MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	T	6	6	26	31	0 %	100 %	0 %	0 %	224984010
2	NC_012166	A	6	6	143	148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012166	T	8	8	420	427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012166	A	6	6	465	470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012166	T	6	6	591	596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012166	A	6	6	735	740	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
7	NC_012166	T	7	7	904	910	0 %	100 %	0 %	0 %	224984011
8	NC_012166	A	8	8	922	929	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
9	NC_012166	A	6	6	1182	1187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012166	A	6	6	1289	1294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012166	A	7	7	1376	1382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012166	A	7	7	1402	1408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012166	A	7	7	1419	1425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012166	A	6	6	1448	1453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012166	A	6	6	1616	1621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012166	A	7	7	2135	2141	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
17	NC_012166	T	7	7	2143	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	224984013
18	NC_012166	A	9	9	2237	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
19	NC_012166	A	6	6	2464	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012166	A	9	9	2711	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
21	NC_012166	A	6	6	2906	2911	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
22	NC_012166	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
23	NC_012166	A	6	6	3074	3079	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
24	NC_012166	A	7	7	3106	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
25	NC_012166	A	6	6	3230	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
26	NC_012166	A	6	6	3277	3282	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
27	NC_012166	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
28	NC_012166	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
29	NC_012166	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
30	NC_012166	A	6	6	3444	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
31	NC_012166	A	6	6	3464	3469	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
32	NC_012166	A	6	6	3499	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
33	NC_012166	A	7	7	3594	3600	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
34	NC_012166	A	7	7	3611	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
35	NC_012166	A	6	6	3675	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
36	NC_012166	A	9	9	3736	3744	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
37	NC_012166	A	6	6	3784	3789	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
38	NC_012166	A	8	8	3865	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
39	NC_012166	A	7	7	3908	3914	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
40	NC_012166	A	6	6	4078	4083	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
41	NC_012166	A	6	6	4144	4149	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
42	NC_012166	A	8	8	4437	4444	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
43	NC_012166	A	6	6	4467	4472	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
44	NC_012166	T	6	6	4543	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	224984017
45	NC_012166	A	8	8	4803	4810	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
46	NC_012166	T	6	6	4856	4861	0 %	100 %	0 %	0 %	224984017
47	NC_012166	A	6	6	4962	4967	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
48	NC_012166	A	6	6	5076	5081	100 %	0 %	0 %	0 %	224984018
49	NC_012166	A	6	6	5419	5424	100 %	0 %	0 %	0 %	224984018
50	NC_012166	T	6	6	5514	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	224984018
51	NC_012166	T	6	6	5686	5691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012166	T	6	6	5701	5706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012166	T	6	6	5825	5830	0 %	100 %	0 %	0 %	224984019
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55	NC_012166	A	7	7	5963	5969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012166	A	7	7	5990	5996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012166	A	6	6	6029	6034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012166	A	7	7	6194	6200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012166	T	6	6	6252	6257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012166	T	6	6	6329	6334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012166	G	7	7	6665	6671	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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64	NC_012166	T	6	6	6831	6836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_012166	T	7	7	7444	7450	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
70	NC_012166	T	6	6	7464	7469	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
71	NC_012166	A	6	6	7470	7475	100 %	0 %	0 %	0 %	224984021
72	NC_012166	T	6	6	7851	7856	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
73	NC_012166	A	6	6	7880	7885	100 %	0 %	0 %	0 %	224984021
74	NC_012166	T	6	6	7914	7919	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
75	NC_012166	A	6	6	7994	7999	100 %	0 %	0 %	0 %	224984021
76	NC_012166	T	6	6	8000	8005	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
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89	NC_012166	A	6	6	9430	9435	100 %	0 %	0 %	0 %	224984024
90	NC_012166	T	7	7	9597	9603	0 %	100 %	0 %	0 %	224984024
91	NC_012166	A	7	7	10119	10125	100 %	0 %	0 %	0 %	224984025
92	NC_012166	T	8	8	10333	10340	0 %	100 %	0 %	0 %	224984026
93	NC_012166	A	7	7	10355	10361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012166	T	6	6	10467	10472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012166	A	6	6	10811	10816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_012166	A	6	6	11089	11094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_012166	A	6	6	11765	11770	100 %	0 %	0 %	0 %	224984031
104	NC_012166	A	6	6	12025	12030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012166	A	6	6	12132	12137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_012166	A	7	7	12228	12234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012166	A	6	6	12254	12259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012166	A	7	7	12270	12276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012166	A	6	6	12299	12304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_012166	A	7	7	12984	12990	100 %	0 %	0 %	0 %	224984033
113	NC_012166	T	7	7	12992	12998	0 %	100 %	0 %	0 %	224984033
114	NC_012166	A	10	10	13086	13095	100 %	0 %	0 %	0 %	224984033
115	NC_012166	A	6	6	13314	13319	100 %	0 %	0 %	0 %	224984033
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117	NC_012166	A	6	6	13744	13749	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
118	NC_012166	A	6	6	13857	13862	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
119	NC_012166	A	6	6	13912	13917	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
120	NC_012166	A	7	7	13944	13950	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
121	NC_012166	A	6	6	14068	14073	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
122	NC_012166	A	6	6	14115	14120	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
123	NC_012166	A	6	6	14180	14185	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
124	NC_012166	A	6	6	14199	14204	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
125	NC_012166	A	7	7	14246	14252	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
126	NC_012166	A	6	6	14282	14287	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
127	NC_012166	A	6	6	14302	14307	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
128	NC_012166	A	6	6	14337	14342	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
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133	NC_012166	A	6	6	14622	14627	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
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136	NC_012166	A	6	6	14916	14921	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
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139	NC_012166	A	6	6	15305	15310	100 %	0 %	0 %	0 %	224984036
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150	NC_012166	A	6	6	16801	16806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.