MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 12

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	AACTTG	2	12	219	230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224586417
2	NC_012128	GAATTT	2	12	3843	3854	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224586424
3	NC_012128	ATTTAA	2	12	4951	4962	50 %	50 %	0 %	0 %	224586427
4	NC_012128	GAAATG	2	12	9496	9507	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224586436
5	NC_012128	AAAATA	2	12	11116	11127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224586440
6	NC_012128	GTATCC	2	12	12212	12223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	224586443
7	NC_012128	TAAAAT	2	12	12568	12579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012128	TTAAAA	2	12	17724	17735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586449
9	NC_012128	TAAAAA	2	12	17935	17946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012128	AAGTAA	2	12	19225	19236	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012128	AAAGAA	2	12	20489	20500	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224586453
12	NC_012128	TTTGTT	2	12	22139	22150	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224586457

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.