MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	GT	3	6	6	11	0 %	50 %	50 %	0 %	224586488
2	NC_012131	AC	3	6	265	270	50 %	0 %	0 %	50 %	224586488
3	NC_012131	AT	3	6	1194	1199	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
4	NC_012131	TA	3	6	1313	1318	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
5	NC_012131	TA	3	6	2312	2317	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
6	NC_012131	TA	3	6	3860	3865	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
7	NC_012131	AT	3	6	3922	3927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012131	TA	3	6	3947	3952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012131	TA	3	6	3979	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	224586491
10	NC_012131	AT	3	6	4011	4016	50 %	50 %	0 %	0 %	224586491
11	NC_012131	AT	3	6	4818	4823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012131	CT	3	6	7299	7304	0 %	50 %	0 %	50 %	224586497
13	NC_012131	AT	3	6	7566	7571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012131	CT	3	6	8692	8697	0 %	50 %	0 %	50 %	224586501
15	NC_012131	TA	3	6	9132	9137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012131	AT	3	6	9480	9485	50 %	50 %	0 %	0 %	224586503
17	NC_012131	AT	3	6	9621	9626	50 %	50 %	0 %	0 %	224586503
18	NC_012131	AT	3	6	10425	10430	50 %	50 %	0 %	0 %	224586505
19	NC_012131	AT	3	6	10911	10916	50 %	50 %	0 %	0 %	224586505
20	NC_012131	AT	4	8	10933	10940	50 %	50 %	0 %	0 %	224586505
21	NC_012131	TC	3	6	11247	11252	0 %	50 %	0 %	50 %	224586506
22	NC_012131	AT	3	6	12012	12017	50 %	50 %	0 %	0 %	224586508
23	NC_012131	GA	4	8	12235	12242	50 %	0 %	50 %	0 %	224586508
24	NC_012131	AG	3	6	13046	13051	50 %	0 %	50 %	0 %	224586509
25	NC_012131	GT	3	6	14372	14377	0 %	50 %	50 %	0 %	224586512
26	NC_012131	TA	3	6	15359	15364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012131	AT	3	6	15468	15473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012131	AT	3	6	16052	16057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012131	CT	3	6	17551	17556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012131	TC	4	8	18366	18373	0 %	50 %	0 %	50 %	224586518
31	NC_012131	TA	3	6	19669	19674	50 %	50 %	0 %	0 %	224586520
32	NC_012131	AT	3	6	19692	19697	50 %	50 %	0 %	0 %	224586520
33	NC_012131	AT	3	6	20178	20183	50 %	50 %	0 %	0 %	224586520
34	NC_012131	AT	3	6	20982	20987	50 %	50 %	0 %	0 %	224586522
35	NC_012131	AT	3	6	21123	21128	50 %	50 %	0 %	0 %	224586522
36	NC_012131	TA	3	6	21471	21476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012131	AG	3	6	21911	21916	50 %	0 %	50 %	0 %	224586524
38	NC_012131	AT	3	6	23067	23072	50 %	50 %	0 %	0 %	224586528
39	NC_012131	TA	3	6	23891	23896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012131	AT	3	6	24275	24280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012131	GT	3	6	24456	24461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012131	CT	3	6	24771	24776	0 %	50 %	0 %	50 %	224586530
43	NC_012131	AT	3	6	26001	26006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012131	AT	3	6	26341	26346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012131	GA	3	6	26833	26838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012131	AT	3	6	27000	27005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.