MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	AGTTT	2	10	2239	2248	20 %	60 %	20 %	0 %	224586606
2	NC_012133	CAATT	2	10	3487	3496	40 %	40 %	0 %	20 %	224586577
3	NC_012133	TACTT	2	10	5761	5770	20 %	60 %	0 %	20 %	224586576
4	NC_012133	TAATA	2	10	6319	6328	60 %	40 %	0 %	0 %	224586613
5	NC_012133	TATGC	2	10	6491	6500	20 %	40 %	20 %	20 %	224586613
6	NC_012133	AAAAC	2	10	8333	8342	80 %	0 %	0 %	20 %	224586612
7	NC_012133	GCAAG	2	10	9631	9640	40 %	0 %	40 %	20 %	224586585
8	NC_012133	CATAT	2	10	11625	11634	40 %	40 %	0 %	20 %	224586586
9	NC_012133	AATCT	2	10	12186	12195	40 %	40 %	0 %	20 %	224586588
10	NC_012133	ACAAT	2	10	12220	12229	60 %	20 %	0 %	20 %	224586588
11	NC_012133	GACTA	2	10	12561	12570	40 %	20 %	20 %	20 %	224586589
12	NC_012133	ATTCA	2	10	13236	13245	40 %	40 %	0 %	20 %	224586603
13	NC_012133	GAAAA	2	10	13281	13290	80 %	0 %	20 %	0 %	224586603
14	NC_012133	AAAGT	2	10	13303	13312	60 %	20 %	20 %	0 %	224586603
15	NC_012133	AGAAA	2	10	14069	14078	80 %	0 %	20 %	0 %	224586608
16	NC_012133	TAAAA	2	10	14576	14585	80 %	20 %	0 %	0 %	224586595
17	NC_012133	TAATA	2	10	14864	14873	60 %	40 %	0 %	0 %	224586595
18	NC_012133	TTATG	2	10	16144	16153	20 %	60 %	20 %	0 %	224586587
19	NC_012133	AAACA	2	10	16171	16180	80 %	0 %	0 %	20 %	224586587
20	NC_012133	CACTT	2	10	16943	16952	20 %	40 %	0 %	40 %	224586609
21	NC_012133	TAAAA	2	10	18602	18611	80 %	20 %	0 %	0 %	224586584
22	NC_012133	AATTG	2	10	18629	18638	40 %	40 %	20 %	0 %	224586584
23	NC_012133	TTTTA	2	10	23298	23307	20 %	80 %	0 %	0 %	224586599
24	NC_012133	GAAAA	2	10	25258	25267	80 %	0 %	20 %	0 %	224586590

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.