MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	ATTT	3	12	572	583	25 %	75 %	0 %	0 %	224586418
2	NC_012128	AATT	2	8	1898	1905	50 %	50 %	0 %	0 %	224586421
3	NC_012128	GTAA	2	8	1926	1933	50 %	25 %	25 %	0 %	224586421
4	NC_012128	ATCA	2	8	2990	2997	50 %	25 %	0 %	25 %	224586423
5	NC_012128	AGTA	2	8	3422	3429	50 %	25 %	25 %	0 %	224586423
6	NC_012128	TCAT	2	8	3481	3488	25 %	50 %	0 %	25 %	224586423
7	NC_012128	ATGC	2	8	4608	4615	25 %	25 %	25 %	25 %	224586426
8	NC_012128	ACTT	2	8	4769	4776	25 %	50 %	0 %	25 %	224586426
9	NC_012128	TTTG	2	8	4975	4982	0 %	75 %	25 %	0 %	224586427
10	NC_012128	GCAT	2	8	6079	6086	25 %	25 %	25 %	25 %	224586428
11	NC_012128	AATT	2	8	6301	6308	50 %	50 %	0 %	0 %	224586428
12	NC_012128	ACTA	2	8	6790	6797	50 %	25 %	0 %	25 %	224586429
13	NC_012128	ATTT	2	8	7143	7150	25 %	75 %	0 %	0 %	224586430
14	NC_012128	CTTG	2	8	7425	7432	0 %	50 %	25 %	25 %	224586431
15	NC_012128	AATT	2	8	7571	7578	50 %	50 %	0 %	0 %	224586431
16	NC_012128	TAAT	2	8	9367	9374	50 %	50 %	0 %	0 %	224586436
17	NC_012128	ATCA	2	8	9768	9775	50 %	25 %	0 %	25 %	224586437
18	NC_012128	CTAT	2	8	9853	9860	25 %	50 %	0 %	25 %	224586437
19	NC_012128	AAAC	2	8	9944	9951	75 %	0 %	0 %	25 %	224586438
20	NC_012128	ACAT	2	8	10006	10013	50 %	25 %	0 %	25 %	224586438
21	NC_012128	ATTA	2	8	10232	10239	50 %	50 %	0 %	0 %	224586439
22	NC_012128	ACTG	2	8	11022	11029	25 %	25 %	25 %	25 %	224586440
23	NC_012128	TTTG	2	8	11261	11268	0 %	75 %	25 %	0 %	224586440
24	NC_012128	TTGA	2	8	11813	11820	25 %	50 %	25 %	0 %	224586442
25	NC_012128	CTTG	2	8	11827	11834	0 %	50 %	25 %	25 %	224586442
26	NC_012128	TATG	2	8	12332	12339	25 %	50 %	25 %	0 %	224586443
27	NC_012128	ATTT	2	8	12582	12589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012128	CAAT	2	8	12741	12748	50 %	25 %	0 %	25 %	224586444
29	NC_012128	ATTT	2	8	13359	13366	25 %	75 %	0 %	0 %	224586444
30	NC_012128	TCTT	2	8	13376	13383	0 %	75 %	0 %	25 %	224586444
31	NC_012128	ATTT	2	8	13897	13904	25 %	75 %	0 %	0 %	224586445
32	NC_012128	AAAC	2	8	14136	14143	75 %	0 %	0 %	25 %	224586445
33	NC_012128	GAAT	2	8	14256	14263	50 %	25 %	25 %	0 %	224586445
34	NC_012128	GATA	2	8	14481	14488	50 %	25 %	25 %	0 %	224586446
35	NC_012128	AGTA	2	8	14796	14803	50 %	25 %	25 %	0 %	224586446
36	NC_012128	TAAA	2	8	15047	15054	75 %	25 %	0 %	0 %	224586446
37	NC_012128	TAAA	2	8	15213	15220	75 %	25 %	0 %	0 %	224586447
38	NC_012128	CAAA	2	8	15556	15563	75 %	0 %	0 %	25 %	224586447
39	NC_012128	TAAA	2	8	15793	15800	75 %	25 %	0 %	0 %	224586448
40	NC_012128	TTGA	2	8	15876	15883	25 %	50 %	25 %	0 %	224586448
41	NC_012128	AGAT	2	8	15928	15935	50 %	25 %	25 %	0 %	224586448
42	NC_012128	TTTA	2	8	16034	16041	25 %	75 %	0 %	0 %	224586448
43	NC_012128	TAAA	2	8	16236	16243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012128	AAAT	2	8	16276	16283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012128	TAAA	2	8	16431	16438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012128	TCTA	2	8	16568	16575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012128	CATA	2	8	16599	16606	50 %	25 %	0 %	25 %	224586449
48	NC_012128	AAGC	2	8	16813	16820	50 %	0 %	25 %	25 %	224586449
49	NC_012128	AAAT	2	8	17029	17036	75 %	25 %	0 %	0 %	224586449
50	NC_012128	GATG	2	8	17111	17118	25 %	25 %	50 %	0 %	224586449
51	NC_012128	AGTA	2	8	17228	17235	50 %	25 %	25 %	0 %	224586449
52	NC_012128	TAAA	2	8	17670	17677	75 %	25 %	0 %	0 %	224586449
53	NC_012128	ATTA	2	8	17761	17768	50 %	50 %	0 %	0 %	224586449
54	NC_012128	AGAT	2	8	17833	17840	50 %	25 %	25 %	0 %	224586449
55	NC_012128	ATAA	2	8	17858	17865	75 %	25 %	0 %	0 %	224586449
56	NC_012128	AATT	2	8	18374	18381	50 %	50 %	0 %	0 %	224586450
57	NC_012128	AAAT	3	12	18563	18574	75 %	25 %	0 %	0 %	224586451
58	NC_012128	ATTT	2	8	18593	18600	25 %	75 %	0 %	0 %	224586451
59	NC_012128	TTTG	2	8	18861	18868	0 %	75 %	25 %	0 %	224586451
60	NC_012128	CCAG	2	8	18948	18955	25 %	0 %	25 %	50 %	224586451
61	NC_012128	GTTT	2	8	18967	18974	0 %	75 %	25 %	0 %	224586451
62	NC_012128	TGCA	2	8	19301	19308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012128	AAGA	2	8	19369	19376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012128	ATTA	2	8	19537	19544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012128	TGAG	2	8	19701	19708	25 %	25 %	50 %	0 %	224586452
66	NC_012128	AAGT	2	8	19731	19738	50 %	25 %	25 %	0 %	224586452
67	NC_012128	TAAG	2	8	21337	21344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012128	GATA	2	8	21397	21404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012128	CAAA	2	8	22073	22080	75 %	0 %	0 %	25 %	224586457
70	NC_012128	AATT	2	8	22168	22175	50 %	50 %	0 %	0 %	224586457
71	NC_012128	TGAT	2	8	22482	22489	25 %	50 %	25 %	0 %	224586458
72	NC_012128	ACAA	2	8	22593	22600	75 %	0 %	0 %	25 %	224586458
73	NC_012128	AGCA	2	8	22843	22850	50 %	0 %	25 %	25 %	224586458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.