MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	GGAT	2	8	850	857	25 %	25 %	50 %	0 %	224984011
2	NC_012166	ATAG	2	8	965	972	50 %	25 %	25 %	0 %	224984011
3	NC_012166	CAAC	2	8	1969	1976	50 %	0 %	0 %	50 %	224984012
4	NC_012166	AAAC	2	8	2211	2218	75 %	0 %	0 %	25 %	224984013
5	NC_012166	TCAA	2	8	2246	2253	50 %	25 %	0 %	25 %	224984013
6	NC_012166	GTTT	2	8	2333	2340	0 %	75 %	25 %	0 %	224984014
7	NC_012166	CAAA	2	8	2642	2649	75 %	0 %	0 %	25 %	224984015
8	NC_012166	TCAA	2	8	2786	2793	50 %	25 %	0 %	25 %	224984015
9	NC_012166	ATTA	2	8	2840	2847	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
10	NC_012166	AGAA	2	8	2952	2959	75 %	0 %	25 %	0 %	224984015
11	NC_012166	AAAT	2	8	2991	2998	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
12	NC_012166	CTTC	2	8	3147	3154	0 %	50 %	0 %	50 %	224984015
13	NC_012166	TAAA	2	8	3585	3592	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
14	NC_012166	TTAA	2	8	3689	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
15	NC_012166	AGAA	2	8	4127	4134	75 %	0 %	25 %	0 %	224984016
16	NC_012166	ATAA	2	8	4138	4145	75 %	25 %	0 %	0 %	224984016
17	NC_012166	ATGG	2	8	4245	4252	25 %	25 %	50 %	0 %	224984016
18	NC_012166	TGAT	2	8	4360	4367	25 %	50 %	25 %	0 %	224984017
19	NC_012166	TCAT	2	8	4867	4874	25 %	50 %	0 %	25 %	224984017
20	NC_012166	TAAA	2	8	4888	4895	75 %	25 %	0 %	0 %	224984017
21	NC_012166	AAAG	2	8	5140	5147	75 %	0 %	25 %	0 %	224984018
22	NC_012166	CATA	2	8	5477	5484	50 %	25 %	0 %	25 %	224984018
23	NC_012166	ATAA	2	8	7299	7306	75 %	25 %	0 %	0 %	224984020
24	NC_012166	GCAT	2	8	7348	7355	25 %	25 %	25 %	25 %	224984020
25	NC_012166	GGAT	2	8	7391	7398	25 %	25 %	50 %	0 %	224984020
26	NC_012166	TTAT	2	8	7486	7493	25 %	75 %	0 %	0 %	224984021
27	NC_012166	TTAG	2	8	8583	8590	25 %	50 %	25 %	0 %	224984023
28	NC_012166	AATT	2	8	9688	9695	50 %	50 %	0 %	0 %	224984024
29	NC_012166	AGAA	2	8	10198	10205	75 %	0 %	25 %	0 %	224984026
30	NC_012166	AATA	2	8	10218	10225	75 %	25 %	0 %	0 %	224984026
31	NC_012166	GGAT	2	8	11693	11700	25 %	25 %	50 %	0 %	224984031
32	NC_012166	CAAC	2	8	12819	12826	50 %	0 %	0 %	50 %	224984033
33	NC_012166	AAAC	2	8	13060	13067	75 %	0 %	0 %	25 %	224984033
34	NC_012166	TCAA	2	8	13096	13103	50 %	25 %	0 %	25 %	224984033
35	NC_012166	CAAA	2	8	13480	13487	75 %	0 %	0 %	25 %	224984034
36	NC_012166	TCAA	2	8	13624	13631	50 %	25 %	0 %	25 %	224984034
37	NC_012166	ATTA	2	8	13678	13685	50 %	50 %	0 %	0 %	224984034
38	NC_012166	AGAA	2	8	13790	13797	75 %	0 %	25 %	0 %	224984034
39	NC_012166	AAAT	2	8	13829	13836	75 %	25 %	0 %	0 %	224984034
40	NC_012166	CTTC	2	8	13985	13992	0 %	50 %	0 %	50 %	224984034
41	NC_012166	TAAA	2	8	14423	14430	75 %	25 %	0 %	0 %	224984034
42	NC_012166	TTAA	2	8	14527	14534	50 %	50 %	0 %	0 %	224984034
43	NC_012166	AGAA	2	8	14965	14972	75 %	0 %	25 %	0 %	224984035
44	NC_012166	ATAA	2	8	14976	14983	75 %	25 %	0 %	0 %	224984035
