MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nautilia profundicola AmH chromosome

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012115	TAATAT	2	12	15128	15139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012115	AAATTA	2	12	120912	120923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012115	TATAAA	2	12	120948	120959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012115	ATATAA	2	12	139356	139367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012115	AAGAGG	2	12	141276	141287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012115	AAGCGA	2	12	142289	142300	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012115	TAGGGC	2	12	142535	142546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012115	TTGGTT	2	12	160861	160872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012115	AAATCA	2	12	184277	184288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012115	AATTTA	2	12	219290	219301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012115	TTTATA	2	12	248283	248294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012115	TAAAAT	2	12	298538	298549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012115	AGTTGC	2	12	326547	326558	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012115	TGAAAA	2	12	354941	354952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012115	AAAATT	2	12	359626	359637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012115	AGATTG	2	12	363755	363766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012115	GTTATA	2	12	367697	367708	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012115	ATGAGA	2	12	396207	396218	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012115	AGATTA	2	12	396292	396303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012115	CTTTTT	2	12	442988	442999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012115	AAAATT	2	12	449354	449365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012115	CAAAAC	2	12	462289	462300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012115	TAATGA	2	12	466299	466310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012115	GGTGCG	2	12	576661	576672	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012115	AAACAG	2	12	577652	577663	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012115	CTTTTT	2	12	589104	589115	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012115	ATTAAA	2	12	603408	603419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012115	CTTTTT	2	12	624401	624412	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012115	TATTAA	2	12	641655	641666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012115	AAGAGG	2	12	643564	643575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012115	AAGCGA	2	12	644577	644588	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012115	TAGGGC	2	12	644823	644834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012115	AAAATT	2	12	655344	655355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012115	AAAATT	2	12	724594	724605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012115	AAAGAA	2	12	730617	730628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012115	ATTTAT	2	12	734020	734031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012115	AAAAGA	2	12	772697	772708	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012115	AAAATG	2	12	880050	880061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012115	GCAAGG	2	12	881363	881374	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012115	ATTAAA	2	12	923447	923458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012115	TTTTCA	2	12	937271	937282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012115	TTAGAG	2	12	949576	949587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012115	AATTAA	2	12	980054	980065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012115	TAGGAG	2	12	1085157	1085168	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012115	AGTCAA	2	12	1141675	1141686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012115	AATTTT	2	12	1203422	1203433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012115	TTTTAT	2	12	1214714	1214725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012115	AAAATT	2	12	1221251	1221262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012115	GATATT	2	12	1299945	1299956	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012115	AACTAT	2	12	1306658	1306669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012115	TAACAA	2	12	1330653	1330664	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012115	AATAAA	2	12	1330682	1330693	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012115	ATTTTT	2	12	1346695	1346706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012115	AATTAA	2	12	1397674	1397685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012115	TTCCCG	2	12	1407333	1407344	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012115	AATATT	2	12	1411038	1411049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012115	GGAATG	2	12	1413080	1413091	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012115	TTTTTC	2	12	1496595	1496606	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012115	TTATAC	2	12	1496751	1496762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012115	AATCAA	2	12	1514733	1514744	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012115	TCGCTT	2	12	1520963	1520974	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012115	ATTTTC	2	12	1535392	1535403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012115	TTTTAA	2	12	1554037	1554048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012115	CAAGTT	2	12	1590110	1590121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012115	TCGCTT	2	12	1636185	1636196	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.