MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	ACAA	2	8	4889	4896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012131	TTAC	2	8	5030	5037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012131	GTTT	2	8	8862	8869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012131	ATTT	2	8	9228	9235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012131	TAAT	2	8	15318	15325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012131	GATT	2	8	15614	15621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012131	AGAT	2	8	15646	15653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012131	ATAG	2	8	15681	15688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012131	AGGT	2	8	17616	17623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012131	TAAA	2	8	20238	20245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012131	AAAT	2	8	21373	21380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012131	AAAC	2	8	21739	21746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012131	TGGC	2	8	23414	23421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012131	ATTA	2	8	24419	24426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012131	TTGT	2	8	25219	25226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012131	ATTA	2	8	25241	25248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012131	TAAG	2	8	25356	25363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012131	CAAA	2	8	25946	25953	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012131	AATT	2	8	26035	26042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012131	TTAC	2	8	26189	26196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012131	TGAT	2	8	26349	26356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012131	TTAC	2	8	27101	27108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012131	AAAG	2	8	27253	27260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.