MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	TTA	2	6	29	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012133	ATT	2	6	44	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012133	TAA	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012133	AAG	2	6	56	61	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012133	TAG	2	6	93	98	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586581
6	NC_012133	AGA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586581
7	NC_012133	TAT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
8	NC_012133	AAT	3	9	452	460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
9	NC_012133	CTT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586581
10	NC_012133	TAA	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
11	NC_012133	TCT	2	6	749	754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586581
12	NC_012133	TAA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
13	NC_012133	TTA	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
14	NC_012133	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
15	NC_012133	ATG	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586581
16	NC_012133	ATT	2	6	1053	1058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
17	NC_012133	AGC	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586581
18	NC_012133	TAA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
19	NC_012133	GGA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586581
20	NC_012133	ATT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
21	NC_012133	GAA	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
22	NC_012133	AGA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
23	NC_012133	ATA	2	6	1439	1444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586601
24	NC_012133	ATT	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586601
25	NC_012133	AGC	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586601
26	NC_012133	TAA	2	6	1608	1613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586601
27	NC_012133	ACT	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586601
28	NC_012133	AAC	2	6	1760	1765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586601
29	NC_012133	TTC	3	9	1818	1826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586601
30	NC_012133	TTA	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586601
31	NC_012133	TTG	2	6	1850	1855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586601
32	NC_012133	AGA	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
33	NC_012133	TGA	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
34	NC_012133	CAA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586606
35	NC_012133	TAG	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
36	NC_012133	GTG	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586606
37	NC_012133	AAG	2	6	2391	2396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586606
38	NC_012133	AGA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586606
39	NC_012133	ATA	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586592
40	NC_012133	GCT	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586592
41	NC_012133	ATG	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
42	NC_012133	TGA	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
43	NC_012133	TAG	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
44	NC_012133	GTT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586592
45	NC_012133	AGA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586592
46	NC_012133	ATC	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586592
47	NC_012133	ATC	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586592
48	NC_012133	ATT	2	6	3280	3285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586592
49	NC_012133	AGA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012133	AGG	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012133	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586577
52	NC_012133	AGT	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
53	NC_012133	CAG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586577
54	NC_012133	ATC	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586577
55	NC_012133	GTG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586577
56	NC_012133	GAT	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
57	NC_012133	CTA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586577
58	NC_012133	TAA	2	6	3745	3750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586577
59	NC_012133	ATG	3	9	3903	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
60	NC_012133	AGT	3	9	3925	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
61	NC_012133	ATT	2	6	3991	3996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
62	NC_012133	TGA	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
63	NC_012133	ATT	2	6	4005	4010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
64	NC_012133	ACA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586597
65	NC_012133	AGT	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
66	NC_012133	ATT	2	6	4224	4229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
67	NC_012133	TAA	3	9	4309	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586597
68	NC_012133	AGC	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586597
69	NC_012133	TTA	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
70	NC_012133	CTT	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586597
71	NC_012133	AGA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586597
72	NC_012133	ATG	2	6	4586	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
73	NC_012133	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586597
74	NC_012133	TAA	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586597
75	NC_012133	GAA	3	9	5003	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586600
76	NC_012133	TTA	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586600
77	NC_012133	GTT	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586600
78	NC_012133	ATT	2	6	5277	5282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586600
79	NC_012133	GGT	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586600
80	NC_012133	CAT	2	6	5397	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586600
81	NC_012133	GAC	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586576
82	NC_012133	CAA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586576
83	NC_012133	TTA	2	6	5585	5590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586576
84	NC_012133	CAA	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586583
85	NC_012133	GTA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586583
86	NC_012133	TTG	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586583
87	NC_012133	AAT	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586613
88	NC_012133	GTA	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586613
89	NC_012133	TTC	2	6	6661	6666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586613
