MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	TATC	2	8	1260	1267	25 %	50 %	0 %	25 %	224586581
2	NC_012133	AATT	2	8	1902	1909	50 %	50 %	0 %	0 %	224586601
3	NC_012133	GTAA	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	224586601
4	NC_012133	CAAG	2	8	2688	2695	50 %	0 %	25 %	25 %	224586592
5	NC_012133	ATGT	2	8	3028	3035	25 %	50 %	25 %	0 %	224586592
6	NC_012133	CAAT	2	8	3217	3224	50 %	25 %	0 %	25 %	224586592
7	NC_012133	TCAT	2	8	4864	4871	25 %	50 %	0 %	25 %	224586597
8	NC_012133	TTGC	2	8	4895	4902	0 %	50 %	25 %	25 %	224586597
9	NC_012133	CAAA	2	8	4933	4940	75 %	0 %	0 %	25 %	224586597
10	NC_012133	CAAA	2	8	5331	5338	75 %	0 %	0 %	25 %	224586600
11	NC_012133	TAAA	2	8	6567	6574	75 %	25 %	0 %	0 %	224586613
12	NC_012133	GATT	2	8	6618	6625	25 %	50 %	25 %	0 %	224586613
13	NC_012133	ACTA	2	8	7124	7131	50 %	25 %	0 %	25 %	224586611
14	NC_012133	TTAT	2	8	7258	7265	25 %	75 %	0 %	0 %	224586611
15	NC_012133	GATT	2	8	7678	7685	25 %	50 %	25 %	0 %	224586611
16	NC_012133	TTAC	2	8	7756	7763	25 %	50 %	0 %	25 %	224586611
17	NC_012133	ACTA	2	8	8169	8176	50 %	25 %	0 %	25 %	224586610
18	NC_012133	TCAA	2	8	8399	8406	50 %	25 %	0 %	25 %	224586612
19	NC_012133	TTAC	2	8	8707	8714	25 %	50 %	0 %	25 %	224586612
20	NC_012133	GTTG	2	8	8819	8826	0 %	50 %	50 %	0 %	224586578
21	NC_012133	AATA	2	8	8841	8848	75 %	25 %	0 %	0 %	224586578
22	NC_012133	TCAA	2	8	8923	8930	50 %	25 %	0 %	25 %	224586578
23	NC_012133	AATT	2	8	8965	8972	50 %	50 %	0 %	0 %	224586578
24	NC_012133	AAGA	2	8	9153	9160	75 %	0 %	25 %	0 %	224586585
25	NC_012133	ACAA	2	8	9510	9517	75 %	0 %	0 %	25 %	224586585
26	NC_012133	CAAA	2	8	9882	9889	75 %	0 %	0 %	25 %	224586585
27	NC_012133	TAAT	2	8	10886	10893	50 %	50 %	0 %	0 %	224586579
28	NC_012133	CAAA	2	8	12030	12037	75 %	0 %	0 %	25 %	224586588
29	NC_012133	TTTA	2	8	12377	12384	25 %	75 %	0 %	0 %	224586588
30	NC_012133	ATTG	2	8	12900	12907	25 %	50 %	25 %	0 %	224586603
31	NC_012133	TAAT	2	8	12917	12924	50 %	50 %	0 %	0 %	224586603
32	NC_012133	AAAC	2	8	13999	14006	75 %	0 %	0 %	25 %	224586608
33	NC_012133	ATTT	2	8	14015	14022	25 %	75 %	0 %	0 %	224586608
34	NC_012133	AGGA	2	8	15640	15647	50 %	0 %	50 %	0 %	224586598
35	NC_012133	TATT	2	8	16022	16029	25 %	75 %	0 %	0 %	224586587
36	NC_012133	ATTC	2	8	17300	17307	25 %	50 %	0 %	25 %	224586609
37	NC_012133	ATTT	2	8	17333	17340	25 %	75 %	0 %	0 %	224586609
38	NC_012133	AACT	2	8	18005	18012	50 %	25 %	0 %	25 %	224586584
39	NC_012133	TAAA	2	8	18415	18422	75 %	25 %	0 %	0 %	224586584
40	NC_012133	AAAT	2	8	18770	18777	75 %	25 %	0 %	0 %	224586584
41	NC_012133	AATA	2	8	18890	18897	75 %	25 %	0 %	0 %	224586607
42	NC_012133	TCAA	3	12	19084	19095	50 %	25 %	0 %	25 %	224586607
43	NC_012133	GATA	2	8	19543	19550	50 %	25 %	25 %	0 %	224586593
44	NC_012133	TAAA	2	8	20070	20077	75 %	25 %	0 %	0 %	224586593
45	NC_012133	TATG	2	8	20158	20165	25 %	50 %	25 %	0 %	224586593
46	NC_012133	AGGG	2	8	20258	20265	25 %	0 %	75 %	0 %	224586582
47	NC_012133	AATT	2	8	20935	20942	50 %	50 %	0 %	0 %	224586580
48	NC_012133	AGAT	2	8	20989	20996	50 %	25 %	25 %	0 %	224586580
49	NC_012133	AGAT	2	8	21022	21029	50 %	25 %	25 %	0 %	224586580
50	NC_012133	AGAT	2	8	21055	21062	50 %	25 %	25 %	0 %	224586580
51	NC_012133	AGAT	2	8	21088	21095	50 %	25 %	25 %	0 %	224586580
52	NC_012133	AGAT	2	8	21196	21203	50 %	25 %	25 %	0 %	224586580
53	NC_012133	AGAT	2	8	21271	21278	50 %	25 %	25 %	0 %	224586580
54	NC_012133	AGAT	2	8	21325	21332	50 %	25 %	25 %	0 %	224586580
55	NC_012133	CATT	2	8	21426	21433	25 %	50 %	0 %	25 %	224586580
56	NC_012133	TAAT	2	8	21462	21469	50 %	50 %	0 %	0 %	224586580
57	NC_012133	AAAT	2	8	21776	21783	75 %	25 %	0 %	0 %	224586596
58	NC_012133	AAAC	2	8	21963	21970	75 %	0 %	0 %	25 %	224586596
59	NC_012133	GATG	2	8	22261	22268	25 %	25 %	50 %	0 %	224586596
60	NC_012133	TAAA	2	8	22811	22818	75 %	25 %	0 %	0 %	224586596
61	NC_012133	AATA	2	8	22891	22898	75 %	25 %	0 %	0 %	224586596
62	NC_012133	TAAT	2	8	22904	22911	50 %	50 %	0 %	0 %	224586596
63	NC_012133	AGAT	2	8	22974	22981	50 %	25 %	25 %	0 %	224586596
64	NC_012133	ATTT	2	8	23726	23733	25 %	75 %	0 %	0 %	224586591
65	NC_012133	AACC	2	8	24079	24086	50 %	0 %	0 %	50 %	224586591
66	NC_012133	AAAG	2	8	25036	25043	75 %	0 %	25 %	0 %	224586590
67	NC_012133	TAAA	2	8	26199	26206	75 %	25 %	0 %	0 %	224586605
68	NC_012133	CAAA	2	8	26392	26399	75 %	0 %	0 %	25 %	224586602
69	NC_012133	AATT	2	8	26481	26488	50 %	50 %	0 %	0 %	224586602
70	NC_012133	TGAT	2	8	26795	26802	25 %	50 %	25 %	0 %	224586602
71	NC_012133	ATAC	2	8	27022	27029	50 %	25 %	0 %	25 %	224586602
72	NC_012133	TTAC	2	8	27548	27555	25 %	50 %	0 %	25 %	224586602

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.