MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 1951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012125	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012125	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012125	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012125	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012125	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012125	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012125	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012125	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012125	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012125	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012125	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012125	AAAT	2	8	33147	33154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012125	TTCT	2	8	33178	33185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012125	GTTA	2	8	33351	33358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012125	GGTC	2	8	33499	33506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012125	TAAA	2	8	33540	33547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012125	GGAC	2	8	33677	33684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012125	ATAC	2	8	34447	34454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012125	CTTA	2	8	34943	34950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012125	CCGA	2	8	36946	36953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012125	CCTG	2	8	38707	38714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012125	AACG	2	8	40212	40219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012125	TGAC	2	8	40296	40303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012125	TACC	2	8	42575	42582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012125	AGTA	2	8	46191	46198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012125	ATCA	2	8	46231	46238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012125	GAAA	2	8	46351	46358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012125	AGGG	2	8	46384	46391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012125	TACT	2	8	57736	57743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012125	TTTC	2	8	57744	57751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012125	TAAT	2	8	62751	62758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012125	TTAA	2	8	62782	62789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012125	GCCA	2	8	69695	69702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012125	ACTG	2	8	69903	69910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012125	ATTT	2	8	82311	82318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012125	GTTT	2	8	82338	82345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012125	TTTA	2	8	82493	82500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012125	ATTG	2	8	82504	82511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012125	TTTC	2	8	89703	89710	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012125	TTAT	2	8	89888	89895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012125	ATCA	2	8	100020	100027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012125	AATG	2	8	103499	103506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012125	TTTA	2	8	110473	110480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012125	GTTT	2	8	110606	110613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012125	TAAA	2	8	110697	110704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012125	GCCA	2	8	112261	112268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012125	GGAC	2	8	112528	112535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012125	GGCG	2	8	112873	112880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012125	GTCA	2	8	113023	113030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012125	GCTG	2	8	113550	113557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012125	TCCA	2	8	115328	115335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012125	CAGG	2	8	115382	115389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012125	CTGG	2	8	122666	122673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012125	TTTG	2	8	128142	128149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012125	TTTG	2	8	128453	128460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012125	TTGC	2	8	128688	128695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012125	AGCG	2	8	130114	130121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012125	CAGG	2	8	132476	132483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012125	CAAA	2	8	133716	133723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012125	CTTT	2	8	133798	133805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012125	CTTG	2	8	134198	134205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012125	GTGG	2	8	137851	137858	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012125	TTTA	2	8	152985	152992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012125	CGGT	2	8	155777	155784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012125	GGCA	2	8	157331	157338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012125	CTGG	2	8	161164	161171	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012125	ATTT	2	8	170914	170921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012125	AAAG	2	8	171031	171038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012125	ATTT	2	8	171080	171087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012125	TCAA	2	8	171270	171277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012125	TAGA	2	8	172282	172289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012125	CGGC	2	8	176893	176900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012125	GAAA	2	8	178177	178184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012125	TGCC	2	8	181575	181582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012125	TCCT	2	8	185032	185039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012125	GATG	2	8	185403	185410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012125	CATT	2	8	185752	185759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012125	AAAT	2	8	185760	185767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012125	TTGA	2	8	186566	186573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012125	TTTA	2	8	186590	186597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012125	GAAT	2	8	197140	197147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012125	AAGT	2	8	198591	198598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012125	ATAA	2	8	204018	204025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012125	GTTT	2	8	205539	205546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012125	AACG	2	8	212812	212819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012125	ACGC	2	8	213413	213420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012125	ATAA	2	8	219985	219992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012125	AAAT	2	8	226626	226633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012125	AAAT	2	8	226703	226710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012125	CTTG	2	8	226800	226807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012125	TTTG	2	8	226809	226816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012125	TAAA	2	8	226863	226870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012125	TTAT	2	8	226925	226932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012125	CCGC	2	8	230819	230826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_012125	CCAG	2	8	230967	230974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012125	AGGC	2	8	237691	237698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012125	ATAA	2	8	246560	246567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012125	TCAG	2	8	250213	250220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012125	ACTG	2	8	250305	250312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012125	GAAA	2	8	252573	252580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012125	TTAG	2	8	258660	258667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012125	GCAG	2	8	270460	270467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012125	CCGG	2	8	275382	275389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012125	