MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	TACAA	2	10	2853	2862	60 %	20 %	0 %	20 %	224586423
2	NC_012128	TTCAA	2	10	3019	3028	40 %	40 %	0 %	20 %	224586423
3	NC_012128	AGTTT	2	10	5025	5034	20 %	60 %	20 %	0 %	224586427
4	NC_012128	GAAAA	2	10	5557	5566	80 %	0 %	20 %	0 %	224586428
5	NC_012128	AAAAC	2	10	6956	6965	80 %	0 %	0 %	20 %	224586430
6	NC_012128	AAACT	2	10	8124	8133	60 %	20 %	0 %	20 %	224586433
7	NC_012128	AATTC	2	10	9241	9250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012128	AAAGC	2	10	10151	10160	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012128	TTATG	2	10	10346	10355	20 %	60 %	20 %	0 %	224586439
10	NC_012128	CAAAA	2	10	10376	10385	80 %	0 %	0 %	20 %	224586439
11	NC_012128	AATTT	2	10	12282	12291	40 %	60 %	0 %	0 %	224586443
12	NC_012128	TTACA	2	10	12479	12488	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012128	TGTAG	2	10	12551	12560	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012128	ATTAA	2	10	12611	12620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012128	TTTAA	2	10	12633	12642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012128	ATTAT	2	10	12685	12694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012128	TTTTA	2	10	13267	13276	20 %	80 %	0 %	0 %	224586444
18	NC_012128	ATTGA	2	10	13580	13589	40 %	40 %	20 %	0 %	224586444
19	NC_012128	AAAAG	2	10	13660	13669	80 %	0 %	20 %	0 %	224586444
20	NC_012128	TAAAA	2	10	15764	15773	80 %	20 %	0 %	0 %	224586448
21	NC_012128	ATTTA	2	10	16249	16258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012128	ATTTA	2	10	16448	16457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012128	GAGTT	2	10	17541	17550	20 %	40 %	40 %	0 %	224586449
24	NC_012128	AAAAC	2	10	18000	18009	80 %	0 %	0 %	20 %	224586450
25	NC_012128	ATTTT	2	10	19093	19102	20 %	80 %	0 %	0 %	224586451
26	NC_012128	AATTT	2	10	19413	19422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012128	AGAAA	2	10	20706	20715	80 %	0 %	20 %	0 %	224586453
28	NC_012128	AAAAG	2	10	21059	21068	80 %	0 %	20 %	0 %	224586454
29	NC_012128	TTTAA	2	10	22321	22330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012128	AAGTA	2	10	22759	22768	60 %	20 %	20 %	0 %	224586458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.