MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	AGA	2	6	32	37	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984010
2	NC_012166	GGA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984010
3	NC_012166	ACA	2	6	135	140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012166	ATT	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012166	TAT	2	6	183	188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012166	TAA	3	9	189	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012166	CTA	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012166	ATA	2	6	290	295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012166	TTA	2	6	358	363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012166	TAT	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012166	TAT	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012166	ATT	2	6	628	633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012166	TAG	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012166	ATG	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012166	AAT	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
16	NC_012166	ATA	2	6	704	709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
17	NC_012166	AAG	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984011
18	NC_012166	ATG	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
19	NC_012166	ATG	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
20	NC_012166	AAT	2	6	1103	1108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
21	NC_012166	TAA	2	6	1129	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012166	AGA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012166	GAT	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012166	TAA	2	6	1349	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012166	TAT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012166	AAT	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012166	ACA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012166	ATT	2	6	1684	1689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012166	ATT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012166	AGG	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012166	AAT	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012166	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984012
33	NC_012166	ATT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984013
34	NC_012166	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984014
35	NC_012166	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984014
36	NC_012166	TCT	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984014
37	NC_012166	AAC	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012166	TAT	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012166	GAG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012166	TAA	2	6	2629	2634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
41	NC_012166	CAA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
42	NC_012166	ACT	2	6	2805	2810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
43	NC_012166	CTA	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
44	NC_012166	ACA	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
45	NC_012166	TAA	2	6	2925	2930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
46	NC_012166	TAA	3	9	3037	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
47	NC_012166	ATA	2	6	3048	3053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
48	NC_012166	AAG	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
49	NC_012166	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
50	NC_012166	AGA	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
51	NC_012166	AAT	2	6	3245	3250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
52	NC_012166	ACA	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
53	NC_012166	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
54	NC_012166	CAA	2	6	3622	3627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
55	NC_012166	AAC	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
56	NC_012166	ATA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
57	NC_012166	TCA	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984016
58	NC_012166	GAA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984016
59	NC_012166	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984016
60	NC_012166	TAA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
61	NC_012166	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
62	NC_012166	AGG	2	6	4289	4294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984017
63	NC_012166	ACC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984017
64	NC_012166	AGA	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984017
65	NC_012166	TTC	2	6	4481	4486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984017
66	NC_012166	AAT	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
67	NC_012166	ATA	3	9	4623	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
68	NC_012166	ATT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
69	NC_012166	ATA	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
70	NC_012166	ATT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
71	NC_012166	AAG	2	6	4754	4759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984017
72	NC_012166	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
73	NC_012166	TAA	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
74	NC_012166	GAT	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984017
75	NC_012166	TAA	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
76	NC_012166	TAC	2	6	5070	5075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984018
77	NC_012166	ATA	2	6	5177	5182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984018
78	NC_012166	AGA	2	6	5328	5333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984018
79	NC_012166	AAG	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984018
80	NC_012166	TAT	2	6	5485	5490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984018
81	NC_012166	TAT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012166	ATA	2	6	5811	5816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984019
83	NC_012166	ATA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984019
84	NC_012166	TTA	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984019
85	NC_012166	TAA	2	6	5954	5959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012166	CAA	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012166	TAA	2	6	6092	6097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012166	GAT	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012166	TAA	2	6	6219	6224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012166	ACT	2	6	6294	6299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012166	TAA	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012166	ATA	2	6	6579	6584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012166	CAA	2	6	6598	6603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012166	TAT	2	6	6700	6705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012166	ATT	2	6	6780	6785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012166	TAA	3	9	6795	6803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012166	ATA	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984020
98	NC_012166	TTA	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984020
99	NC_012166	GAA	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984020
100	NC_012166	GAA	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984020
101	NC_012166	GTT	2	6	6966	6971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984020
102	NC_012166	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984020
103	NC_012166	TCA	2	6	7382	7387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984020
104	NC_012166	ATT	2	6	7427	7432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984021
