MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	TA	4	8	33	40	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012133	TG	3	6	69	74	0 %	50 %	50 %	0 %	224586581
3	NC_012133	TA	3	6	120	125	50 %	50 %	0 %	0 %	224586581
4	NC_012133	AC	3	6	327	332	50 %	0 %	0 %	50 %	224586581
5	NC_012133	AT	3	6	506	511	50 %	50 %	0 %	0 %	224586581
6	NC_012133	CT	3	6	677	682	0 %	50 %	0 %	50 %	224586581
7	NC_012133	TA	3	6	1414	1419	50 %	50 %	0 %	0 %	224586601
8	NC_012133	AG	5	10	1515	1524	50 %	0 %	50 %	0 %	224586601
9	NC_012133	AG	3	6	4715	4720	50 %	0 %	50 %	0 %	224586597
10	NC_012133	AT	3	6	5633	5638	50 %	50 %	0 %	0 %	224586576
11	NC_012133	AT	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	224586583
12	NC_012133	TA	3	6	5952	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	224586583
13	NC_012133	TA	3	6	6426	6431	50 %	50 %	0 %	0 %	224586613
14	NC_012133	TA	3	6	7524	7529	50 %	50 %	0 %	0 %	224586611
15	NC_012133	AG	3	6	9195	9200	50 %	0 %	50 %	0 %	224586585
16	NC_012133	CT	3	6	9797	9802	0 %	50 %	0 %	50 %	224586585
17	NC_012133	AC	3	6	10098	10103	50 %	0 %	0 %	50 %	224586585
18	NC_012133	TA	3	6	10623	10628	50 %	50 %	0 %	0 %	224586579
19	NC_012133	AT	3	6	11144	11149	50 %	50 %	0 %	0 %	224586586
20	NC_012133	TA	3	6	11641	11646	50 %	50 %	0 %	0 %	224586586
21	NC_012133	TA	3	6	12153	12158	50 %	50 %	0 %	0 %	224586588
22	NC_012133	AT	3	6	12699	12704	50 %	50 %	0 %	0 %	224586589
23	NC_012133	TA	4	8	13090	13097	50 %	50 %	0 %	0 %	224586603
24	NC_012133	AT	3	6	13369	13374	50 %	50 %	0 %	0 %	224586603
25	NC_012133	AT	3	6	13778	13783	50 %	50 %	0 %	0 %	224586608
26	NC_012133	AT	3	6	13975	13980	50 %	50 %	0 %	0 %	224586608
27	NC_012133	CA	3	6	14890	14895	50 %	0 %	0 %	50 %	224586595
28	NC_012133	TA	4	8	14987	14994	50 %	50 %	0 %	0 %	224586595
29	NC_012133	TA	3	6	15092	15097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012133	AT	4	8	15098	15105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012133	AT	3	6	15807	15812	50 %	50 %	0 %	0 %	224586594
32	NC_012133	AT	3	6	16211	16216	50 %	50 %	0 %	0 %	224586587
33	NC_012133	AT	3	6	16477	16482	50 %	50 %	0 %	0 %	224586609
34	NC_012133	TA	3	6	16771	16776	50 %	50 %	0 %	0 %	224586609
35	NC_012133	TA	3	6	17409	17414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012133	TC	4	8	18311	18318	0 %	50 %	0 %	50 %	224586584
37	NC_012133	TA	3	6	18881	18886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012133	AT	3	6	19351	19356	50 %	50 %	0 %	0 %	224586607
39	NC_012133	AC	3	6	19554	19559	50 %	0 %	0 %	50 %	224586593
40	NC_012133	TA	4	8	20490	20497	50 %	50 %	0 %	0 %	224586582
41	NC_012133	TA	3	6	20544	20549	50 %	50 %	0 %	0 %	224586582
42	NC_012133	AT	3	6	20968	20973	50 %	50 %	0 %	0 %	224586580
43	NC_012133	AT	3	6	21443	21448	50 %	50 %	0 %	0 %	224586580
44	NC_012133	TA	3	6	21553	21558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012133	TA	3	6	21702	21707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012133	TG	3	6	21800	21805	0 %	50 %	50 %	0 %	224586596
47	NC_012133	AG	3	6	22132	22137	50 %	0 %	50 %	0 %	224586596
48	NC_012133	CA	3	6	22607	22612	50 %	0 %	0 %	50 %	224586596
49	NC_012133	GT	3	6	23210	23215	0 %	50 %	50 %	0 %	224586599
50	NC_012133	TA	3	6	23535	23540	50 %	50 %	0 %	0 %	224586599
51	NC_012133	AT	4	8	23610	23617	50 %	50 %	0 %	0 %	224586591
52	NC_012133	CA	3	6	24507	24512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012133	TG	3	6	24530	24535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012133	AT	3	6	24536	24541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012133	GA	3	6	24611	24616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012133	GA	3	6	25965	25970	50 %	0 %	50 %	0 %	224586605
57	NC_012133	AT	3	6	26787	26792	50 %	50 %	0 %	0 %	224586602
58	NC_012133	GA	3	6	27280	27285	50 %	0 %	50 %	0 %	224586602
59	NC_012133	AT	3	6	27447	27452	50 %	50 %	0 %	0 %	224586602

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.