MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nautilia profundicola AmH chromosome

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012115	AACTA	2	10	85049	85058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012115	ACTTA	2	10	85194	85203	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012115	TTTTG	2	10	90427	90436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012115	TATAA	2	10	134154	134163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012115	AAGAT	2	10	139217	139226	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012115	TATAA	2	10	139670	139679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012115	TCGTG	2	10	140808	140817	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012115	CGGAG	2	10	143206	143215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012115	CGCAG	2	10	143429	143438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012115	CCTGC	2	10	148681	148690	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012115	ATTAT	2	10	175436	175445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012115	TAGTT	2	10	184155	184164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012115	GAAGA	2	10	184489	184498	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012115	TGAAT	2	10	199259	199268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012115	TAAAA	2	10	200235	200244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012115	AAATA	2	10	207319	207328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012115	CTTTT	2	10	210591	210600	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012115	TCTTT	2	10	242960	242969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012115	ATAAA	2	10	244508	244517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012115	TAATT	2	10	244585	244594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012115	TAGTG	2	10	255566	255575	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012115	GGAAA	2	10	271875	271884	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012115	AAAAC	2	10	302613	302622	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012115	TAAAA	2	10	312812	312821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012115	TTTAT	2	10	326597	326606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012115	TTATT	2	10	343182	343191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012115	CATTA	2	10	363887	363896	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012115	AGGAA	2	10	364001	364010	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012115	ATAAA	2	10	367482	367491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012115	GAGCA	2	10	370566	370575	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012115	TAAAA	2	10	396119	396128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012115	TGTAT	2	10	428561	428570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012115	ATTAT	2	10	433001	433010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012115	AAGAA	2	10	447474	447483	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012115	TGAAA	2	10	456160	456169	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012115	AAAGA	2	10	483596	483605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012115	ATTGA	2	10	485732	485741	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012115	TTTTA	2	10	495758	495767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012115	AATTT	2	10	512703	512712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012115	AAATT	2	10	530535	530544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012115	TAAAT	2	10	530550	530559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012115	TCTTT	2	10	537560	537569	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012115	ATTAT	2	10	576625	576634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012115	CGAGC	2	10	576825	576834	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012115	AAGAA	2	10	578019	578028	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012115	ATATA	2	10	593624	593633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012115	TAAAA	2	10	624497	624506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012115	TAAAA	2	10	637474	637483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012115	AGAAA	2	10	641626	641635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012115	TAAAT	2	10	641700	641709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012115	TATAA	2	10	641958	641967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012115	TCGTG	2	10	643096	643105	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012115	CGGAG	2	10	645494	645503	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012115	CGCAG	2	10	645717	645726	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_012115	AAATA	2	10	658466	658475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012115	ATTAT	2	10	658499	658508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012115	TTTAA	2	10	658757	658766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012115	GGTGC	2	10	659733	659742	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012115	CTTTT	2	10	665310	665319	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012115	TGAAA	2	10	736317	736326	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012115	ATATA	2	10	739857	739866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012115	AAATA	2	10	765343	765352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012115	ATAAA	2	10	784539	784548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012115	AAATG	2	10	800814	800823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012115	ATTGA	2	10	808736	808745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012115	TAAAA	2	10	840843	840852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012115	TAAAA	2	10	845606	845615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012115	AATAA	2	10	857796	857805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012115	TATGA	2	10	872316	872325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012115	TATGT	2	10	881504	881513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012115	AATTC	2	10	881922	881931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012115	AATTA	2	10	881954	881963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012115	TTCAC	2	10	889337	889346	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_012115	TTAAT	2	10	900197	900206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012115	AATTT	2	10	907466	907475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012115	ATATT	2	10	908434	908443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012115	ATACA	2	10	918606	918615	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012115	AAACA	2	10	920549	920558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012115	TTCAT	2	10	932597	932606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012115	TAACT	2	10	942552	942561	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012115	TAAAG	2	10	955982	955991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012115	AAGAA	2	10	1001668	1001677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012115	CCAAA	2	10	1006323	1006332	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_012115	CCCTG	2	10	1011871	1011880	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_012115	AAAAG	2	10	1036144	1036153	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012115	ACAAT	2	10	1056836	1056845	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012115	AATAA	2	10	1056853	1056862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012115	TATAA	2	10	1124029	1124038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012115	TTACT	2	10	1126592	1126601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012115	TTTAA	2	10	1126614	1126623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012115	CAAAA	2	10	1137924	1137933	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_012115	TCTCC	2	10	1181721	1181730	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_012115	TTGAT	2	10	1188693	1188702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012115	ACTTC	2	10	1221196	1221205	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_012115	TACAT	2	10	1226011	1226020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012115	AAAAG	2	10	1229521	1229530	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012115	ACAAA	2	10	1240791	1240800	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_012115	TTTAA	2	10	1261138	1261147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012115	TAAAC	2	10	1299463	1299472	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012115	TTTAG	2	10	1302380	1302389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012115	ATATA	2	10	1320273	1320282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012115	TATAA	2	10	1332381	1332390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012115	CCAAT	2	10	1344494	1344503	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_012115	TTTTG	2	10	1349976	1349985	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012115	ATATA	2	10	1360443	1360452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012115	ATTGG	2	10	1377413	1377422	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012115	ATTTT	2	10	1377614	1377623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012115	ATTTT	2	10	1380120	1380129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012115	ATTTC	2	10	1395584	1395593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012115	ATAAA	2	10	1397691	1397700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012115	TATAT	2	10	1400900	1400909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012115	AATAA	2	10	1410655	1410664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012115	ATTAA	2	10	1411012	1411021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012115	CTTTT	2	10	1411101	1411110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012115	TTTTA	2	10	1411126	1411135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012115	TTCCT	2	10	1413101	1413110	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_012115	ATCTT	2	10	1413156	1413165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012115	CTTCT	2	10	1434149	1434158	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012115	TTTCA	2	10	1434798	1434807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012115	CTTTT	2	10	1434896	1434905	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012115	ATTTA	2	10	1435198	1435207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012115	ACCAA	2	10	1443128	1443137	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_012115	TAAAA	2	10	1456018	1456027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012115	TAAAA	2	10	1480792	1480801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012115	TAAAT	2	10	1496640	1496649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012115	TAAAT	2	10	1518401	1518410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012115	AAAGA	2	10	1518416	1518425	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012115	AGATT	2	10	1518477	1518486	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012115	GCGCT	2	10	1519822	1519831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_012115	CTCCG	2	10	1520048	1520057	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_012115	CACGA	2	10	1522446	1522455	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_012115	TTATA	2	10	1523584	1523593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012115	TGCCT	2	10	1527045	1527054	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_012115	CTTTT	2	10	1582423	1582432	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012115	TTTTC	2	10	1590068	1590077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012115	ATACA	2	10	1625769	1625778	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012115	TAGTA	2	10	1632326	1632335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012115	TAAAT	2	10	1633530	1633539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012115	TAAAA	2	10	1633541	1633550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012115	GCGCT	2	10	1635044	1635053	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_012115	CTCCG	2	10	1635270	1635279	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_012115	CACGA	2	10	1637668	1637677	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_012115	TTATA	2	10	1638806	1638815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012115	TATAT	2	10	1639059	1639068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012115	TTTAT	2	10	1643484	1643493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012115	TCAAT	2	10	1644211	1644220	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012115	AGAAA	2	10	1667895	1667904	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012115	TTAAA	2	10	1670759	1670768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012115	CTCTT	2	10	1674823	1674832	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.