105	NC_012166	ATT	2	6	7500	7505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984021
106	NC_012166	AGA	2	6	7514	7519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984021
107	NC_012166	TGA	2	6	7532	7537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984021
108	NC_012166	ATA	2	6	7708	7713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984021
109	NC_012166	AAT	2	6	7779	7784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984021
110	NC_012166	CAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984021
111	NC_012166	GTT	2	6	7950	7955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984021
112	NC_012166	TCT	2	6	8280	8285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984022
113	NC_012166	ATC	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984022
114	NC_012166	ATC	2	6	8430	8435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984022
115	NC_012166	TAA	2	6	8464	8469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012166	TTA	2	6	8626	8631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984023
117	NC_012166	TAA	2	6	8777	8782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012166	GAT	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012166	TAA	2	6	8829	8834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012166	AAG	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984024
121	NC_012166	AGA	2	6	9127	9132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984024
122	NC_012166	ACC	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984024
123	NC_012166	TAA	2	6	9247	9252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984024
124	NC_012166	TAG	2	6	9270	9275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984024
125	NC_012166	CTC	2	6	9294	9299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984024
126	NC_012166	GAC	2	6	9338	9343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984024
127	NC_012166	GAC	2	6	9357	9362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984024
128	NC_012166	CAG	2	6	9415	9420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984024
129	NC_012166	TTA	2	6	9617	9622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984024
130	NC_012166	GAA	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984024
131	NC_012166	CAA	2	6	9702	9707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984024
132	NC_012166	TGA	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984024
133	NC_012166	AAT	2	6	9841	9846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012166	AAC	2	6	9879	9884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012166	GTT	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012166	AAT	2	6	9952	9957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012166	AAT	2	6	10019	10024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984025
138	NC_012166	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984025
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142	NC_012166	GAT	2	6	10397	10402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012166	AAT	2	6	10497	10502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012166	TTA	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012166	TAA	2	6	10596	10601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012166	TTA	2	6	10698	10703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012166	AAT	2	6	10719	10724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012166	TAA	2	6	10783	10788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012166	TAG	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_012166	TAT	2	6	17536	17541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_012166	AAT	2	6	18617	18622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984041
268	NC_012166	CAA	2	6	18641	18646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984041
269	NC_012166	TCT	2	6	19116	19121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984042
270	NC_012166	ATC	2	6	19125	19130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984042
271	NC_012166	TAA	2	6	19300	19305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012166	TTA	2	6	19459	19464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984043
273	NC_012166	TCT	2	6	19518	19523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_012166	TAA	2	6	19610	19615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_012166	TAA	2	6	19629	19634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_012166	TAA	2	6	19662	19667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_012166	GAT	2	6	19668	19673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_012166	GGA	2	6	19676	19681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_012166	AAG	2	6	19927	19932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984044
280	NC_012166	AGA	2	6	19960	19965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984044
281	NC_012166	ACC	2	6	19996	20001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984044
282	NC_012166	TAA	2	6	20080	20085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984044
283	NC_012166	CTC	2	6	20127	20132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984044
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289	NC_012166	CAA	2	6	20535	20540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984044
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293	NC_012166	GTT	2	6	20753	20758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012166	AAT	2	6	20792	20797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_012166	AAT	2	6	20859	20864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984045
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298	NC_012166	GAG	2	6	21020	21025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984046
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300	NC_012166	ATA	2	6	21180	21185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_012166	ATT	2	6	21295	21300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_012166	TTA	2	6	21339	21344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_012166	TAA	2	6	21370	21375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_012166	TTA	2	6	21472	21477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_012166	AAT	2	6	21493	21498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_012166	AAT	2	6	21523	21528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_012166	TAA	2	6	21557	21562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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338	NC_012166	CTT	2	6	23534	23539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
339	NC_012166	ATT	2	6	23592	23597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_012166	ATT	2	6	25512	25517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_012166	TCA	2	6	26154	26159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_012166	TAT	2	6	26200	26205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_012166	ATT	2	6	26215	26220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_012166	AAT	2	6	26241	26246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_012166	ATA	2	6	26279	26284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984057
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391	NC_012166	ATA	2	6	26375	26380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984057
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397	NC_012166	ATT	2	6	26588	26593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984058
398	NC_012166	ATT	2	6	26619	26624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984058
399	NC_012166	TTC	2	6	26702	26707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_012166	TCT	2	6	26715	26720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_012166	TAA	2	6	26721	26726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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