GCTG	2	8	275761	275768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012125	CTGC	2	8	275976	275983	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012125	AATG	2	8	281721	281728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012125	ATCA	2	8	284461	284468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012125	CGGT	2	8	285239	285246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012125	GTAG	2	8	286923	286930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012125	GAAA	2	8	287034	287041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012125	CTGA	2	8	287977	287984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012125	GTAC	2	8	288061	288068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012125	CGTC	2	8	288504	288511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012125	AAAG	2	8	288627	288634	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012125	AGTC	2	8	289290	289297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012125	GCTG	2	8	289308	289315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012125	CCTG	2	8	290877	290884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012125	CCGT	2	8	290912	290919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012125	AGTG	2	8	294162	294169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012125	CCTG	2	8	300317	300324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012125	CCGT	2	8	300352	300359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012125	TATT	2	8	306864	306871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012125	ATTT	2	8	312033	312040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012125	GTCT	2	8	317912	317919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012125	TATT	2	8	324105	324112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012125	TAAA	2	8	332344	332351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012125	GCTG	2	8	332372	332379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012125	GTGA	2	8	332395	332402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012125	GTCA	2	8	332544	332551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012125	ATTT	2	8	333223	333230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012125	TGCT	2	8	334541	334548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012125	GGAT	2	8	334847	334854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012125	AATC	2	8	335239	335246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012125	AAGG	2	8	336146	336153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012125	GTCA	2	8	336193	336200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012125	ATGT	2	8	336327	336334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012125	GTCA	2	8	338342	338349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012125	GGCA	2	8	338733	338740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012125	CGCA	2	8	338921	338928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012125	ACAG	2	8	339017	339024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012125	AGTC	2	8	339566	339573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012125	TCAG	2	8	339881	339888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012125	ATTT	2	8	341211	341218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012125	TTTG	2	8	341319	341326	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012125	GTTT	2	8	341371	341378	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012125	GATG	2	8	342971	342978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012125	TGCC	2	8	346110	346117	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012125	CTTG	2	8	349527	349534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012125	GTTG	2	8	350363	350370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012125	CCGT	2	8	363424	363431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012125	AAAG	2	8	365320	365327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_012125	AACA	2	8	1225579	1225586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
446	NC_012125	GCTT	2	8	1235972	1235979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
447	NC_012125	AATA	2	8	1243647	1243654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_012125	TTAT	2	8	1243699	1243706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_012125	CAAT	2	8	1243721	1243728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
450	NC_012125	TAAA	2	8	1244088	1244095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012125	CATC	2	8	1244789	1244796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_012125	AACA	2	8	1245426	1245433	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
453	NC_012125	ACCG	2	8	1245471	1245478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
454	NC_012125	TTCG	2	8	1246413	1246420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
455	NC_012125	TACG	2	8	1247177	1247184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
456	NC_012125	CGAT	2	8	1247287	1247294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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460	NC_012125	TTTC	2	8	1261282	1261289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
461	NC_012125	GGCG	2	8	1275108	1275115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
462	NC_012125	TGGT	2	8	1276286	1276293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_012125	TTAA	2	8	1279864	1279871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_012125	AAAG	2	8	1279874	1279881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
466	NC_012125	GGGA	2	8	1282529	1282536	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
467	NC_012125	CCAG	2	8	1295916	1295923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
468	NC_012125	TTAT	2	8	1296160	1296167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_012125	ATCT	2	8	1302479	1302486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
470	NC_012125	TTAA	2	8	1303334	1303341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012125	GCAA	2	8	1303390	1303397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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473	NC_012125	GTTT	2	8	1310380	1310387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
474	NC_012125	AATA	2	8	1317055	1317062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_012125	ATTT	2	8	1321549	1321556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_012125	TTTG	2	8	1321823	1321830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_012125	ATAG	2	8	1326997	1327004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_012125	AATG	2	8	1334693	1334700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_012125	GGAA	2	8	1335012	1335019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_012125	TATC	2	8	1335713	1335720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
484	NC_012125	TCGT	2	8	1336736	1336743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_012125	CCCA	2	8	1336831	1336838	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
486	NC_012125	AATG	2	8	1336865	1336872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_012125	GATG	2	8	1339203	1339210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
488	NC_012125	TATG	2	8	1339400	1339407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
489	NC_012125	TCCA	2	8	1339411	1339418	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
490	NC_012125	TCTT	2	8	1340144	1340151	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
491	NC_012125	AATG	2	8	1342838	1342845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_012125	GAAT	2	8	1343023	1343030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_012125	AGTG	2	8	1343340	1343347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
494	NC_012125	ACTG	2	8	1343465	1343472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_012125	AGGT	2	8	1343993	1344000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
496	NC_012125	ATTT	2	8	1344664	1344671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_012125	TGTC	2	8	1345042	1345049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_012125	GCTA	2	8	1345211	1345218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_012125	AACT	2	8	1345756	1345763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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