MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp26

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012129	TATTT	2	10	61	70	20 %	80 %	0 %	0 %	224586460
2	NC_012129	AGAAT	2	10	1077	1086	60 %	20 %	20 %	0 %	224586462
3	NC_012129	TAAAT	2	10	2269	2278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012129	TAAAA	2	10	3672	3681	80 %	20 %	0 %	0 %	224586463
5	NC_012129	TAATT	2	10	3874	3883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012129	TATAA	2	10	3960	3969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012129	TTTTA	2	10	4283	4292	20 %	80 %	0 %	0 %	224586464
8	NC_012129	TAGAC	2	10	5022	5031	40 %	20 %	20 %	20 %	224586466
9	NC_012129	GAAAA	2	10	5306	5315	80 %	0 %	20 %	0 %	224586466
10	NC_012129	TAAAA	2	10	6255	6264	80 %	20 %	0 %	0 %	224586467
11	NC_012129	ACTTT	2	10	7699	7708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012129	TTATT	2	10	8112	8121	20 %	80 %	0 %	0 %	224586469
13	NC_012129	AAATA	2	10	8493	8502	80 %	20 %	0 %	0 %	224586469
14	NC_012129	ATAAA	2	10	8570	8579	80 %	20 %	0 %	0 %	224586469
15	NC_012129	AAAGT	2	10	8682	8691	60 %	20 %	20 %	0 %	224586469
16	NC_012129	ATTAT	2	10	10503	10512	40 %	60 %	0 %	0 %	224586472
17	NC_012129	AGACA	2	10	11006	11015	60 %	0 %	20 %	20 %	224586473
18	NC_012129	ATTTA	2	10	11889	11898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012129	TATAT	2	10	11970	11979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012129	CGATT	2	10	12569	12578	20 %	40 %	20 %	20 %	224586474
21	NC_012129	GTAAA	2	10	12856	12865	60 %	20 %	20 %	0 %	224586474
22	NC_012129	TATTT	2	10	14017	14026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012129	TATGT	2	10	14273	14282	20 %	60 %	20 %	0 %	224586475
24	NC_012129	TATAA	2	10	15761	15770	60 %	40 %	0 %	0 %	224586476
25	NC_012129	AGTTT	2	10	16414	16423	20 %	60 %	20 %	0 %	224586476
26	NC_012129	AAAAT	2	10	16688	16697	80 %	20 %	0 %	0 %	224586476
27	NC_012129	TCATT	2	10	17088	17097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012129	ATTAT	2	10	17936	17945	40 %	60 %	0 %	0 %	224586478
29	NC_012129	ACAAT	2	10	19349	19358	60 %	20 %	0 %	20 %	224586479
30	NC_012129	ATTTT	2	10	19721	19730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012129	TAAAT	2	10	19790	19799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012129	TAAAT	2	10	20517	20526	60 %	40 %	0 %	0 %	224586480
33	NC_012129	ATTTT	2	10	21722	21731	20 %	80 %	0 %	0 %	224586482
34	NC_012129	TAACA	2	10	22027	22036	60 %	20 %	0 %	20 %	224586482
35	NC_012129	TTATA	2	10	22235	22244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012129	ATAAA	2	10	22842	22851	80 %	20 %	0 %	0 %	224586483
37	NC_012129	AAGAT	2	10	23165	23174	60 %	20 %	20 %	0 %	224586484
38	NC_012129	TAAAG	2	10	23562	23571	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012129	TAATT	2	10	24255	24264	40 %	60 %	0 %	0 %	224586485
40	NC_012129	AATTA	2	10	24890	24899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012129	AATTT	2	10	24949	24958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012129	AAATT	2	10	25016	25025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012129	ATTTT	2	10	26489	26498	20 %	80 %	0 %	0 %	224586486
44	NC_012129	GAAGA	2	10	26542	26551	60 %	0 %	40 %	0 %	224586486
45	NC_012129	ATAGT	2	10	26569	26578	40 %	40 %	20 %	0 %	224586486
46	NC_012129	ATATA	2	10	26842	26851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.