MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	T	6	6	26	31	0 %	100 %	0 %	0 %	224984010
2	NC_012166	A	6	6	735	740	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
3	NC_012166	T	7	7	904	910	0 %	100 %	0 %	0 %	224984011
4	NC_012166	A	8	8	922	929	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
5	NC_012166	A	7	7	2135	2141	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
6	NC_012166	T	7	7	2143	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	224984013
7	NC_012166	A	9	9	2237	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
8	NC_012166	A	9	9	2711	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
9	NC_012166	A	6	6	2906	2911	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
10	NC_012166	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
11	NC_012166	A	6	6	3074	3079	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
12	NC_012166	A	7	7	3106	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
13	NC_012166	A	6	6	3230	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
14	NC_012166	A	6	6	3277	3282	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
15	NC_012166	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
16	NC_012166	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
17	NC_012166	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
18	NC_012166	A	6	6	3444	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
19	NC_012166	A	6	6	3464	3469	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
20	NC_012166	A	6	6	3499	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
21	NC_012166	A	7	7	3594	3600	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
22	NC_012166	A	7	7	3611	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
23	NC_012166	A	6	6	3675	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
24	NC_012166	A	9	9	3736	3744	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
25	NC_012166	A	6	6	3784	3789	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
26	NC_012166	A	8	8	3865	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
27	NC_012166	A	7	7	3908	3914	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
28	NC_012166	A	6	6	4078	4083	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
29	NC_012166	A	6	6	4144	4149	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
30	NC_012166	A	8	8	4437	4444	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
31	NC_012166	A	6	6	4467	4472	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
32	NC_012166	T	6	6	4543	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	224984017
33	NC_012166	A	8	8	4803	4810	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
34	NC_012166	T	6	6	4856	4861	0 %	100 %	0 %	0 %	224984017
35	NC_012166	A	6	6	4962	4967	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
36	NC_012166	A	6	6	5076	5081	100 %	0 %	0 %	0 %	224984018
37	NC_012166	A	6	6	5419	5424	100 %	0 %	0 %	0 %	224984018
38	NC_012166	T	6	6	5514	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	224984018
39	NC_012166	T	6	6	5825	5830	0 %	100 %	0 %	0 %	224984019
40	NC_012166	A	8	8	5864	5871	100 %	0 %	0 %	0 %	224984019
41	NC_012166	T	6	6	6940	6945	0 %	100 %	0 %	0 %	224984020
42	NC_012166	T	6	6	7215	7220	0 %	100 %	0 %	0 %	224984020
43	NC_012166	A	6	6	7244	7249	100 %	0 %	0 %	0 %	224984020
44	NC_012166	T	7	7	7444	7450	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
45	NC_012166	T	6	6	7464	7469	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
46	NC_012166	A	6	6	7470	7475	100 %	0 %	0 %	0 %	224984021
47	NC_012166	T	6	6	7851	7856	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
48	NC_012166	A	6	6	7880	7885	100 %	0 %	0 %	0 %	224984021
49	NC_012166	T	6	6	7914	7919	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
50	NC_012166	A	6	6	7994	7999	100 %	0 %	0 %	0 %	224984021
51	NC_012166	T	6	6	8000	8005	0 %	100 %	0 %	0 %	224984021
52	NC_012166	T	7	7	8236	8242	0 %	100 %	0 %	0 %	224984022
53	NC_012166	A	6	6	8863	8868	100 %	0 %	0 %	0 %	224984024
54	NC_012166	T	6	6	9209	9214	0 %	100 %	0 %	0 %	224984024
55	NC_012166	T	6	6	9374	9379	0 %	100 %	0 %	0 %	224984024
