MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 9472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012125	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012125	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	224581840
3	NC_012125	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	224581840
4	NC_012125	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	224581840
5	NC_012125	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	224581840
6	NC_012125	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	224581840
7	NC_012125	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	224581840
8	NC_012125	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	224581840
9	NC_012125	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	224581840
10	NC_012125	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	224581841
11	NC_012125	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	224581841
12	NC_012125	TC	3	6	3907	3912	0 %	50 %	0 %	50 %	224581842
13	NC_012125	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	224581842
14	NC_012125	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	224581842
15	NC_012125	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	224581842
16	NC_012125	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	224581843
17	NC_012125	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	224581843
18	NC_012125	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	224581843
19	NC_012125	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	224581843
20	NC_012125	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	224581844
21	NC_012125	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	224581844
22	NC_012125	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	224581845
23	NC_012125	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	224581845
24	NC_012125	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	224581845
25	NC_012125	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	224581845
26	NC_012125	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	224581846
27	NC_012125	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	224581847
28	NC_012125	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	224581848
29	NC_012125	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	224581851
30	NC_012125	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	224581852
31	NC_012125	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	224581852
32	NC_012125	AT	3	6	15372	15377	50 %	50 %	0 %	0 %	224581854
33	NC_012125	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	224581854
34	NC_012125	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	224581854
35	NC_012125	GA	3	6	17064	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	224581857
36	NC_012125	GC	3	6	18366	18371	0 %	0 %	50 %	50 %	224581858
37	NC_012125	CT	3	6	20340	20345	0 %	50 %	0 %	50 %	224581859
38	NC_012125	GC	3	6	20656	20661	0 %	0 %	50 %	50 %	224581859
39	NC_012125	GC	3	6	20776	20781	0 %	0 %	50 %	50 %	224581859
40	NC_012125	GC	3	6	21181	21186	0 %	0 %	50 %	50 %	224581859
41	NC_012125	GC	3	6	22039	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	224581859
42	NC_012125	CT	3	6	22794	22799	0 %	50 %	0 %	50 %	224581859
43	NC_012125	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	224581860
44	NC_012125	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	224581860
45	NC_012125	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	224581860
46	NC_012125	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012125	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	224581862
48	NC_012125	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	224581862
49	NC_012125	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	224581862
50	NC_012125	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012125	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012125	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012125	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012125	GT	3	6	28355	28360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012125	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012125	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	224581863
57	NC_012125	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	224581863
58	NC_012125	GA	3	6	29113	29118	50 %	0 %	50 %	0 %	224581863
59	NC_012125	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	224581865
60	NC_012125	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	224581865
61	NC_012125	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012125	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	224581866
63	NC_012125	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	224581866
64	NC_012125	AT	3	6	34899	34904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012125	AT	3	6	35235	35240	50 %	50 %	0 %	0 %	224581873
66	NC_012125	CT	3	6	36154	36159	0 %	50 %	0 %	50 %	521145197
67	NC_012125	GT	3	6	37334	37339	0 %	50 %	50 %	0 %	224581874
68	NC_012125	GC	3	6	38223	38228	0 %	0 %	50 %	50 %	224581874
69	NC_012125	TC	3	6	38394	38399	0 %	50 %	0 %	50 %	224581874
