MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	AT	3	6	856	861	50 %	50 %	0 %	0 %	224984011
2	NC_012166	TA	3	6	2199	2204	50 %	50 %	0 %	0 %	224984013
3	NC_012166	AG	3	6	2942	2947	50 %	0 %	50 %	0 %	224984015
4	NC_012166	AT	3	6	3811	3816	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
5	NC_012166	TA	3	6	3839	3844	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
6	NC_012166	AT	3	6	4530	4535	50 %	50 %	0 %	0 %	224984017
7	NC_012166	TA	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	224984017
8	NC_012166	AT	3	6	5037	5042	50 %	50 %	0 %	0 %	224984018
9	NC_012166	AT	3	6	5849	5854	50 %	50 %	0 %	0 %	224984019
10	NC_012166	AT	4	8	7125	7132	50 %	50 %	0 %	0 %	224984020
11	NC_012166	AT	4	8	8492	8499	50 %	50 %	0 %	0 %	224984023
12	NC_012166	TC	3	6	8555	8560	0 %	50 %	0 %	50 %	224984023
13	NC_012166	GA	3	6	10092	10097	50 %	0 %	50 %	0 %	224984025
14	NC_012166	AT	3	6	11429	11434	50 %	50 %	0 %	0 %	224984029
15	NC_012166	AT	3	6	11699	11704	50 %	50 %	0 %	0 %	224984031
16	NC_012166	AT	3	6	12403	12408	50 %	50 %	0 %	0 %	224984032
17	NC_012166	CT	3	6	12410	12415	0 %	50 %	0 %	50 %	224984032
18	NC_012166	TA	3	6	13048	13053	50 %	50 %	0 %	0 %	224984033
19	NC_012166	AT	3	6	13259	13264	50 %	50 %	0 %	0 %	224984033
20	NC_012166	AG	3	6	13780	13785	50 %	0 %	50 %	0 %	224984034
21	NC_012166	AT	3	6	14206	14211	50 %	50 %	0 %	0 %	224984034
22	NC_012166	AT	3	6	14649	14654	50 %	50 %	0 %	0 %	224984035
23	NC_012166	TA	3	6	14677	14682	50 %	50 %	0 %	0 %	224984035
24	NC_012166	AT	3	6	15368	15373	50 %	50 %	0 %	0 %	224984036
25	NC_012166	TA	3	6	15458	15463	50 %	50 %	0 %	0 %	224984036
26	NC_012166	AT	3	6	15875	15880	50 %	50 %	0 %	0 %	224984037
27	NC_012166	TA	3	6	16564	16569	50 %	50 %	0 %	0 %	224984038
28	NC_012166	AG	3	6	17882	17887	50 %	0 %	50 %	0 %	224984039
29	NC_012166	AT	4	8	19325	19332	50 %	50 %	0 %	0 %	224984043
30	NC_012166	TC	3	6	19388	19393	0 %	50 %	0 %	50 %	224984043
31	NC_012166	GA	3	6	20932	20937	50 %	0 %	50 %	0 %	224984045
32	NC_012166	AT	3	6	24187	24192	50 %	50 %	0 %	0 %	224984054
33	NC_012166	AT	4	8	25936	25943	50 %	50 %	0 %	0 %	224984056
34	NC_012166	TC	3	6	25978	25983	0 %	50 %	0 %	50 %	224984056
35	NC_012166	AT	3	6	26913	26918	50 %	50 %	0 %	0 %	224984059
36	NC_012166	AT	4	8	27073	27080	50 %	50 %	0 %	0 %	224984060
37	NC_012166	AT	3	6	30051	30056	50 %	50 %	0 %	0 %	224984067
38	NC_012166	GT	3	6	30127	30132	0 %	50 %	50 %	0 %	224984067
39	NC_012166	TA	3	6	31210	31215	50 %	50 %	0 %	0 %	224984069
40	NC_012166	AT	3	6	31412	31417	50 %	50 %	0 %	0 %	224984069
41	NC_012166	AT	3	6	31643	31648	50 %	50 %	0 %	0 %	224984070

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.