MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	AT	3	6	586	591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012166	AT	3	6	856	861	50 %	50 %	0 %	0 %	224984011
3	NC_012166	AT	3	6	1515	1520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012166	AT	3	6	1552	1557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012166	CT	3	6	1559	1564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012166	TA	3	6	2199	2204	50 %	50 %	0 %	0 %	224984013
7	NC_012166	AG	3	6	2942	2947	50 %	0 %	50 %	0 %	224984015
8	NC_012166	AT	3	6	3811	3816	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
9	NC_012166	TA	3	6	3839	3844	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
10	NC_012166	AT	3	6	4530	4535	50 %	50 %	0 %	0 %	224984017
11	NC_012166	TA	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	224984017
12	NC_012166	AT	3	6	5037	5042	50 %	50 %	0 %	0 %	224984018
13	NC_012166	TA	3	6	5726	5731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012166	AT	3	6	5849	5854	50 %	50 %	0 %	0 %	224984019
15	NC_012166	AT	3	6	6305	6310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012166	TA	3	6	6349	6354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012166	AT	3	6	6545	6550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012166	AT	3	6	6564	6569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012166	AT	3	6	6809	6814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012166	AT	4	8	7125	7132	50 %	50 %	0 %	0 %	224984020
21	NC_012166	TA	3	6	8095	8100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012166	AT	4	8	8492	8499	50 %	50 %	0 %	0 %	224984023
23	NC_012166	TC	3	6	8555	8560	0 %	50 %	0 %	50 %	224984023
24	NC_012166	TG	3	6	8648	8653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012166	TA	3	6	8818	8823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012166	GA	3	6	10092	10097	50 %	0 %	50 %	0 %	224984025
27	NC_012166	TA	3	6	10475	10480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012166	AT	3	6	10727	10732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012166	AT	3	6	11429	11434	50 %	50 %	0 %	0 %	224984029
30	NC_012166	AT	3	6	11699	11704	50 %	50 %	0 %	0 %	224984031
31	NC_012166	AT	3	6	12403	12408	50 %	50 %	0 %	0 %	224984032
32	NC_012166	CT	3	6	12410	12415	0 %	50 %	0 %	50 %	224984032
33	NC_012166	TA	3	6	13048	13053	50 %	50 %	0 %	0 %	224984033
34	NC_012166	AT	3	6	13259	13264	50 %	50 %	0 %	0 %	224984033
35	NC_012166	AG	3	6	13780	13785	50 %	0 %	50 %	0 %	224984034
36	NC_012166	AT	3	6	14206	14211	50 %	50 %	0 %	0 %	224984034
37	NC_012166	AT	3	6	14649	14654	50 %	50 %	0 %	0 %	224984035
38	NC_012166	TA	3	6	14677	14682	50 %	50 %	0 %	0 %	224984035
39	NC_012166	AT	3	6	15368	15373	50 %	50 %	0 %	0 %	224984036
40	NC_012166	TA	3	6	15458	15463	50 %	50 %	0 %	0 %	224984036
41	NC_012166	AT	3	6	15875	15880	50 %	50 %	0 %	0 %	224984037
42	NC_012166	TA	3	6	16564	16569	50 %	50 %	0 %	0 %	224984038
43	NC_012166	AT	3	6	16687	16692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012166	AT	3	6	17142	17147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012166	TA	3	6	17186	17191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012166	AT	3	6	17382	17387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012166	AT	3	6	17401	17406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012166	AT	3	6	17645	17650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012166	AG	3	6	17882	17887	50 %	0 %	50 %	0 %	224984039
50	NC_012166	AT	4	8	17963	17970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012166	TA	3	6	18933	18938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012166	AT	4	8	19325	19332	50 %	50 %	0 %	0 %	224984043
53	NC_012166	TC	3	6	19388	19393	0 %	50 %	0 %	50 %	224984043
54	NC_012166	TG	3	6	19481	19486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012166	TA	3	6	19651	19656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012166	GA	3	6	20932	20937	50 %	0 %	50 %	0 %	224984045
57	NC_012166	TA	3	6	21258	21263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012166	AT	3	6	21501	21506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012166	TA	3	6	23150	23155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012166	AT	3	6	24187	24192	50 %	50 %	0 %	0 %	224984054
61	NC_012166	GA	3	6	24385	24390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012166	AT	4	8	25936	25943	50 %	50 %	0 %	0 %	224984056
63	NC_012166	TC	3	6	25978	25983	0 %	50 %	0 %	50 %	224984056
64	NC_012166	CT	3	6	26484	26489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012166	TA	3	6	26491	26496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012166	AT	3	6	26913	26918	50 %	50 %	0 %	0 %	224984059
67	NC_012166	AT	3	6	27042	27047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012166	AT	4	8	27073	27080	50 %	50 %	0 %	0 %	224984060
69	NC_012166	AG	4	8	27288	27295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012166	AT	4	8	28527	28534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012166	AT	4	8	29896	29903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012166	AT	3	6	30051	30056	50 %	50 %	0 %	0 %	224984067
73	NC_012166	GT	3	6	30127	30132	0 %	50 %	50 %	0 %	224984067
74	NC_012166	TA	3	6	31210	31215	50 %	50 %	0 %	0 %	224984069
75	NC_012166	AT	3	6	31412	31417	50 %	50 %	0 %	0 %	224984069
76	NC_012166	AT	3	6	31643	31648	50 %	50 %	0 %	0 %	224984070

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.