56	NC_012166	A	6	6	9430	9435	100 %	0 %	0 %	0 %	224984024
57	NC_012166	T	7	7	9597	9603	0 %	100 %	0 %	0 %	224984024
58	NC_012166	A	7	7	10119	10125	100 %	0 %	0 %	0 %	224984025
59	NC_012166	T	8	8	10333	10340	0 %	100 %	0 %	0 %	224984026
60	NC_012166	A	6	6	10984	10989	100 %	0 %	0 %	0 %	224984027
61	NC_012166	A	6	6	11178	11183	100 %	0 %	0 %	0 %	224984028
62	NC_012166	A	6	6	11234	11239	100 %	0 %	0 %	0 %	224984028
63	NC_012166	T	6	6	11434	11439	0 %	100 %	0 %	0 %	224984029
64	NC_012166	A	6	6	11578	11583	100 %	0 %	0 %	0 %	224984030
65	NC_012166	T	7	7	11747	11753	0 %	100 %	0 %	0 %	224984031
66	NC_012166	A	6	6	11765	11770	100 %	0 %	0 %	0 %	224984031
67	NC_012166	A	6	6	12467	12472	100 %	0 %	0 %	0 %	224984032
68	NC_012166	A	7	7	12984	12990	100 %	0 %	0 %	0 %	224984033
69	NC_012166	T	7	7	12992	12998	0 %	100 %	0 %	0 %	224984033
70	NC_012166	A	10	10	13086	13095	100 %	0 %	0 %	0 %	224984033
71	NC_012166	A	6	6	13314	13319	100 %	0 %	0 %	0 %	224984033
72	NC_012166	A	9	9	13549	13557	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
73	NC_012166	A	6	6	13744	13749	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
74	NC_012166	A	6	6	13857	13862	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
75	NC_012166	A	6	6	13912	13917	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
76	NC_012166	A	7	7	13944	13950	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
77	NC_012166	A	6	6	14068	14073	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
78	NC_012166	A	6	6	14115	14120	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
79	NC_012166	A	6	6	14180	14185	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
80	NC_012166	A	6	6	14199	14204	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
81	NC_012166	A	7	7	14246	14252	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
82	NC_012166	A	6	6	14282	14287	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
83	NC_012166	A	6	6	14302	14307	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
84	NC_012166	A	6	6	14337	14342	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
85	NC_012166	A	7	7	14432	14438	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
86	NC_012166	A	7	7	14449	14455	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
87	NC_012166	A	6	6	14513	14518	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
88	NC_012166	A	9	9	14574	14582	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
89	NC_012166	A	6	6	14622	14627	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
90	NC_012166	A	8	8	14703	14710	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
91	NC_012166	A	7	7	14746	14752	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
92	NC_012166	A	6	6	14916	14921	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
93	NC_012166	A	6	6	14982	14987	100 %	0 %	0 %	0 %	224984035
94	NC_012166	A	8	8	15275	15282	100 %	0 %	0 %	0 %	224984036
95	NC_012166	A	6	6	15305	15310	100 %	0 %	0 %	0 %	224984036
96	NC_012166	T	6	6	15381	15386	0 %	100 %	0 %	0 %	224984036
97	NC_012166	T	6	6	15694	15699	0 %	100 %	0 %	0 %	224984036
98	NC_012166	A	6	6	15800	15805	100 %	0 %	0 %	0 %	224984036
99	NC_012166	A	6	6	15914	15919	100 %	0 %	0 %	0 %	224984037
100	NC_012166	A	6	6	16257	16262	100 %	0 %	0 %	0 %	224984037
101	NC_012166	T	6	6	16352	16357	0 %	100 %	0 %	0 %	224984037
102	NC_012166	A	6	6	16380	16385	100 %	0 %	0 %	0 %	224984037
103	NC_012166	T	6	6	16539	16544	0 %	100 %	0 %	0 %	224984038
104	NC_012166	T	7	7	16577	16583	0 %	100 %	0 %	0 %	224984038
105	NC_012166	T	6	6	17776	17781	0 %	100 %	0 %	0 %	224984039
106	NC_012166	T	6	6	18053	18058	0 %	100 %	0 %	0 %	224984040
107	NC_012166	A	6	6	18082	18087	100 %	0 %	0 %	0 %	224984040
108	NC_012166	T	7	7	18282	18288	0 %	100 %	0 %	0 %	224984041
109	NC_012166	T	6	6	18302	18307	0 %	100 %	0 %	0 %	224984041
110	NC_012166	A	6	6	18308	18313	100 %	0 %	0 %	0 %	224984041
111	NC_012166	T	6	6	18689	18694	0 %	100 %	0 %	0 %	224984041
112	NC_012166	A	6	6	18718	18723	100 %	0 %	0 %	0 %	224984041
113	NC_012166	T	6	6	18752	18757	0 %	100 %	0 %	0 %	224984041
114	NC_012166	A	6	6	18832	18837	100 %	0 %	0 %	0 %	224984041