70	NC_012125	GC	3	6	39208	39213	0 %	0 %	50 %	50 %	224581875
71	NC_012125	TA	3	6	39254	39259	50 %	50 %	0 %	0 %	224581875
72	NC_012125	GT	3	6	39565	39570	0 %	50 %	50 %	0 %	224581875
73	NC_012125	GA	3	6	39867	39872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012125	TA	3	6	40364	40369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012125	GA	3	6	40431	40436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012125	TA	3	6	41063	41068	50 %	50 %	0 %	0 %	224581876
77	NC_012125	TG	3	6	41444	41449	0 %	50 %	50 %	0 %	224581876
78	NC_012125	GC	4	8	41583	41590	0 %	0 %	50 %	50 %	224581876
79	NC_012125	GA	3	6	42497	42502	50 %	0 %	50 %	0 %	224581877
80	NC_012125	GC	3	6	43306	43311	0 %	0 %	50 %	50 %	224581878
81	NC_012125	CG	4	8	43564	43571	0 %	0 %	50 %	50 %	224581878
82	NC_012125	CG	3	6	43777	43782	0 %	0 %	50 %	50 %	224581878
83	NC_012125	TG	3	6	44395	44400	0 %	50 %	50 %	0 %	224581878
84	NC_012125	GC	3	6	45463	45468	0 %	0 %	50 %	50 %	224581879
85	NC_012125	GC	3	6	46766	46771	0 %	0 %	50 %	50 %	224581880
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87	NC_012125	CG	3	6	47519	47524	0 %	0 %	50 %	50 %	224581882
88	NC_012125	CG	3	6	48607	48612	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
89	NC_012125	GC	3	6	49280	49285	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
90	NC_012125	CG	3	6	49354	49359	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
91	NC_012125	CG	3	6	50088	50093	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
92	NC_012125	CG	3	6	50343	50348	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
93	NC_012125	GC	3	6	51262	51267	0 %	0 %	50 %	50 %	224581884
94	NC_012125	GC	3	6	52138	52143	0 %	0 %	50 %	50 %	224581887
95	NC_012125	GC	4	8	52368	52375	0 %	0 %	50 %	50 %	224581887
96	NC_012125	TG	3	6	54977	54982	0 %	50 %	50 %	0 %	224581890
97	NC_012125	TC	3	6	55381	55386	0 %	50 %	0 %	50 %	224581891
98	NC_012125	AT	3	6	57318	57323	50 %	50 %	0 %	0 %	224581892
99	NC_012125	GC	4	8	58374	58381	0 %	0 %	50 %	50 %	224581893
100	NC_012125	GC	3	6	58839	58844	0 %	0 %	50 %	50 %	224581893
101	NC_012125	AT	3	6	62416	62421	50 %	50 %	0 %	0 %	224581896
102	NC_012125	GC	3	6	63295	63300	0 %	0 %	50 %	50 %	224581897
103	NC_012125	GC	3	6	63869	63874	0 %	0 %	50 %	50 %	224581897
104	NC_012125	AC	3	6	63921	63926	50 %	0 %	0 %	50 %	224581897
105	NC_012125	AG	3	6	64067	64072	50 %	0 %	50 %	0 %	224581898
106	NC_012125	CG	3	6	64146	64151	0 %	0 %	50 %	50 %	224581898
107	NC_012125	GC	3	6	64174	64179	0 %	0 %	50 %	50 %	224581898
108	NC_012125	GC	3	6	64220	64225	0 %	0 %	50 %	50 %	224581898
109	NC_012125	CG	3	6	64803	64808	0 %	0 %	50 %	50 %	224581899
110	NC_012125	CG	3	6	65083	65088	0 %	0 %	50 %	50 %	224581899
111	NC_012125	TG	3	6	65724	65729	0 %	50 %	50 %	0 %	224581900
112	NC_012125	GC	3	6	66235	66240	0 %	0 %	50 %	50 %	224581900
113	NC_012125	GC	3	6	66542	66547	0 %	0 %	50 %	50 %	224581900
114	NC_012125	GC	3	6	66719	66724	0 %	0 %	50 %	50 %	224581901
115	NC_012125	CG	3	6	67580	67585	0 %	0 %	50 %	50 %	224581902
116	NC_012125	GC	3	6	67726	67731	0 %	0 %	50 %	50 %	224581902
117	NC_012125	TC	3	6	68113	68118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012125	GC	3	6	68222	68227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012125	AT	3	6	69157	69162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012125	AT	3	6	69543	69548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012125	CT	3	6	70251	70256	0 %	50 %	0 %	50 %	224581906
122	NC_012125	GC	3	6	71419	71424	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
123	NC_012125	CG	3	6	71555	71560	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
124	NC_012125	TC	3	6	71717	71722	0 %	50 %	0 %	50 %	224581907
125	NC_012125	CG	3	6	72031	72036	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
126	NC_012125	GC	5	10	73077	73086	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
127	NC_012125	CG	3	6	73137	73142	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
128	NC_012125	GC	3	6	73722	73727	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
129	NC_012125	GC	3	6	74221	74226	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
130	NC_012125	TG	3	6	74629	74634	0 %	50 %	50 %	0 %	224581908
131	NC_012125	CG	3	6	75280	75285	0 %	0 %	50 %	50 %	224581909
132	NC_012125	CT	3	6	75360	75365	0 %	50 %	0 %	50 %	224581909
133	NC_012125	CG	3	6	75954	75959	0 %	0 %	50 %	50 %	224581910
134	NC_012125	CG	4	8	76022	76029	0 %	0 %	50 %	50 %	224581910
135	NC_012125	GT	4	8	78569	78576	0 %	50 %	50 %	0 %	224581912
136	NC_012125	TC	3	6	80222	80227	0 %	50 %	0 %	50 %	224581913
137	NC_012125	GC	3	6	80487	80492	0 %	0 %	50 %	50 %	224581913
138	NC_012125	GC	4	8	81108	81115	0 %	0 %	50 %	50 %	224581914
139	NC_012125	TG	3	6	82651	82656	0 %	50 %	50 %	0 %	224581915
140	NC_012125	CT	3	6	82994	82999	0 %	50 %	0 %	50 %	224581916
141	NC_012125	AC	3	6	83059	83064	50 %	0 %	0 %	50 %	224581916
142	NC_012125	CT	4	8	83213	83220	0 %	50 %	0 %	50 %	224581916
143	NC_012125	GC	3	6	83619	83624	0 %	0 %	50 %	50 %	224581917
144	NC_012125	GC	3	6	84369	84374	0 %	0 %	50 %	50 %	224581917
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