MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	T	6	6	134	139	0 %	100 %	0 %	0 %	224586417
2	NC_012128	T	6	6	559	564	0 %	100 %	0 %	0 %	224586418
3	NC_012128	T	6	6	628	633	0 %	100 %	0 %	0 %	224586418
4	NC_012128	A	6	6	725	730	100 %	0 %	0 %	0 %	224586418
5	NC_012128	T	6	6	751	756	0 %	100 %	0 %	0 %	224586418
6	NC_012128	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	224586421
7	NC_012128	A	6	6	2051	2056	100 %	0 %	0 %	0 %	224586422
8	NC_012128	T	6	6	2145	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	224586422
9	NC_012128	T	6	6	2420	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	224586422
10	NC_012128	A	6	6	2445	2450	100 %	0 %	0 %	0 %	224586422
11	NC_012128	A	8	8	2509	2516	100 %	0 %	0 %	0 %	224586422
12	NC_012128	A	6	6	2733	2738	100 %	0 %	0 %	0 %	224586423
13	NC_012128	A	6	6	3147	3152	100 %	0 %	0 %	0 %	224586423
14	NC_012128	A	6	6	3864	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	224586424
15	NC_012128	A	6	6	4710	4715	100 %	0 %	0 %	0 %	224586426
16	NC_012128	A	7	7	5138	5144	100 %	0 %	0 %	0 %	224586427
17	NC_012128	G	6	6	5329	5334	0 %	0 %	100 %	0 %	224586427
18	NC_012128	T	6	6	5594	5599	0 %	100 %	0 %	0 %	224586428
19	NC_012128	A	6	6	5658	5663	100 %	0 %	0 %	0 %	224586428
20	NC_012128	T	7	7	5795	5801	0 %	100 %	0 %	0 %	224586428
21	NC_012128	A	6	6	6152	6157	100 %	0 %	0 %	0 %	224586428
22	NC_012128	A	6	6	6881	6886	100 %	0 %	0 %	0 %	224586429
23	NC_012128	A	6	6	7410	7415	100 %	0 %	0 %	0 %	224586431
24	NC_012128	A	6	6	7440	7445	100 %	0 %	0 %	0 %	224586431
25	NC_012128	A	6	6	7651	7656	100 %	0 %	0 %	0 %	224586432
26	NC_012128	A	6	6	7738	7743	100 %	0 %	0 %	0 %	224586432
27	NC_012128	A	6	6	7760	7765	100 %	0 %	0 %	0 %	224586432
28	NC_012128	A	6	6	7874	7879	100 %	0 %	0 %	0 %	224586433
29	NC_012128	A	6	6	7963	7968	100 %	0 %	0 %	0 %	224586433
30	NC_012128	A	6	6	8090	8095	100 %	0 %	0 %	0 %	224586433
31	NC_012128	T	6	6	8147	8152	0 %	100 %	0 %	0 %	224586433
32	NC_012128	A	6	6	8318	8323	100 %	0 %	0 %	0 %	224586433
33	NC_012128	A	7	7	8572	8578	100 %	0 %	0 %	0 %	224586434
34	NC_012128	T	7	7	8734	8740	0 %	100 %	0 %	0 %	224586434
35	NC_012128	A	6	6	8873	8878	100 %	0 %	0 %	0 %	224586435
36	NC_012128	T	6	6	9023	9028	0 %	100 %	0 %	0 %	224586435
37	NC_012128	A	6	6	9137	9142	100 %	0 %	0 %	0 %	224586435
38	NC_012128	A	6	6	9337	9342	100 %	0 %	0 %	0 %	224586436
39	NC_012128	A	7	7	9522	9528	100 %	0 %	0 %	0 %	224586436
40	NC_012128	T	8	8	9648	9655	0 %	100 %	0 %	0 %	224586437
41	NC_012128	A	7	7	9802	9808	100 %	0 %	0 %	0 %	224586437
42	NC_012128	T	8	8	9993	10000	0 %	100 %	0 %	0 %	224586438
43	NC_012128	A	7	7	10504	10510	100 %	0 %	0 %	0 %	224586439
44	NC_012128	A	7	7	10524	10530	100 %	0 %	0 %	0 %	224586439
45	NC_012128	A	6	6	10914	10919	100 %	0 %	0 %	0 %	224586440
46	NC_012128	A	6	6	10968	10973	100 %	0 %	0 %	0 %	224586440
47	NC_012128	A	6	6	11036	11041	100 %	0 %	0 %	0 %	224586440
48	NC_012128	T	7	7	11604	11610	0 %	100 %	0 %	0 %	224586442
49	NC_012128	T	6	6	11658	11663	0 %	100 %	0 %	0 %	224586442
50	NC_012128	T	8	8	11711	11718	0 %	100 %	0 %	0 %	224586442
51	NC_012128	T	7	7	11796	11802	0 %	100 %	0 %	0 %	224586442
52	NC_012128	T	7	7	12324	12330	0 %	100 %	0 %	0 %	224586443
53	NC_012128	A	7	7	12749	12755	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
54	NC_012128	A	6	6	12824	12829	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
55	NC_012128	A	7	7	12942	12948	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
56	NC_012128	A	8	8	13026	13033	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
57	NC_012128	A	7	7	13069	13075	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
58	NC_012128	A	8	8	13395	13402	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
59	NC_012128	A	6	6	13427	13432	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
60	NC_012128	A	7	7	13440	13446	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
61	NC_012128	A	7	7	13481	13487	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
62	NC_012128	A	6	6	13589	13594	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
63	NC_012128	A	6	6	13780	13785	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
