MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012128	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586417
3	NC_012128	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586417
4	NC_012128	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586417
5	NC_012128	GAA	2	6	341	346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586417
6	NC_012128	CAA	2	6	448	453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586417
7	NC_012128	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586417
8	NC_012128	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586418
9	NC_012128	TAA	3	9	718	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586418
10	NC_012128	TCT	2	6	746	751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586418
11	NC_012128	TAA	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586418
12	NC_012128	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012128	TTA	2	6	949	954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586419
14	NC_012128	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586419
15	NC_012128	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586419
16	NC_012128	AGT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586419
17	NC_012128	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586419
18	NC_012128	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586419
19	NC_012128	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586420
20	NC_012128	AAG	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586420
21	NC_012128	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586420
22	NC_012128	AAT	2	6	1435	1440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586420
23	NC_012128	ATT	2	6	1536	1541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586420
24	NC_012128	TAA	2	6	1605	1610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586420
25	NC_012128	ACT	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586420
26	NC_012128	AAC	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586421
27	NC_012128	TTC	2	6	1814	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586421
28	NC_012128	ATT	2	6	1845	1850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586421
29	NC_012128	AGA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586421
30	NC_012128	CAA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586422
31	NC_012128	TAG	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586422
32	NC_012128	ACA	2	6	2258	2263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586422
33	NC_012128	TGG	3	9	2281	2289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586422
34	NC_012128	TGT	2	6	2344	2349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586422
35	NC_012128	TAG	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586422
36	NC_012128	ATG	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586422
37	NC_012128	AGG	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012128	TGA	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586423
39	NC_012128	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586423
40	NC_012128	ACA	2	6	2774	2779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586423
41	NC_012128	AGT	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586423
42	NC_012128	ATT	2	6	2841	2846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586423
43	NC_012128	TAA	3	9	2926	2934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586423
44	NC_012128	CTA	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586423
45	NC_012128	AGC	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586423
46	NC_012128	AGA	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586423
47	NC_012128	ATG	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586423
48	NC_012128	GCA	2	6	3254	3259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586423
49	NC_012128	TAA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586423
50	NC_012128	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586423
51	NC_012128	TTA	2	6	3405	3410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586423
52	NC_012128	TGT	2	6	3432	3437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586423
53	NC_012128	GTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586423
54	NC_012128	CTA	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586423
55	NC_012128	GAA	3	9	3621	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586424
56	NC_012128	TGC	2	6	3661	3666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586424
57	NC_012128	GTT	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586424
58	NC_012128	TAG	3	9	3905	3913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586424
59	NC_012128	GCA	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586424
60	NC_012128	TTA	2	6	4203	4208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586425
61	NC_012128	CAA	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012128	TTG	2	6	4741	4746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586426
63	NC_012128	ATA	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586427
64	NC_012128	GCT	2	6	5116	5121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586427
65	NC_012128	TAA	2	6	5393	5398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586428
66	NC_012128	ATT	2	6	5404	5409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586428
67	NC_012128	AGC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586428
68	NC_012128	TAA	2	6	5450	5455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586428
69	NC_012128	AAC	2	6	5503	5508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586428
70	NC_012128	TGT	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586428
71	NC_012128	TTA	2	6	5707	5712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586428
72	NC_012128	GAT	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586428
73	NC_012128	GAC	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586428
74	NC_012128	TAA	2	6	5771	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586428
75	NC_012128	AGA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586428
76	NC_012128	AAT	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586428
77	NC_012128	TTG	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586428
78	NC_012128	TAA	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586428
79	NC_012128	CTG	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586428
80	NC_012128	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586428
81	NC_012128	CTT	2	6	6054	6059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586428
82	NC_012128	AAG	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586428
83	NC_012128	ATT	2	6	6165	6170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586428
84	NC_012128	ACA	2	6	6565	6570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586429
85	NC_012128	TAA	2	6	6608	6613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586429
86	NC_012128	ATT	2	6	6784	6789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586429
87	NC_012128	GAA	2	6	6811	6816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586429
88	NC_012128	AAG	2	6	6822	6827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586429
89	NC_012128	CAG	2	6	6833	6838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586429
90	NC_012128	TAC	2	6	7153	7158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586430
91	NC_012128	TTG	2	6	7169	7174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586430
92	NC_012128	TAT	2	6	7176	7181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586430
93	NC_012128	AAT	2	6	7261	7266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586430
94	NC_012128	TAC	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586431
95	NC_012128	TAA	2	6	7466	7471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586431
96	NC_012128	ATG	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586431
97	NC_012128	GCA	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586432
98	NC_012128	GGA	2	6	7927	7932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586433
99	NC_012128	ATG	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586433
100	NC_012128	TTG	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586433
101	NC_012128	TTA	2	6	8040	8045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586433
102	NC_012128	AGC	2	6	8062	8067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586433
103	NC_012128	AGG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586433
