MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 plasmid pSPCV

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012124	A	6	6	19	24	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
2	NC_012124	A	6	6	318	323	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
3	NC_012124	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
4	NC_012124	A	6	6	514	519	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
5	NC_012124	T	7	7	618	624	0 %	100 %	0 %	0 %	224504236
6	NC_012124	T	6	6	4295	4300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012124	A	6	6	4309	4314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012124	A	8	8	4346	4353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012124	C	6	6	5233	5238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_012124	T	6	6	5330	5335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012124	A	6	6	5444	5449	100 %	0 %	0 %	0 %	224504240
12	NC_012124	A	6	6	5910	5915	100 %	0 %	0 %	0 %	224504240
13	NC_012124	A	7	7	5978	5984	100 %	0 %	0 %	0 %	224504240
14	NC_012124	T	6	6	6046	6051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012124	A	6	6	6833	6838	100 %	0 %	0 %	0 %	224504242
16	NC_012124	T	6	6	7893	7898	0 %	100 %	0 %	0 %	224504244
17	NC_012124	T	6	6	9358	9363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012124	C	6	6	9432	9437	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_012124	C	6	6	9602	9607	0 %	0 %	0 %	100 %	224504247
20	NC_012124	T	6	6	10882	10887	0 %	100 %	0 %	0 %	224504249
21	NC_012124	T	6	6	12222	12227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012124	T	6	6	12534	12539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012124	T	6	6	13279	13284	0 %	100 %	0 %	0 %	224504253
24	NC_012124	A	7	7	14211	14217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012124	A	6	6	14673	14678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012124	T	6	6	15927	15932	0 %	100 %	0 %	0 %	224504257
27	NC_012124	T	6	6	16020	16025	0 %	100 %	0 %	0 %	224504258
28	NC_012124	T	6	6	16229	16234	0 %	100 %	0 %	0 %	224504258
29	NC_012124	T	7	7	16378	16384	0 %	100 %	0 %	0 %	224504258
30	NC_012124	A	7	7	16402	16408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012124	T	7	7	16623	16629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012124	T	6	6	16748	16753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012124	T	6	6	16801	16806	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
34	NC_012124	T	6	6	16808	16813	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
35	NC_012124	T	6	6	16863	16868	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
36	NC_012124	T	8	8	16925	16932	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
37	NC_012124	T	6	6	16935	16940	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
38	NC_012124	A	6	6	17643	17648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012124	A	6	6	19472	19477	100 %	0 %	0 %	0 %	224504262
40	NC_012124	G	6	6	19612	19617	0 %	0 %	100 %	0 %	224504262
41	NC_012124	G	6	6	20130	20135	0 %	0 %	100 %	0 %	224504262
42	NC_012124	G	6	6	20742	20747	0 %	0 %	100 %	0 %	224504262
43	NC_012124	G	9	9	21844	21852	0 %	0 %	100 %	0 %	224504264
44	NC_012124	G	7	7	22309	22315	0 %	0 %	100 %	0 %	224504265
45	NC_012124	A	6	6	22992	22997	100 %	0 %	0 %	0 %	224504265
46	NC_012124	G	6	6	23535	23540	0 %	0 %	100 %	0 %	224504266
47	NC_012124	C	6	6	23932	23937	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_012124	C	6	6	23961	23966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_012124	T	6	6	24578	24583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012124	T	6	6	26768	26773	0 %	100 %	0 %	0 %	224504272
51	NC_012124	T	8	8	28188	28195	0 %	100 %	0 %	0 %	224504275
52	NC_012124	A	6	6	28465	28470	100 %	0 %	0 %	0 %	224504276
53	NC_012124	C	14	14	30342	30355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_012124	G	6	6	30404	30409	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012124	A	6	6	34708	34713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012124	A	6	6	34806	34811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012124	T	6	6	35332	35337	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
58	NC_012124	T	7	7	36179	36185	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
59	NC_012124	T	6	6	36318	36323	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
60	NC_012124	T	6	6	36820	36825	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
61	NC_012124	A	6	6	36931	36936	100 %	0 %	0 %	0 %	224504277
62	NC_012124	T	6	6	37389	37394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012124	T	7	7	38402	38408	0 %	100 %	0 %	0 %	224504278
64	NC_012124	A	8	8	38734	38741	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
65	NC_012124	A	7	7	38750	38756	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
66	NC_012124	A	7	7	38819	38825	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
67	NC_012124	A	6	6	38849	38854	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
68	NC_012124	A	7	7	38876	38882	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
69	NC_012124	T	6	6	38913	38918	0 %	100 %	0 %	0 %	224504280
70	NC_012124	T	7	7	38936	38942	0 %	100 %	0 %	0 %	224504280
71	NC_012124	T	6	6	38986	38991	0 %	100 %	0 %	0 %	224504281
72	NC_012124	T	6	6	39078	39083	0 %	100 %	0 %	0 %	224504281
73	NC_012124	T	7	7	39092	39098	0 %	100 %	0 %	0 %	224504281
74	NC_012124	A	7	7	40515	40521	100 %	0 %	0 %	0 %	224504283
75	NC_012124	C	6	6	41110	41115	0 %	0 %	0 %	100 %	224504283
76	NC_012124	T	8	8	43934	43941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012124	A	6	6	44224	44229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012124	T	6	6	44285	44290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012124	A	6	6	44670	44675	100 %	0 %	0 %	0 %	224504286
80	NC_012124	C	6	6	49160	49165	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_012124	A	6	6	50070	50075	100 %	0 %	0 %	0 %	224504293
82	NC_012124	T	6	6	50289	50294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012124	A	6	6	52970	52975	100 %	0 %	0 %	0 %	224504296
84	NC_012124	G	6	6	53728	53733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012124	T	6	6	55110	55115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012124	T	6	6	55378	55383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012124	A	9	9	55397	55405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.