MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 11356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012125	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012125	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	224581840
3	NC_012125	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	224581841
4	NC_012125	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	224581842
5	NC_012125	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	224581842
6	NC_012125	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	224581842
7	NC_012125	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	224581842
8	NC_012125	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	224581842
9	NC_012125	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	224581844
10	NC_012125	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	224581844
11	NC_012125	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	224581844
12	NC_012125	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	224581845
13	NC_012125	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	224581845
14	NC_012125	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012125	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012125	TCCG	2	8	9279	9286	0 %	25 %	25 %	50 %	224581846
17	NC_012125	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	224581847
18	NC_012125	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	224581848
19	NC_012125	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	224581849
20	NC_012125	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	224581849
21	NC_012125	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	224581849
22	NC_012125	ATTT	2	8	11369	11376	25 %	75 %	0 %	0 %	224581850
23	NC_012125	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	224581850
24	NC_012125	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	224581851
25	NC_012125	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	224581851
26	NC_012125	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	224581851
27	NC_012125	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	224581851
28	NC_012125	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	224581851
29	NC_012125	GCGT	2	8	12930	12937	0 %	25 %	50 %	25 %	224581851
30	NC_012125	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	224581851
31	NC_012125	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	224581852
32	NC_012125	TCAG	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	224581854
33	NC_012125	TTTG	2	8	15533	15540	0 %	75 %	25 %	0 %	224581854
34	NC_012125	CGAA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	25 %	25 %	224581854
35	NC_012125	ATTG	2	8	15760	15767	25 %	50 %	25 %	0 %	224581854
36	NC_012125	ATTA	2	8	16428	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	224581855
37	NC_012125	ATAA	2	8	16520	16527	75 %	25 %	0 %	0 %	224581856
38	NC_012125	AATA	2	8	17996	18003	75 %	25 %	0 %	0 %	224581858
39	NC_012125	GGGC	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	224581858
40	NC_012125	CGTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	50 %	25 %	224581858
41	NC_012125	CCAA	2	8	21283	21290	50 %	0 %	0 %	50 %	224581859
42	NC_012125	GACG	2	8	21629	21636	25 %	0 %	50 %	25 %	224581859
43	NC_012125	TGGC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	50 %	25 %	224581859
44	NC_012125	TGGC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	50 %	25 %	224581859
45	NC_012125	ATTT	2	8	22481	22488	25 %	75 %	0 %	0 %	224581859
46	NC_012125	CGCC	2	8	22654	22661	0 %	0 %	25 %	75 %	224581859
47	NC_012125	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	224581859
48	NC_012125	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012125	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	224581860
50	NC_012125	CTGA	2	8	23851	23858	25 %	25 %	25 %	25 %	224581860
51	NC_012125	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	224581860
52	NC_012125	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	224581861
53	NC_012125	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	224581861
54	NC_012125	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	224581862
55	NC_012125	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	224581862
56	NC_012125	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012125	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012125	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012125	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012125	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012125	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012125	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012125	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	224581863
64	NC_012125	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	224581864
65	NC_012125	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	224581866
66	NC_012125	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	224581866
67	NC_012125	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	224581866
68	NC_012125	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	224581866