115	NC_012166	T	6	6	18838	18843	0 %	100 %	0 %	0 %	224984041
116	NC_012166	T	6	6	19027	19032	0 %	100 %	0 %	0 %	224984042
117	NC_012166	T	7	7	19043	19049	0 %	100 %	0 %	0 %	224984042
118	NC_012166	T	8	8	19071	19078	0 %	100 %	0 %	0 %	224984042
119	NC_012166	A	6	6	19696	19701	100 %	0 %	0 %	0 %	224984044
120	NC_012166	A	6	6	19710	19715	100 %	0 %	0 %	0 %	224984044
121	NC_012166	T	6	6	20042	20047	0 %	100 %	0 %	0 %	224984044
122	NC_012166	T	6	6	20207	20212	0 %	100 %	0 %	0 %	224984044
123	NC_012166	A	6	6	20263	20268	100 %	0 %	0 %	0 %	224984044
124	NC_012166	T	7	7	20430	20436	0 %	100 %	0 %	0 %	224984044
125	NC_012166	A	7	7	20959	20965	100 %	0 %	0 %	0 %	224984045
126	NC_012166	A	6	6	21585	21590	100 %	0 %	0 %	0 %	224984047
127	NC_012166	A	6	6	21848	21853	100 %	0 %	0 %	0 %	224984048
128	NC_012166	A	6	6	22004	22009	100 %	0 %	0 %	0 %	224984049
129	NC_012166	A	6	6	22157	22162	100 %	0 %	0 %	0 %	224984049
130	NC_012166	T	8	8	22445	22452	0 %	100 %	0 %	0 %	224984050
131	NC_012166	T	6	6	22570	22575	0 %	100 %	0 %	0 %	224984050
132	NC_012166	A	6	6	22749	22754	100 %	0 %	0 %	0 %	224984050
133	NC_012166	A	7	7	23928	23934	100 %	0 %	0 %	0 %	224984053
134	NC_012166	T	8	8	24169	24176	0 %	100 %	0 %	0 %	224984054
135	NC_012166	A	8	8	24177	24184	100 %	0 %	0 %	0 %	224984054
136	NC_012166	A	6	6	24231	24236	100 %	0 %	0 %	0 %	224984054
137	NC_012166	A	8	8	24395	24402	100 %	0 %	0 %	0 %	224984055
138	NC_012166	A	6	6	24561	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	224984055
139	NC_012166	T	6	6	24726	24731	0 %	100 %	0 %	0 %	224984055
140	NC_012166	A	8	8	25037	25044	100 %	0 %	0 %	0 %	224984055
141	NC_012166	A	8	8	25089	25096	100 %	0 %	0 %	0 %	224984055
142	NC_012166	A	7	7	25109	25115	100 %	0 %	0 %	0 %	224984055
143	NC_012166	T	7	7	25730	25736	0 %	100 %	0 %	0 %	224984056
144	NC_012166	A	7	7	25750	25756	100 %	0 %	0 %	0 %	224984056
145	NC_012166	T	6	6	25943	25948	0 %	100 %	0 %	0 %	224984056
146	NC_012166	T	6	6	25994	25999	0 %	100 %	0 %	0 %	224984056
147	NC_012166	T	7	7	26003	26009	0 %	100 %	0 %	0 %	224984056
148	NC_012166	T	7	7	26075	26081	0 %	100 %	0 %	0 %	224984056
149	NC_012166	T	7	7	26814	26820	0 %	100 %	0 %	0 %	224984059
150	NC_012166	T	6	6	26887	26892	0 %	100 %	0 %	0 %	224984059
151	NC_012166	T	6	6	26944	26949	0 %	100 %	0 %	0 %	224984059
152	NC_012166	A	6	6	26994	26999	100 %	0 %	0 %	0 %	224984059
153	NC_012166	T	6	6	27125	27130	0 %	100 %	0 %	0 %	224984060
154	NC_012166	T	6	6	27425	27430	0 %	100 %	0 %	0 %	224984061
155	NC_012166	T	7	7	27661	27667	0 %	100 %	0 %	0 %	224984061
156	NC_012166	T	8	8	27711	27718	0 %	100 %	0 %	0 %	224984061
157	NC_012166	T	9	9	27909	27917	0 %	100 %	0 %	0 %	224984061
158	NC_012166	T	6	6	27932	27937	0 %	100 %	0 %	0 %	224984061
159	NC_012166	T	6	6	28061	28066	0 %	100 %	0 %	0 %	224984061
160	NC_012166	A	7	7	28076	28082	100 %	0 %	0 %	0 %	224984061
161	NC_012166	T	8	8	28170	28177	0 %	100 %	0 %	0 %	224984061
162	NC_012166	A	6	6	28304	28309	100 %	0 %	0 %	0 %	224984061
163	NC_012166	T	7	7	28659	28665	0 %	100 %	0 %	0 %	224984063
164	NC_012166	A	6	6	28675	28680	100 %	0 %	0 %	0 %	224984063
165	NC_012166	A	6	6	28804	28809	100 %	0 %	0 %	0 %	224984063
166	NC_012166	A	8	8	28824	28831	100 %	0 %	0 %	0 %	224984063
167	NC_012166	A	8	8	29056	29063	100 %	0 %	0 %	0 %	224984064
168	NC_012166	A	6	6	29066	29071	100 %	0 %	0 %	0 %	224984064
169	NC_012166	T	8	8	29458	29465	0 %	100 %	0 %	0 %	224984065
170	NC_012166	T	6	6	29800	29805	0 %	100 %	0 %	0 %	224984066
171	NC_012166	A	6	6	30024	30029	100 %	0 %	0 %	0 %	224984067
172	NC_012166	T	7	7	30095	30101	0 %	100 %	0 %	0 %	224984067
173	NC_012166	T	6	6	30176	30181	0 %	100 %	0 %	0 %	224984067
174	NC_012166	A	6	6	30659	30664	100 %	0 %	0 %	0 %	224984068
175	NC_012166	A	6	6	31285	31290	100 %	0 %	0 %	0 %	224984069
176	NC_012166	T	8	8	31440	31447	0 %	100 %	0 %	0 %	224984069
177	NC_012166	A	7	7	31520	31526	100 %	0 %	0 %	0 %	224984069
178	NC_012166	A	8	8	31716	31723	100 %	0 %	0 %	0 %	224984070
179	NC_012166	A	6	6	31883	31888	100 %	0 %	0 %	0 %	224984071
180	NC_012166	T	6	6	32029	32034	0 %	100 %	0 %	0 %	224984071

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.