MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 plasmid pSPCV

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012124	GAAT	2	8	1139	1146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012124	ATAA	2	8	1292	1299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012124	GCGG	2	8	6122	6129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012124	CAGG	2	8	8304	8311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012124	GGCT	2	8	9351	9358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012124	GTGA	2	8	15769	15776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012124	AGCC	2	8	17593	17600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012124	TTTA	2	8	18216	18223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012124	TTTA	2	8	23350	23357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012124	GACC	2	8	24323	24330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012124	GGGC	2	8	25062	25069	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012124	TTAT	3	12	25112	25123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012124	GCCA	2	8	26543	26550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012124	ACTT	2	8	26941	26948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012124	CCCG	2	8	29179	29186	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_012124	CTGC	2	8	29484	29491	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012124	CCAG	2	8	29687	29694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012124	CGGC	2	8	29951	29958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012124	ACTC	2	8	31310	31317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012124	CCGG	2	8	32237	32244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012124	CCAG	2	8	32441	32448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012124	CACG	2	8	32543	32550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012124	GACA	2	8	33183	33190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012124	CGTC	2	8	33971	33978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012124	TCAG	2	8	34045	34052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012124	GCCG	2	8	34559	34566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012124	GAAA	2	8	34823	34830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012124	GTTT	2	8	34849	34856	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012124	GCCG	2	8	34885	34892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012124	CACG	2	8	34973	34980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012124	GTGG	2	8	35030	35037	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012124	AAAG	2	8	37327	37334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012124	AATT	2	8	37354	37361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012124	ATTT	2	8	37574	37581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012124	ATTT	2	8	37605	37612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012124	GTCA	2	8	37646	37653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012124	AAAT	2	8	43974	43981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012124	GCAA	2	8	44206	44213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012124	CAAA	2	8	48107	48114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012124	ACTA	2	8	48126	48133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012124	ACAA	2	8	48134	48141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012124	CGGG	2	8	48225	48232	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012124	AGAC	2	8	48317	48324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012124	AAAT	2	8	48870	48877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012124	TTCG	2	8	54959	54966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.