69	NC_012125	GTCA	2	8	31405	31412	25 %	25 %	25 %	25 %	224581867
70	NC_012125	ACCG	2	8	32225	32232	25 %	0 %	25 %	50 %	224581868
71	NC_012125	AGGC	2	8	32263	32270	25 %	0 %	50 %	25 %	224581868
72	NC_012125	CCTG	2	8	32699	32706	0 %	25 %	25 %	50 %	224581869
73	NC_012125	TAAA	2	8	32959	32966	75 %	25 %	0 %	0 %	224581869
74	NC_012125	AAAT	2	8	33147	33154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012125	TTCT	2	8	33178	33185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012125	GTTA	2	8	33351	33358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012125	GGTC	2	8	33499	33506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012125	TAAA	2	8	33540	33547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012125	GGAC	2	8	33677	33684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012125	ATAC	2	8	34447	34454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012125	CTTA	2	8	34943	34950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012125	AATC	2	8	35349	35356	50 %	25 %	0 %	25 %	224581873
83	NC_012125	TAGA	2	8	35488	35495	50 %	25 %	25 %	0 %	224581873
84	NC_012125	TAAA	2	8	35670	35677	75 %	25 %	0 %	0 %	224581873
85	NC_012125	GGCT	2	8	36169	36176	0 %	25 %	50 %	25 %	521145197
86	NC_012125	AAGA	2	8	36332	36339	75 %	0 %	25 %	0 %	521145197
87	NC_012125	CCGA	2	8	36946	36953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012125	ACCG	2	8	37321	37328	25 %	0 %	25 %	50 %	224581874
89	NC_012125	TGAT	2	8	37605	37612	25 %	50 %	25 %	0 %	224581874
90	NC_012125	TGGT	2	8	37650	37657	0 %	50 %	50 %	0 %	224581874
91	NC_012125	AATG	2	8	38128	38135	50 %	25 %	25 %	0 %	224581874
92	NC_012125	CCTG	2	8	38707	38714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012125	TGCC	2	8	39293	39300	0 %	25 %	25 %	50 %	224581875
94	NC_012125	GACG	2	8	39330	39337	25 %	0 %	50 %	25 %	224581875
95	NC_012125	ATTA	2	8	39637	39644	50 %	50 %	0 %	0 %	224581875
96	NC_012125	AATC	2	8	39733	39740	50 %	25 %	0 %	25 %	224581875
97	NC_012125	AACG	2	8	40212	40219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012125	TGAC	2	8	40296	40303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012125	GAAA	2	8	41160	41167	75 %	0 %	25 %	0 %	224581876
100	NC_012125	GCTG	2	8	41366	41373	0 %	25 %	50 %	25 %	224581876
101	NC_012125	CACG	2	8	42064	42071	25 %	0 %	25 %	50 %	224581877
102	NC_012125	CAGC	2	8	42091	42098	25 %	0 %	25 %	50 %	224581877
103	NC_012125	CTGC	2	8	42228	42235	0 %	25 %	25 %	50 %	224581877
104	NC_012125	TACC	2	8	42575	42582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012125	CATG	2	8	42796	42803	25 %	25 %	25 %	25 %	224581878
106	NC_012125	AGTA	2	8	43591	43598	50 %	25 %	25 %	0 %	224581878
107	NC_012125	CCAG	2	8	43648	43655	25 %	0 %	25 %	50 %	224581878
108	NC_012125	TTGA	2	8	44429	44436	25 %	50 %	25 %	0 %	224581878
109	NC_012125	GAAA	2	8	44764	44771	75 %	0 %	25 %	0 %	224581879
110	NC_012125	GCCA	2	8	45105	45112	25 %	0 %	25 %	50 %	224581879
111	NC_012125	TAAA	2	8	45498	45505	75 %	25 %	0 %	0 %	224581879
112	NC_012125	TCTT	2	8	45617	45624	0 %	75 %	0 %	25 %	224581879
113	NC_012125	AGTA	2	8	46191	46198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012125	ATCA	2	8	46231	46238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012125	GAAA	2	8	46351	46358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012125	AGGG	2	8	46384	46391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012125	CATA	2	8	47143	47150	50 %	25 %	0 %	25 %	224581882
118	NC_012125	TCAG	2	8	47154	47161	25 %	25 %	25 %	25 %	224581882
119	NC_012125	TGGC	2	8	47868	47875	0 %	25 %	50 %	25 %	224581882
120	NC_012125	GTTC	2	8	50285	50292	0 %	50 %	25 %	25 %	224581883
121	NC_012125	AGCC	2	8	51695	51702	25 %	0 %	25 %	50 %	224581886
122	NC_012125	AAAG	2	8	51774	51781	75 %	0 %	25 %	0 %	224581886
123	NC_012125	ATGG	2	8	51907	51914	25 %	25 %	50 %	0 %	224581886
124	NC_012125	TGAT	2	8	52579	52586	25 %	50 %	25 %	0 %	224581887
125	NC_012125	TGGA	2	8	53248	53255	25 %	25 %	50 %	0 %	224581889
126	NC_012125	GATT	2	8	53646	53653	25 %	50 %	25 %	0 %	224581889
127	NC_012125	GATC	2	8	54015	54022	25 %	25 %	25 %	25 %	224581889
128	NC_012125	CTGG	2	8	55140	55147	0 %	25 %	50 %	25 %	224581890
129	NC_012125	GTGG	2	8	55305	55312	0 %	25 %	75 %	0 %	224581890
130	NC_012125	CTGC	2	8	55515	55522	0 %	25 %	25 %	50 %	224581891
131	NC_012125	ACCA	2	8	56151	56158	50 %	0 %	0 %	50 %	224581892
132	NC_012125	GTGG	2	8	56186	56193	0 %	25 %	75 %	0 %	224581892
133	NC_012125	CATT	2	8	56376	56383	25 %	50 %	0 %	25 %	224581892
134	NC_012125	TCAA	2	8	57417	57424	50 %	25 %	0 %	25 %	224581892
135	NC_012125	TACT	2	8	57736	57743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012125	TTTC	2	8	57744	57751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012125	CGCC	2	8	57831	57838	0 %	0 %	25 %	75 %	224581893
138	NC_012125	GCCA	2	8	59003	59010	25 %	0 %	25 %	50 %	224581893
139	NC_012125	GCTG	2	8	59394	59401	0 %	25 %	50 %	25 %	224581894
140	NC_012125	CCAG	2	8	60426	60433	25 %	0 %	25 %	50 %	224581894
141	NC_012125	TTCA	2	8	61144	61151	25 %	50 %	0 %	25 %	224581895
142	NC_012125	GAAG	2	8	61896	61903	50 %	0 %	50 %	0 %	224581896
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