MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp26

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012129	AAG	2	6	33	38	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012129	TTA	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012129	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012129	TAT	2	6	2398	2403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012129	TCC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012129	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012129	CTA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012129	ATT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012129	TAT	2	6	3972	3977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012129	TAA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012129	TAA	2	6	6506	6511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012129	TTC	2	6	6539	6544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012129	AAT	2	6	6545	6550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012129	TAT	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012129	TAG	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012129	ACT	2	6	9990	9995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012129	TTG	2	6	10684	10689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012129	AAT	2	6	10699	10704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012129	ATA	3	9	11381	11389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012129	TAA	2	6	11421	11426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012129	ATT	2	6	11491	11496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012129	TAT	2	6	11510	11515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012129	AAT	2	6	11548	11553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012129	TAT	2	6	11626	11631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012129	AAT	2	6	11693	11698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012129	ATT	2	6	11704	11709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012129	TAA	2	6	11961	11966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012129	AAT	2	6	11998	12003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012129	ATT	2	6	12016	12021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012129	TAA	2	6	12106	12111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012129	ATT	2	6	12146	12151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012129	GAA	2	6	12287	12292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012129	AAT	2	6	12317	12322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012129	AAT	2	6	12334	12339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012129	AAT	2	6	14091	14096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012129	TTA	2	6	14129	14134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012129	ATG	2	6	14201	14206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012129	ATT	2	6	14213	14218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012129	TTA	3	9	17075	17083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012129	AAT	2	6	17182	17187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012129	ATT	2	6	17225	17230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012129	TTG	2	6	17261	17266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012129	TAA	2	6	17270	17275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012129	AGG	2	6	17286	17291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012129	CTT	2	6	18114	18119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012129	TAA	2	6	18131	18136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012129	CTA	2	6	19770	19775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012129	GTA	2	6	19783	19788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012129	TAA	3	9	21200	21208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012129	TAA	2	6	23554	23559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012129	TGT	2	6	24878	24883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012129	ACA	2	6	24905	24910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012129	TTA	2	6	24936	24941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012129	AAT	2	6	24961	24966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012129	TAA	3	9	24999	25007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012129	AAT	2	6	25029	25034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012129	TAT	2	6	25086	25091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012129	TAT	2	6	25144	25149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012129	TAA	2	6	25184	25189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.