MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012131	TAA	2	6	4167	4172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012131	ATT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012131	TAA	2	6	4640	4645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012131	ATT	2	6	4646	4651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012131	TTA	2	6	4678	4683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012131	AGC	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012131	TAC	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012131	AAT	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012131	ATT	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012131	TAA	2	6	5115	5120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012131	AAT	3	9	5122	5130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012131	CCT	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_012131	TAT	2	6	5733	5738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012131	TAA	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012131	AAC	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012131	ACA	2	6	6390	6395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012131	ATA	2	6	6399	6404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012131	TAA	2	6	6477	6482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012131	TGC	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012131	TTA	2	6	7705	7710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012131	AAT	2	6	7728	7733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012131	CCT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012131	ATT	2	6	7757	7762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012131	ATC	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012131	CAA	2	6	8187	8192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012131	TAA	2	6	8196	8201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012131	ATT	2	6	8218	8223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012131	CAT	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012131	CCT	2	6	9105	9110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012131	TTA	2	6	9192	9197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012131	TAA	2	6	9204	9209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012131	TTA	2	6	9306	9311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012131	TAC	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012131	ATT	2	6	9357	9362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012131	ATA	2	6	10373	10378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012131	CCT	2	6	12783	12788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_012131	TAA	2	6	12802	12807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012131	TAT	2	6	12812	12817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012131	ATT	2	6	12872	12877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012131	ATT	2	6	13123	13128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012131	AGG	2	6	13144	13149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012131	ATA	2	6	13172	13177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012131	TTG	2	6	14158	14163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012131	CCG	2	6	14191	14196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012131	ATA	2	6	14545	14550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012131	TGT	2	6	14701	14706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012131	ATT	3	9	14722	14730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012131	ATT	2	6	14771	14776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012131	ATT	2	6	14789	14794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012131	AGA	2	6	14819	14824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012131	TGA	3	9	14880	14888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012131	TGT	2	6	15301	15306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012131	ATT	2	6	15417	15422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012131	GAA	2	6	15459	15464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012131	TAC	2	6	15638	15643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012131	AGA	2	6	15661	15666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012131	TAA	2	6	15755	15760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012131	ATT	2	6	15764	15769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012131	AAT	2	6	15797	15802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012131	TAG	3	9	15817	15825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012131	TAT	2	6	15842	15847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012131	AAC	2	6	15848	15853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012131	TGT	2	6	15854	15859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012131	CGG	2	6	16408	16413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012131	ATT	2	6	17427	17432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012131	CCT	2	6	17454	17459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012131	AAT	2	6	17475	17480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012131	TAA	2	6	17733	17738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012131	ATT	2	6	17803	17808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012131	AGG	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012131	TTA	2	6	20229	20234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012131	AAT	2	6	20795	20800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012131	TTC	2	6	20886	20891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012131	AAT	2	6	21246	21251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012131	AGT	2	6	21273	21278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012131	ATA	2	6	21296	21301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012131	TTA	2	6	21399	21404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012131	TAA	2	6	21411	21416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012131	TAT	2	6	21435	21440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012131	ATT	2	6	21477	21482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012131	AGG	2	6	21498	21503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012131	ATA	2	6	22386	22391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012131	TTA	2	6	22407	22412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012131	TTG	2	6	22416	22421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012131	GTA	2	6	22430	22435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012131	GAG	2	6	22549	22554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012131	GGA	2	6	22890	22895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012131	AGA	2	6	23331	23336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012131	TAA	2	6	23714	23719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012131	TTA	2	6	23797	23802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012131	GTT	2	6	23848	23853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012131	ACT	2	6	23979	23984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012131	ATT	2	6	24047	24052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012131	ATA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012131	ATT	2	6	24449	24454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012131	GTT	2	6	25209	25214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012131	TAG	2	6	25340	25345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012131	TAA	2	6	25378	25383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012131	TAT	2	6	25399	25404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012131	ACA	2	6	25961	25966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012131	GAA	2	6	26054	26059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012131	AAT	2	6	26108	26113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012131	GTG	2	6	26133	26138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012131	TAA	2	6	26224	26229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012131	CTA	2	6	26447	26452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012131	AGA	2	6	26472	26477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012131	TAT	2	6	26511	26516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012131	ATT	2	6	26546	26551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012131	CTT	2	6	26620	26625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012131	AGC	2	6	26764	26769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012131	TGG	2	6	26802	26807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012131	ATA	2	6	26810	26815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012131	TGA	2	6	26841	26846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012131	TAT	2	6	26851	26856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012131	TAT	2	6	26898	26903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012131	AGA	2	6	26955	26960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012131	ATA	2	6	26966	26971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012131	AAC	2	6	27016	27021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012131	TAG	2	6	27072	27077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012131	AGT	2	6	27133	27138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012131	TCT	2	6	27139	27144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012131	ATG	3	9	27188	27196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012131	TAT	2	6	27324	27329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.