104	NC_012128	GAA	2	6	8102	8107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586433
105	NC_012128	AGA	2	6	8158	8163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586433
106	NC_012128	AGA	2	6	8242	8247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586433
107	NC_012128	ATG	2	6	8540	8545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586434
108	NC_012128	AGA	2	6	8590	8595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586434
109	NC_012128	ACA	2	6	8643	8648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586434
110	NC_012128	TCA	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586434
111	NC_012128	ATC	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586434
112	NC_012128	AGC	2	6	8863	8868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586435
113	NC_012128	ACT	2	6	9097	9102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586435
114	NC_012128	TAG	2	6	9183	9188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586435
115	NC_012128	TTC	2	6	9439	9444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586436
116	NC_012128	ACT	2	6	9452	9457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586436
117	NC_012128	AAT	2	6	9510	9515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586436
118	NC_012128	CAA	2	6	9730	9735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586437
119	NC_012128	AAT	2	6	9822	9827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586437
120	NC_012128	CAA	2	6	9836	9841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586437
121	NC_012128	AAG	2	6	9862	9867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586437
122	NC_012128	AAT	2	6	9873	9878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586437
123	NC_012128	AAC	2	6	10035	10040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586438
124	NC_012128	ATA	2	6	10096	10101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586438
125	NC_012128	AGC	2	6	10104	10109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586438
126	NC_012128	ACT	2	6	10225	10230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586439
127	NC_012128	TAC	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586439
128	NC_012128	TGT	2	6	10251	10256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586439
129	NC_012128	ACT	2	6	10257	10262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586439
130	NC_012128	AGA	2	6	10277	10282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586439
131	NC_012128	GCC	2	6	10289	10294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586439
132	NC_012128	ATT	2	6	10296	10301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586439
133	NC_012128	ATA	2	6	10474	10479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586439
134	NC_012128	ACT	2	6	10484	10489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586439
135	NC_012128	AAT	2	6	10617	10622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012128	ACA	2	6	10654	10659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012128	TTA	3	9	10753	10761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012128	TAT	2	6	10817	10822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586440
139	NC_012128	CAA	2	6	10906	10911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586440
140	NC_012128	AGA	2	6	11001	11006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586440
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145	NC_012128	ACA	2	6	11250	11255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586440
146	NC_012128	TAA	2	6	11284	11289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586440
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151	NC_012128	TAT	2	6	11454	11459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586441
152	NC_012128	ATC	2	6	11563	11568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_012128	ATT	2	6	11572	11577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586442
154	NC_012128	AAT	2	6	11612	11617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586442
155	NC_012128	TAT	2	6	11626	11631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586442
156	NC_012128	TGT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586442
157	NC_012128	CTT	2	6	11677	11682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586442
158	NC_012128	TAA	3	9	11694	11702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586442
159	NC_012128	ATT	2	6	11861	11866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586442
160	NC_012128	AGT	2	6	12074	12079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012128	TAA	2	6	12163	12168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586443
162	NC_012128	TAT	2	6	12301	12306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586443
163	NC_012128	CCT	2	6	12353	12358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_012128	TAA	2	6	12505	12510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012128	AAC	2	6	12536	12541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_012128	TAA	2	6	12627	12632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012128	ATT	3	9	12697	12705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012128	AGG	2	6	12716	12721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_012128	TAA	2	6	13162	13167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586444
174	NC_012128	ATA	3	9	13170	13178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586444
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188	NC_012128	AAT	2	6	13790	13795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586444
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209	NC_012128	ATG	2	6	15647	15652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586447
210	NC_012128	TAA	2	6	15685	15690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586447
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215	NC_012128	AAT	2	6	16071	16076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_012128	ATT	2	6	16097	16102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_012128	ATT	2	6	16263	16268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_012128	TTA	2	6	16270	16275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_012128	TTA	2	6	16307	16312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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224	NC_012128	TAT	2	6	16424	16429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_012128	ATT	2	6	16560	16565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
226	NC_012128	AGG	2	6	16580	16585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
227	NC_012128	ATA	2	6	16646	16651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586449
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242	NC_012128	TAA	2	6	17650	17655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586449
243	NC_012128	AGG	2	6	17969	17974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
244	NC_012128	TTA	2	6	18123	18128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586450
245	NC_012128	TTA	2	6	18167	18172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586450
246	NC_012128	GCT	2	6	18247	18252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586450
247	NC_012128	AGT	2	6	18404	18409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586450
248	NC_012128	TAC	2	6	18412	18417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586451
249	NC_012128	AGA	2	6	18465	18470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586451
250	NC_012128	AAG	2	6	18621	18626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586451
251	NC_012128	ATA	2	6	18652	18657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586451
252	NC_012128	TAA	2	6	18844	18849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586451
253	NC_012128	ATT	2	6	18997	19002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586451
254	NC_012128	ATT	2	6	19158	19163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586451
255	NC_012128	ATT	2	6	19176	19181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586451
256	NC_012128	GTG	2	6	19344	19349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012128	TAT	2	6	19627	19632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586452
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259	NC_012128	TAA	2	6	19824	19829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586452
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.