MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012128	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012128	AGG	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012128	CAA	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012128	AAT	2	6	10617	10622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012128	ACA	2	6	10654	10659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012128	TTA	3	9	10753	10761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012128	ATC	2	6	11563	11568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012128	AGT	2	6	12074	12079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012128	CCT	2	6	12353	12358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012128	TAA	2	6	12505	12510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012128	AAC	2	6	12536	12541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012128	TAA	2	6	12627	12632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012128	ATT	3	9	12697	12705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012128	AGG	2	6	12716	12721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012128	AAT	2	6	16071	16076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012128	ATT	2	6	16097	16102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012128	TGG	2	6	16110	16115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012128	TAT	2	6	16117	16122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012128	AAG	2	6	16124	16129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012128	ATT	2	6	16263	16268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012128	TTA	2	6	16270	16275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012128	TTA	2	6	16307	16312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012128	TAA	2	6	16333	16338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012128	TAT	2	6	16424	16429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012128	ATT	2	6	16560	16565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012128	AGG	2	6	16580	16585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012128	AGG	2	6	17969	17974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012128	GTG	2	6	19344	19349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012128	TAA	2	6	21368	21373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012128	AAG	2	6	21407	21412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012128	TAT	2	6	21447	21452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012128	AGA	2	6	22251	22256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012128	GTG	2	6	22266	22271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012128	TTA	2	6	22311	22316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.