC_012166	TTTA	2	8	24359	24366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012166	TTCT	2	8	25126	25133	0 %	75 %	0 %	25 %	224984055
117	NC_012166	TTAT	2	8	25432	25439	25 %	75 %	0 %	0 %	224984055
118	NC_012166	ATAA	3	12	25465	25476	75 %	25 %	0 %	0 %	224984055
119	NC_012166	ATTT	2	8	25549	25556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012166	TATT	2	8	25637	25644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012166	ACTT	2	8	26457	26464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012166	CGTT	2	8	26938	26945	0 %	50 %	25 %	25 %	224984059
123	NC_012166	TAAA	2	8	27090	27097	75 %	25 %	0 %	0 %	224984060
124	NC_012166	AGAA	2	8	27102	27109	75 %	0 %	25 %	0 %	224984060
125	NC_012166	ATAA	2	8	27198	27205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012166	CATA	2	8	27259	27266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012166	GCTT	2	8	27579	27586	0 %	50 %	25 %	25 %	224984061
128	NC_012166	AGAC	2	8	27638	27645	50 %	0 %	25 %	25 %	224984061
129	NC_012166	AGCA	2	8	28145	28152	50 %	0 %	25 %	25 %	224984061
130	NC_012166	ACAA	2	8	28320	28327	75 %	0 %	0 %	25 %	224984061
131	NC_012166	ATTT	2	8	28459	28466	25 %	75 %	0 %	0 %	224984062
132	NC_012166	TAAA	2	8	29710	29717	75 %	25 %	0 %	0 %	224984066
133	NC_012166	ATAA	2	8	29771	29778	75 %	25 %	0 %	0 %	224984066
134	NC_012166	GTTC	2	8	30063	30070	0 %	50 %	25 %	25 %	224984067
135	NC_012166	AAAT	2	8	30206	30213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012166	TCTT	2	8	30290	30297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012166	TGGG	2	8	30378	30385	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012166	CTTT	3	12	30723	30734	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012166	AATA	2	8	30793	30800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012166	TAAA	2	8	31001	31008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012166	TTTA	2	8	31607	31614	25 %	75 %	0 %	0 %	224984070
142	NC_012166	GCAA	2	8	31620	31627	50 %	0 %	25 %	25 %	224984070
143	NC_012166	TATT	2	8	31850	31857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012166	ATTA	2	8	32221	32228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012166	TTTA	2	8	32380	32387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012166	TAAA	2	8	32575	32582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012166	ATAA	2	8	32636	32643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.