64	NC_012128	A	7	7	13807	13813	100 %	0 %	0 %	0 %	224586444
65	NC_012128	A	7	7	13855	13861	100 %	0 %	0 %	0 %	224586445
66	NC_012128	A	8	8	13982	13989	100 %	0 %	0 %	0 %	224586445
67	NC_012128	T	6	6	14088	14093	0 %	100 %	0 %	0 %	224586445
68	NC_012128	A	6	6	14113	14118	100 %	0 %	0 %	0 %	224586445
69	NC_012128	T	7	7	14211	14217	0 %	100 %	0 %	0 %	224586445
70	NC_012128	A	6	6	14333	14338	100 %	0 %	0 %	0 %	224586445
71	NC_012128	A	6	6	14374	14379	100 %	0 %	0 %	0 %	224586445
72	NC_012128	A	8	8	14466	14473	100 %	0 %	0 %	0 %	224586446
73	NC_012128	A	6	6	14706	14711	100 %	0 %	0 %	0 %	224586446
74	NC_012128	A	8	8	14926	14933	100 %	0 %	0 %	0 %	224586446
75	NC_012128	T	6	6	15090	15095	0 %	100 %	0 %	0 %	224586446
76	NC_012128	A	7	7	15137	15143	100 %	0 %	0 %	0 %	224586446
77	NC_012128	A	6	6	15530	15535	100 %	0 %	0 %	0 %	224586447
78	NC_012128	A	7	7	15547	15553	100 %	0 %	0 %	0 %	224586447
79	NC_012128	A	6	6	15593	15598	100 %	0 %	0 %	0 %	224586447
80	NC_012128	A	6	6	15620	15625	100 %	0 %	0 %	0 %	224586447
81	NC_012128	A	7	7	15697	15703	100 %	0 %	0 %	0 %	224586447
82	NC_012128	A	6	6	15770	15775	100 %	0 %	0 %	0 %	224586448
83	NC_012128	A	7	7	16608	16614	100 %	0 %	0 %	0 %	224586449
84	NC_012128	A	6	6	16694	16699	100 %	0 %	0 %	0 %	224586449
85	NC_012128	A	6	6	16716	16721	100 %	0 %	0 %	0 %	224586449
86	NC_012128	A	6	6	16742	16747	100 %	0 %	0 %	0 %	224586449
87	NC_012128	A	7	7	17069	17075	100 %	0 %	0 %	0 %	224586449
88	NC_012128	T	6	6	17218	17223	0 %	100 %	0 %	0 %	224586449
89	NC_012128	T	6	6	17236	17241	0 %	100 %	0 %	0 %	224586449
90	NC_012128	T	6	6	17353	17358	0 %	100 %	0 %	0 %	224586449
91	NC_012128	A	7	7	17693	17699	100 %	0 %	0 %	0 %	224586449
92	NC_012128	A	7	7	17816	17822	100 %	0 %	0 %	0 %	224586449
93	NC_012128	A	6	6	17978	17983	100 %	0 %	0 %	0 %	224586450
94	NC_012128	T	6	6	18051	18056	0 %	100 %	0 %	0 %	224586450
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97	NC_012128	T	7	7	18724	18730	0 %	100 %	0 %	0 %	224586451
98	NC_012128	T	8	8	18815	18822	0 %	100 %	0 %	0 %	224586451
99	NC_012128	T	6	6	19053	19058	0 %	100 %	0 %	0 %	224586451
100	NC_012128	T	6	6	19072	19077	0 %	100 %	0 %	0 %	224586451
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102	NC_012128	A	7	7	19616	19622	100 %	0 %	0 %	0 %	224586452
103	NC_012128	T	6	6	19641	19646	0 %	100 %	0 %	0 %	224586452
104	NC_012128	T	7	7	19886	19892	0 %	100 %	0 %	0 %	224586452
105	NC_012128	A	7	7	20162	20168	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
106	NC_012128	T	7	7	20185	20191	0 %	100 %	0 %	0 %	224586453
107	NC_012128	A	6	6	20236	20241	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
108	NC_012128	A	7	7	20287	20293	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
109	NC_012128	A	6	6	20314	20319	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
110	NC_012128	A	7	7	20476	20482	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
111	NC_012128	A	7	7	20508	20514	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
112	NC_012128	A	7	7	20552	20558	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
113	NC_012128	A	6	6	20636	20641	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
114	NC_012128	A	6	6	20697	20702	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
115	NC_012128	A	7	7	20713	20719	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
116	NC_012128	A	6	6	20966	20971	100 %	0 %	0 %	0 %	224586453
117	NC_012128	A	8	8	21112	21119	100 %	0 %	0 %	0 %	224586454
118	NC_012128	A	6	6	21141	21146	100 %	0 %	0 %	0 %	224586454
119	NC_012128	T	6	6	21228	21233	0 %	100 %	0 %	0 %	224586454
120	NC_012128	T	7	7	21239	21245	0 %	100 %	0 %	0 %	224586454
121	NC_012128	T	6	6	21259	21264	0 %	100 %	0 %	0 %	224586454
122	NC_012128	A	6	6	21500	21505	100 %	0 %	0 %	0 %	224586455
123	NC_012128	A	6	6	21728	21733	100 %	0 %	0 %	0 %	224586455
124	NC_012128	A	7	7	21885	21891	100 %	0 %	0 %	0 %	224586456
125	NC_012128	A	6	6	21910	21915	100 %	0 %	0 %	0 %	224586456
126	NC_012128	A	8	8	22188	22195	100 %	0 %	0 %	0 %	224586457
127	NC_012128	A	6	6	23243	23248	100 %	0 %	0 %	0 %	224586458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.