MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	TACAA	2	10	2853	2862	60 %	20 %	0 %	20 %	224586423
2	NC_012128	TTCAA	2	10	3019	3028	40 %	40 %	0 %	20 %	224586423
3	NC_012128	AGTTT	2	10	5025	5034	20 %	60 %	20 %	0 %	224586427
4	NC_012128	GAAAA	2	10	5557	5566	80 %	0 %	20 %	0 %	224586428
5	NC_012128	AAAAC	2	10	6956	6965	80 %	0 %	0 %	20 %	224586430
6	NC_012128	AAACT	2	10	8124	8133	60 %	20 %	0 %	20 %	224586433
7	NC_012128	TTATG	2	10	10346	10355	20 %	60 %	20 %	0 %	224586439
8	NC_012128	CAAAA	2	10	10376	10385	80 %	0 %	0 %	20 %	224586439
9	NC_012128	AATTT	2	10	12282	12291	40 %	60 %	0 %	0 %	224586443
10	NC_012128	TTTTA	2	10	13267	13276	20 %	80 %	0 %	0 %	224586444
11	NC_012128	ATTGA	2	10	13580	13589	40 %	40 %	20 %	0 %	224586444
12	NC_012128	AAAAG	2	10	13660	13669	80 %	0 %	20 %	0 %	224586444
13	NC_012128	TAAAA	2	10	15764	15773	80 %	20 %	0 %	0 %	224586448
14	NC_012128	GAGTT	2	10	17541	17550	20 %	40 %	40 %	0 %	224586449
15	NC_012128	AAAAC	2	10	18000	18009	80 %	0 %	0 %	20 %	224586450
16	NC_012128	ATTTT	2	10	19093	19102	20 %	80 %	0 %	0 %	224586451
17	NC_012128	AGAAA	2	10	20706	20715	80 %	0 %	20 %	0 %	224586453
18	NC_012128	AAAAG	2	10	21059	21068	80 %	0 %	20 %	0 %	224586454
19	NC_012128	AAGTA	2	10	22759	22768	60 %	20 %	20 %	0 %	224586458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.