MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	224586417
2	NC_012128	TC	3	6	170	175	0 %	50 %	0 %	50 %	224586417
3	NC_012128	TA	3	6	425	430	50 %	50 %	0 %	0 %	224586417
4	NC_012128	CT	4	8	672	679	0 %	50 %	0 %	50 %	224586418
5	NC_012128	AG	4	8	1512	1519	50 %	0 %	50 %	0 %	224586420
6	NC_012128	GT	3	6	1521	1526	0 %	50 %	50 %	0 %	224586420
7	NC_012128	AG	3	6	1665	1670	50 %	0 %	50 %	0 %	224586421
8	NC_012128	GA	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	224586421
9	NC_012128	AG	3	6	3923	3928	50 %	0 %	50 %	0 %	224586424
10	NC_012128	GA	3	6	3934	3939	50 %	0 %	50 %	0 %	224586424
11	NC_012128	AT	3	6	4553	4558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012128	TA	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012128	AT	4	8	5045	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	224586427
14	NC_012128	AT	3	6	6428	6433	50 %	50 %	0 %	0 %	224586428
15	NC_012128	AG	3	6	7369	7374	50 %	0 %	50 %	0 %	224586431
16	NC_012128	AG	3	6	7799	7804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012128	AT	3	6	8461	8466	50 %	50 %	0 %	0 %	224586434
18	NC_012128	TA	3	6	9299	9304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012128	AT	3	6	9305	9310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012128	AT	3	6	11337	11342	50 %	50 %	0 %	0 %	224586441
21	NC_012128	TA	3	6	12311	12316	50 %	50 %	0 %	0 %	224586443
22	NC_012128	TA	3	6	12379	12384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012128	AT	4	8	14564	14571	50 %	50 %	0 %	0 %	224586446
24	NC_012128	TA	3	6	14743	14748	50 %	50 %	0 %	0 %	224586446
25	NC_012128	TA	3	6	15132	15137	50 %	50 %	0 %	0 %	224586446
26	NC_012128	TA	3	6	15195	15200	50 %	50 %	0 %	0 %	224586447
27	NC_012128	AT	3	6	16055	16060	50 %	50 %	0 %	0 %	224586448
28	NC_012128	TA	5	10	16399	16408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012128	TC	3	6	16701	16706	0 %	50 %	0 %	50 %	224586449
30	NC_012128	TA	3	6	19286	19291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012128	TC	3	6	19293	19298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012128	AT	3	6	19393	19398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012128	GA	3	6	19468	19473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012128	TA	3	6	19565	19570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012128	AT	3	6	21039	21044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012128	AT	3	6	21047	21052	50 %	50 %	0 %	0 %	224586454
37	NC_012128	TG	3	6	21601	21606	0 %	50 %	50 %	0 %	224586455
38	NC_012128	GC	3	6	21758	21763	0 %	0 %	50 %	50 %	224586455
39	NC_012128	TA	3	6	22475	22480	50 %	50 %	0 %	0 %	224586458
40	NC_012128	AC	4	8	23074	23081	50 %	0 %	0 %	50 %	224586458
41	NC_012128	AT	3	6	23134	23139	50 %	50 %	0 %	0 %	224586458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.