MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp26

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012129	AAG	2	6	33	38	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012129	AAT	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586460
3	NC_012129	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586460
4	NC_012129	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586460
5	NC_012129	TAT	2	6	319	324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586460
6	NC_012129	ATT	3	9	392	400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586461
7	NC_012129	CTG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586461
8	NC_012129	TAT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586461
9	NC_012129	TTA	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012129	ATT	2	6	861	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
11	NC_012129	ATC	2	6	974	979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586462
12	NC_012129	ATC	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586462
13	NC_012129	TAA	2	6	1136	1141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
14	NC_012129	GTT	2	6	1142	1147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586462
15	NC_012129	ATC	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586462
16	NC_012129	TGT	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586462
17	NC_012129	AAT	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
18	NC_012129	TTC	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586462
19	NC_012129	TAT	2	6	1366	1371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
20	NC_012129	ATT	2	6	1455	1460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
21	NC_012129	AAC	2	6	1487	1492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586462
22	NC_012129	TAA	2	6	1498	1503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
23	NC_012129	TAT	2	6	1504	1509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
24	NC_012129	GAC	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586462
25	NC_012129	TAA	2	6	1655	1660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
26	NC_012129	ATT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
27	NC_012129	ATT	2	6	1820	1825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
28	NC_012129	TAT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
29	NC_012129	ATT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
30	NC_012129	ATT	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
31	NC_012129	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012129	TAT	2	6	2398	2403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012129	AAT	3	9	2560	2568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
34	NC_012129	AAT	2	6	2664	2669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
35	NC_012129	CAA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586463
36	NC_012129	ATA	2	6	2770	2775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
37	NC_012129	CAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586463
38	NC_012129	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586463
39	NC_012129	ACC	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586463
40	NC_012129	TCC	2	6	2916	2921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586463
41	NC_012129	AAT	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
42	NC_012129	ATA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
43	NC_012129	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586463
44	NC_012129	CAG	2	6	3236	3241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586463
45	NC_012129	ATA	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
46	NC_012129	CCG	2	6	3415	3420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586463
47	NC_012129	ACA	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586463
48	NC_012129	CTG	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586463
49	NC_012129	ACA	2	6	3629	3634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586463
50	NC_012129	AGT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586463
51	NC_012129	TCC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012129	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012129	CTA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012129	ATT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012129	TAT	2	6	3972	3977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012129	AGA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586464
57	NC_012129	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586464
58	NC_012129	ATA	2	6	4239	4244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586464
59	NC_012129	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586464
60	NC_012129	GAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586464
61	NC_012129	ATA	2	6	4368	4373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586464
62	NC_012129	TAC	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586465
63	NC_012129	ATG	2	6	4442	4447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586465
64	NC_012129	ACT	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586465
65	NC_012129	TGT	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586465
66	NC_012129	TAA	2	6	4576	4581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586465
67	NC_012129	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586465
68	NC_012129	AAT	2	6	4627	4632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586465
69	NC_012129	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586465
70	NC_012129	ATT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
71	NC_012129	TAT	2	6	4914	4919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
72	NC_012129	AGA	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
73	NC_012129	AAT	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
74	NC_012129	ACA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586466
75	NC_012129	ATT	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
76	NC_012129	TTA	2	6	5270	5275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
77	NC_012129	AGA	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
78	NC_012129	AAG	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
79	NC_012129	TAG	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586466
80	NC_012129	AAT	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
81	NC_012129	TAC	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586466
82	NC_012129	AAT	2	6	5602	5607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
83	NC_012129	TTC	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586466
84	NC_012129	AAT	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
85	NC_012129	GAA	2	6	5761	5766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
86	NC_012129	ATA	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
87	NC_012129	TAA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012129	ATA	3	9	5880	5888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586467
89	NC_012129	TAG	3	9	5954	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586467
90	NC_012129	ATC	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586467
91	NC_012129	ATA	2	6	6034	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586467
92	NC_012129	ATT	2	6	6069	6074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586467
93	NC_012129	TAA	2	6	6104	6109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586467
94	NC_012129	TAA	2	6	6192	6197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586467
95	NC_012129	ATT	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586467
96	NC_012129	AAT	2	6	6272	6277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586467
97	NC_012129	TAA	2	6	6395	6400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586467
98	NC_012129	ATT	2	6	6459	6464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586467
99	NC_012129	TAA	2	6	6506	6511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012129	TTC	2	6	6539	6544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012129	AAT	2	6	6545	6550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012129	TTA	2	6	6649	6654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586468
103	NC_012129	AAG	2	6	6734	6739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586468
104	NC_012129	AAT	2	6	6744	6749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586468
105	NC_012129	TAA	2	6	6875	6880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586468
106	NC_012129	GAA	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586468
107	NC_012129	TAA	2	6	6939	6944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586468
108	NC_012129	ATT	2	6	6949	6954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586468
109	NC_012129	ATA	2	6	7154	7159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586468
110	NC_012129	AGA	2	6	7209	7214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586468
111	NC_012129	TTA	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586468
112	NC_012129	ATT	2	6	7245	7250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586468
113	NC_012129	ATT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586468
114	NC_012129	ATG	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586468
115	NC_012129	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586468
116	NC_012129	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586468
117	NC_012129	AAG	2	6	7604	7609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586468
118	NC_012129	TAT	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012129	AAC	2	6	7788	7793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586469
120	NC_012129	AGT	2	6	7815	7820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586469
121	NC_012129	TGT	2	6	7905	7910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586469
122	NC_012129	GAA	2	6	8182	8187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586469
123	NC_012129	AGA	2	6	8352	8357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586469
124	NC_012129	GAA	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586469
125	NC_012129	GAA	2	6	8443	8448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586469
126	NC_012129	ATA	2	6	8612	8617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586469
127	NC_012129	ATT	2	6	8764	8769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586470
128	NC_012129	TAT	2	6	8955	8960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586470
129	NC_012129	AAG	2	6	9057	9062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586470
130	NC_012129	ATA	2	6	9219	9224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586470
131	NC_012129	ATT	2	6	9311	9316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586471
132	NC_012129	ACA	2	6	9460	9465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586471
133	NC_012129	GAA	2	6	9507	9512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586471
134	NC_012129	TAA	2	6	9580	9585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586471
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264	NC_012129	ATT	2	6	18466	18471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586479
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272	NC_012129	AGT	2	6	18783	18788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586479
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384	NC_012129	ATA	2	6	26797	26802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586486

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.