MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	TTGACT	2	12	417	428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	224586581
2	NC_012133	GCTTTG	2	12	941	952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	224586581
3	NC_012133	TGAAAA	2	12	1317	1328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224586601
4	NC_012133	TTGAAG	2	12	2272	2283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
5	NC_012133	TTAGAA	2	12	2646	2657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224586592
6	NC_012133	ATGTTG	2	12	2983	2994	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224586592
7	NC_012133	TGAATT	2	12	5224	5235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224586600
8	NC_012133	TGAACT	2	12	5263	5274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224586600
9	NC_012133	GAAAAA	2	12	6936	6947	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224586611
10	NC_012133	AGCTGA	2	12	8213	8224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224586610
11	NC_012133	CAAAAA	2	12	12494	12505	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	224586589
12	NC_012133	ATGGCA	2	12	15298	15309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224586604
13	NC_012133	TAAAAA	2	12	19944	19955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224586593
14	NC_012133	TTAAAA	2	12	22865	22876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586596
15	NC_012133	TTAAGA	2	12	23408	23419	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224586599
16	NC_012133	TACTGA	2	12	25429	25440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224586590

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.