MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	AAAAG	2	10	372	381	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012131	AGAAA	2	10	626	635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012131	TCTTT	2	10	2047	2056	0 %	80 %	0 %	20 %	224586490
4	NC_012131	AACTA	2	10	3939	3948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012131	AATTT	2	10	4031	4040	40 %	60 %	0 %	0 %	224586491
6	NC_012131	TTTAA	2	10	5214	5223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012131	CTTTT	2	10	6158	6167	0 %	80 %	0 %	20 %	224586496
8	NC_012131	AAAAT	2	10	6670	6679	80 %	20 %	0 %	0 %	224586497
9	NC_012131	TTTTA	2	10	7716	7725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012131	AATTG	2	10	10894	10903	40 %	40 %	20 %	0 %	224586505
11	NC_012131	CTACA	2	10	12937	12946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012131	AAATT	2	10	13187	13196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012131	CAATA	2	10	13465	13474	60 %	20 %	0 %	20 %	224586510
14	NC_012131	AAGTG	2	10	13575	13584	40 %	20 %	40 %	0 %	224586511
15	NC_012131	AAAGA	2	10	13691	13700	80 %	0 %	20 %	0 %	224586511
16	NC_012131	AAAGA	2	10	13715	13724	80 %	0 %	20 %	0 %	224586511
17	NC_012131	TAAAT	2	10	13977	13986	60 %	40 %	0 %	0 %	224586511
18	NC_012131	ATTTT	2	10	14293	14302	20 %	80 %	0 %	0 %	224586512
19	NC_012131	ATAAA	2	10	14909	14918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012131	ATAAA	2	10	16301	16310	80 %	20 %	0 %	0 %	224586514
21	NC_012131	ATTTA	2	10	16617	16626	40 %	60 %	0 %	0 %	224586516
22	NC_012131	TCTTT	2	10	16903	16912	0 %	80 %	0 %	20 %	224586516
23	NC_012131	CACTT	2	10	17019	17028	20 %	40 %	0 %	40 %	224586516
24	NC_012131	AATTT	2	10	17407	17416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012131	TGTAG	2	10	17656	17665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012131	ATTTT	2	10	21304	21313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012131	TAAAA	2	10	22914	22923	80 %	20 %	0 %	0 %	224586528
28	NC_012131	ATTTT	2	10	23964	23973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012131	AATTT	2	10	24295	24304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012131	AACAA	2	10	24804	24813	80 %	0 %	0 %	20 %	224586530
31	NC_012131	AAAAG	2	10	25249	25258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012131	AAAAT	2	10	26115	26124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012131	TAATT	2	10	27335	27344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.