90	NC_012133	ATT	2	6	6784	6789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586611
91	NC_012133	AGC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586611
92	NC_012133	TAA	2	6	6830	6835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
93	NC_012133	ATG	2	6	6841	6846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586611
94	NC_012133	TAA	2	6	6872	6877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
95	NC_012133	AAC	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586611
96	NC_012133	ACT	2	6	6950	6955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586611
97	NC_012133	TGT	2	6	7079	7084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586611
98	NC_012133	TTA	2	6	7087	7092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586611
99	NC_012133	GAT	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586611
100	NC_012133	AGA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586611
101	NC_012133	TAA	2	6	7148	7153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
102	NC_012133	AGA	2	6	7193	7198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586611
103	NC_012133	AAT	2	6	7218	7223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
104	NC_012133	TGA	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586611
105	NC_012133	CTT	2	6	7431	7436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586611
106	NC_012133	AAG	2	6	7471	7476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586611
107	NC_012133	ATT	2	6	7542	7547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586611
108	NC_012133	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586610
109	NC_012133	ATT	2	6	8163	8168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586610
110	NC_012133	GAA	2	6	8190	8195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586610
111	NC_012133	AAG	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586610
112	NC_012133	TTA	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586612
113	NC_012133	TTG	2	6	8546	8551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586612
114	NC_012133	TAT	2	6	8553	8558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586612
115	NC_012133	TTA	2	6	8654	8659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586612
116	NC_012133	AAT	2	6	8858	8863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586578
117	NC_012133	GCA	2	6	9039	9044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586585
118	NC_012133	GTA	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586585
119	NC_012133	TTA	2	6	9144	9149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586585
120	NC_012133	CTT	2	6	9525	9530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586585
121	NC_012133	AAT	2	6	9531	9536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586585
122	NC_012133	AGA	2	6	9617	9622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586585
123	NC_012133	CTG	2	6	9763	9768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586585
124	NC_012133	TGA	2	6	9770	9775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586585
125	NC_012133	GAA	2	6	9854	9859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586585
126	NC_012133	GAA	2	6	10002	10007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586585
127	NC_012133	AGT	2	6	10187	10192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586585
128	NC_012133	TAA	2	6	10193	10198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586585
129	NC_012133	CGG	2	6	10244	10249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586585
130	NC_012133	ATA	3	9	10261	10269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586585
131	NC_012133	ATT	2	6	10300	10305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012133	TAA	2	6	10315	10320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586579
133	NC_012133	AAC	2	6	10366	10371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586579
134	NC_012133	ATT	2	6	10456	10461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586579
135	NC_012133	TTA	2	6	10527	10532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586579
136	NC_012133	TAT	2	6	10535	10540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586579
137	NC_012133	CTT	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586579
138	NC_012133	AAC	2	6	10704	10709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586579
139	NC_012133	TGA	2	6	10819	10824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586579
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142	NC_012133	CAA	2	6	11113	11118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586586
143	NC_012133	TGG	2	6	11230	11235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586586
144	NC_012133	CTT	2	6	11281	11286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586586
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151	NC_012133	TAC	2	6	12085	12090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586588
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161	NC_012133	TAA	2	6	12598	12603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586589
162	NC_012133	ACA	2	6	12677	12682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586589
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164	NC_012133	TGA	2	6	12852	12857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586603
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166	NC_012133	ATT	2	6	12880	12885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586603
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172	NC_012133	ATG	2	6	13565	13570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586603
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231	NC_012133	TTG	2	6	17669	17674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
232	NC_012133	TAA	2	6	17679	17684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_012133	ATA	2	6	18214	18219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586584
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252	NC_012133	ATG	2	6	19014	19019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586607
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255	NC_012133	TAT	2	6	19239	19244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586607
256	NC_012133	ATA	2	6	19431	19436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586607
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258	NC_012133	GGT	2	6	19472	19477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586593
259	NC_012133	TAT	2	6	19498	19503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586593
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263	NC_012133	ATT	2	6	19918	19923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586593
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267	NC_012133	TAC	2	6	20418	20423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586582
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.