MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	TCTTT	2	10	2047	2056	0 %	80 %	0 %	20 %	224586490
2	NC_012131	AATTT	2	10	4031	4040	40 %	60 %	0 %	0 %	224586491
3	NC_012131	CTTTT	2	10	6158	6167	0 %	80 %	0 %	20 %	224586496
4	NC_012131	AAAAT	2	10	6670	6679	80 %	20 %	0 %	0 %	224586497
5	NC_012131	AATTG	2	10	10894	10903	40 %	40 %	20 %	0 %	224586505
6	NC_012131	CAATA	2	10	13465	13474	60 %	20 %	0 %	20 %	224586510
7	NC_012131	AAGTG	2	10	13575	13584	40 %	20 %	40 %	0 %	224586511
8	NC_012131	AAAGA	2	10	13691	13700	80 %	0 %	20 %	0 %	224586511
9	NC_012131	AAAGA	2	10	13715	13724	80 %	0 %	20 %	0 %	224586511
10	NC_012131	TAAAT	2	10	13977	13986	60 %	40 %	0 %	0 %	224586511
11	NC_012131	ATTTT	2	10	14293	14302	20 %	80 %	0 %	0 %	224586512
12	NC_012131	ATAAA	2	10	16301	16310	80 %	20 %	0 %	0 %	224586514
13	NC_012131	ATTTA	2	10	16617	16626	40 %	60 %	0 %	0 %	224586516
14	NC_012131	TCTTT	2	10	16903	16912	0 %	80 %	0 %	20 %	224586516
15	NC_012131	CACTT	2	10	17019	17028	20 %	40 %	0 %	40 %	224586516
16	NC_012131	TAAAA	2	10	22914	22923	80 %	20 %	0 %	0 %	224586528
17	NC_012131	AACAA	2	10	24804	24813	80 %	0 %	0 %	20 %	224586530

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.