45	NC_012166	ATGG	2	8	15083	15090	25 %	25 %	50 %	0 %	224984035
46	NC_012166	TGAT	2	8	15198	15205	25 %	50 %	25 %	0 %	224984036
47	NC_012166	TCAT	2	8	15705	15712	25 %	50 %	0 %	25 %	224984036
48	NC_012166	TAAA	2	8	15726	15733	75 %	25 %	0 %	0 %	224984036
49	NC_012166	AAAG	2	8	15978	15985	75 %	0 %	25 %	0 %	224984037
50	NC_012166	CATA	2	8	16315	16322	50 %	25 %	0 %	25 %	224984037
51	NC_012166	CTAA	2	8	17996	18003	50 %	25 %	0 %	25 %	224984040
52	NC_012166	TACT	2	8	18004	18011	25 %	50 %	0 %	25 %	224984040
53	NC_012166	ATAA	2	8	18137	18144	75 %	25 %	0 %	0 %	224984040
54	NC_012166	GCAT	2	8	18186	18193	25 %	25 %	25 %	25 %	224984040
55	NC_012166	GGAT	2	8	18229	18236	25 %	25 %	50 %	0 %	224984040
56	NC_012166	TTAT	2	8	18324	18331	25 %	75 %	0 %	0 %	224984041
57	NC_012166	ATTT	2	8	18987	18994	25 %	75 %	0 %	0 %	224984042
58	NC_012166	ACGA	2	8	20163	20170	50 %	0 %	25 %	25 %	224984044
59	NC_012166	AATT	2	8	20521	20528	50 %	50 %	0 %	0 %	224984044
60	NC_012166	TCCA	2	8	20586	20593	25 %	25 %	0 %	50 %	224984044
61	NC_012166	AGAA	2	8	21038	21045	75 %	0 %	25 %	0 %	224984046
62	NC_012166	AATA	2	8	21058	21065	75 %	25 %	0 %	0 %	224984046
63	NC_012166	ATGA	2	8	21578	21585	50 %	25 %	25 %	0 %	224984047
64	NC_012166	ATGA	2	8	22127	22134	50 %	25 %	25 %	0 %	224984049
65	NC_012166	TAAA	2	8	22152	22159	75 %	25 %	0 %	0 %	224984049
66	NC_012166	CTTA	2	8	22398	22405	25 %	50 %	0 %	25 %	224984050
67	NC_012166	AAAT	2	8	22731	22738	75 %	25 %	0 %	0 %	224984050
68	NC_012166	AGCA	2	8	22970	22977	50 %	0 %	25 %	25 %	224984051
69	NC_012166	GTTT	2	8	23046	23053	0 %	75 %	25 %	0 %	224984051
70	NC_012166	AATT	2	8	23254	23261	50 %	50 %	0 %	0 %	224984052
71	NC_012166	TATC	2	8	23358	23365	25 %	50 %	0 %	25 %	224984052
72	NC_012166	ACAA	2	8	24244	24251	75 %	0 %	0 %	25 %	224984054
73	NC_012166	TTCT	2	8	25126	25133	0 %	75 %	0 %	25 %	224984055
74	NC_012166	TTAT	2	8	25432	25439	25 %	75 %	0 %	0 %	224984055
75	NC_012166	ATAA	3	12	25465	25476	75 %	25 %	0 %	0 %	224984055
76	NC_012166	CGTT	2	8	26938	26945	0 %	50 %	25 %	25 %	224984059
77	NC_012166	TAAA	2	8	27090	27097	75 %	25 %	0 %	0 %	224984060
78	NC_012166	AGAA	2	8	27102	27109	75 %	0 %	25 %	0 %	224984060
79	NC_012166	GCTT	2	8	27579	27586	0 %	50 %	25 %	25 %	224984061
80	NC_012166	AGAC	2	8	27638	27645	50 %	0 %	25 %	25 %	224984061
81	NC_012166	AGCA	2	8	28145	28152	50 %	0 %	25 %	25 %	224984061
82	NC_012166	ACAA	2	8	28320	28327	75 %	0 %	0 %	25 %	224984061
83	NC_012166	ATTT	2	8	28459	28466	25 %	75 %	0 %	0 %	224984062
84	NC_012166	TAAA	2	8	29710	29717	75 %	25 %	0 %	0 %	224984066
85	NC_012166	ATAA	2	8	29771	29778	75 %	25 %	0 %	0 %	224984066
86	NC_012166	GTTC	2	8	30063	30070	0 %	50 %	25 %	25 %	224984067
87	NC_012166	TTTA	2	8	31607	31614	25 %	75 %	0 %	0 %	224984070
88	NC_012166	GCAA	2	8	31620	31627	50 %	0 %	25 %	25 %	224984070

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.