MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp26

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012129	AT	3	6	481	486	50 %	50 %	0 %	0 %	224586461
2	NC_012129	TA	3	6	761	766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012129	TC	3	6	1510	1515	0 %	50 %	0 %	50 %	224586462
4	NC_012129	AT	3	6	1965	1970	50 %	50 %	0 %	0 %	224586462
5	NC_012129	TA	3	6	2125	2130	50 %	50 %	0 %	0 %	224586462
6	NC_012129	AT	3	6	2263	2268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012129	AT	3	6	2893	2898	50 %	50 %	0 %	0 %	224586463
8	NC_012129	AT	3	6	3952	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012129	AT	3	6	3981	3986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012129	TA	3	6	4039	4044	50 %	50 %	0 %	0 %	224586464
11	NC_012129	AC	3	6	4227	4232	50 %	0 %	0 %	50 %	224586464
12	NC_012129	CA	3	6	5339	5344	50 %	0 %	0 %	50 %	224586466
13	NC_012129	AT	3	6	5767	5772	50 %	50 %	0 %	0 %	224586466
14	NC_012129	AT	3	6	5940	5945	50 %	50 %	0 %	0 %	224586467
15	NC_012129	TA	3	6	6592	6597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012129	TA	3	6	6788	6793	50 %	50 %	0 %	0 %	224586468
17	NC_012129	AT	3	6	7573	7578	50 %	50 %	0 %	0 %	224586468
18	NC_012129	AT	3	6	9402	9407	50 %	50 %	0 %	0 %	224586471
19	NC_012129	AG	3	6	9723	9728	50 %	0 %	50 %	0 %	224586471
20	NC_012129	AT	3	6	10284	10289	50 %	50 %	0 %	0 %	224586472
21	NC_012129	CA	3	6	10362	10367	50 %	0 %	0 %	50 %	224586472
22	NC_012129	TA	3	6	10643	10648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012129	TA	3	6	10655	10660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012129	TA	3	6	10770	10775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012129	TA	3	6	11149	11154	50 %	50 %	0 %	0 %	224586473
26	NC_012129	TA	3	6	12024	12029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012129	AT	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012129	AG	3	6	13379	13384	50 %	0 %	50 %	0 %	224586474
29	NC_012129	TA	3	6	13653	13658	50 %	50 %	0 %	0 %	224586474
30	NC_012129	GA	3	6	18404	18409	50 %	0 %	50 %	0 %	224586479
31	NC_012129	AT	3	6	18600	18605	50 %	50 %	0 %	0 %	224586479
32	NC_012129	AT	3	6	19597	19602	50 %	50 %	0 %	0 %	224586479
33	NC_012129	AT	3	6	20064	20069	50 %	50 %	0 %	0 %	224586480
34	NC_012129	AT	3	6	20532	20537	50 %	50 %	0 %	0 %	224586480
35	NC_012129	CT	3	6	20793	20798	0 %	50 %	0 %	50 %	224586480
36	NC_012129	AT	3	6	21061	21066	50 %	50 %	0 %	0 %	224586480
37	NC_012129	TA	3	6	21153	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	224586480
38	NC_012129	AT	3	6	21577	21582	50 %	50 %	0 %	0 %	224586481
39	NC_012129	AT	3	6	21650	21655	50 %	50 %	0 %	0 %	224586481
40	NC_012129	AT	3	6	21968	21973	50 %	50 %	0 %	0 %	224586482
41	NC_012129	AT	3	6	22447	22452	50 %	50 %	0 %	0 %	224586483
42	NC_012129	AT	3	6	22629	22634	50 %	50 %	0 %	0 %	224586483
43	NC_012129	AG	3	6	22697	22702	50 %	0 %	50 %	0 %	224586483
44	NC_012129	TA	3	6	23000	23005	50 %	50 %	0 %	0 %	224586484
45	NC_012129	TA	3	6	23586	23591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012129	TA	3	6	23966	23971	50 %	50 %	0 %	0 %	224586485
47	NC_012129	TC	3	6	25675	25680	0 %	50 %	0 %	50 %	224586486
48	NC_012129	AT	3	6	25972	25977	50 %	50 %	0 %	0 %	224586486
49	NC_012129	AT	3	6	26053	26058	50 %	50 %	0 %	0 %	224586486
50	NC_012129	TA	3	6	26315	26320	50 %	50 %	0 %	0 %	224586486
51	NC_012129	AC	3	6	26352	26357	50 %	0 %	0 %	50 %	224586486
52	NC_012129	AT	3	6	26651	26656	50 %	50 %	0 %	0 %	224586486

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.