MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nautilia profundicola AmH chromosome

Total Repeats: 20015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012115	TAA	2	6	157	162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372071
2	NC_012115	AGA	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372071
3	NC_012115	TAG	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372071
4	NC_012115	GCA	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372071
5	NC_012115	CCT	2	6	803	808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224372071
6	NC_012115	GCC	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224372071
7	NC_012115	ATC	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372071
8	NC_012115	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372071
9	NC_012115	AGA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372071
10	NC_012115	ATT	2	6	1265	1270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372071
11	NC_012115	TAA	2	6	1327	1332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372071
12	NC_012115	AGA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372071
13	NC_012115	AGA	2	6	1369	1374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372071
14	NC_012115	ATA	2	6	1582	1587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372072
15	NC_012115	AAT	2	6	1710	1715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372072
16	NC_012115	GAA	2	6	1801	1806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372072
17	NC_012115	GAA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372072
18	NC_012115	AAG	2	6	2043	2048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372072
19	NC_012115	TAT	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372072
20	NC_012115	ATA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372072
21	NC_012115	AAG	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372072
22	NC_012115	TAA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372072
23	NC_012115	GAT	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372072
24	NC_012115	ATT	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372072
25	NC_012115	TAA	2	6	2213	2218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372072
26	NC_012115	ATT	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372072
27	NC_012115	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372072
28	NC_012115	TGA	2	6	2382	2387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372072
29	NC_012115	AGA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372072
30	NC_012115	AGT	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372073
31	NC_012115	TAA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372073
32	NC_012115	GAA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
33	NC_012115	CTG	2	6	2879	2884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372073
34	NC_012115	GTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372073
35	NC_012115	GGT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372073
36	NC_012115	AGT	2	6	2976	2981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372073
37	NC_012115	ACT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372073
38	NC_012115	TGA	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372073
39	NC_012115	ACT	3	9	3145	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372073
40	NC_012115	TAC	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372073
41	NC_012115	AAG	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
42	NC_012115	CGA	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372073
43	NC_012115	ATG	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372073
44	NC_012115	ACA	2	6	3428	3433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372073
45	NC_012115	AAG	2	6	3560	3565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
46	NC_012115	GAA	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
47	NC_012115	TGC	3	9	3741	3749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372073
48	NC_012115	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
49	NC_012115	TGC	2	6	3762	3767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372073
50	NC_012115	GGA	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224372073
51	NC_012115	TTC	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372073
52	NC_012115	TAG	2	6	3999	4004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372073
53	NC_012115	ACA	2	6	4079	4084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372073
54	NC_012115	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372073
55	NC_012115	TTC	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372073
56	NC_012115	CCT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224372073
57	NC_012115	CTT	2	6	4369	4374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372073
58	NC_012115	GAA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
59	NC_012115	ATT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372073
60	NC_012115	ATT	2	6	4502	4507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372073
61	NC_012115	GAA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
62	NC_012115	ATT	2	6	4634	4639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372073
63	NC_012115	CTT	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372073
64	NC_012115	AGC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372073
65	NC_012115	ACA	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372073
66	NC_012115	GAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372073
67	NC_012115	AAG	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372073
68	NC_012115	AAG	2	6	5036	5041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372074
69	NC_012115	GTT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372074
70	NC_012115	TAA	2	6	5192	5197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372074
71	NC_012115	ATT	2	6	5294	5299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372074
72	NC_012115	AAG	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372075
73	NC_012115	AGC	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372075
74	NC_012115	TTC	2	6	5424	5429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372075
75	NC_012115	TTC	2	6	5478	5483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372075
76	NC_012115	GAA	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372075
77	NC_012115	ATT	2	6	5791	5796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372075
78	NC_012115	GCA	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372075
79	NC_012115	TTA	2	6	5870	5875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372075
80	NC_012115	CAC	2	6	5937	5942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372075
81	NC_012115	ATA	3	9	5980	5988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372075
82	NC_012115	CAA	2	6	6062	6067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372075
83	NC_012115	CTT	2	6	6176	6181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372075
84	NC_012115	CTT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372075
85	NC_012115	CCT	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224372076
86	NC_012115	TTA	2	6	6553	6558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372076
87	NC_012115	CTT	2	6	6693	6698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372076
88	NC_012115	TCT	3	9	6816	6824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372076
89	NC_012115	TGA	3	9	6875	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372076
90	NC_012115	GTT	2	6	6938	6943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372076
91	NC_012115	TGT	2	6	7120	7125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372076
92	NC_012115	TTA	2	6	7156	7161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372076
93	NC_012115	GTT	2	6	7404	7409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372076
94	NC_012115	TAA	2	6	7651	7656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372076
95	NC_012115	ATC	2	6	7706	7711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372076
96	NC_012115	TTC	3	9	7721	7729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372076
97	NC_012115	TAA	3	9	7816	7824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372076
98	NC_012115	TAT	2	6	7846	7851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372076
99	NC_012115	TTC	2	6	7877	7882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372076
100	NC_012115	GAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372076
101	NC_012115	TAT	2	6	7987	7992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372076
102	NC_012115	AGT	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372077
103	NC_012115	CTT	2	6	8157	8162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372077
104	NC_012115	TAT	2	6	8232	8237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
105	NC_012115	TAT	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
106	NC_012115	TTG	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372077
107	NC_012115	TGT	2	6	8311	8316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372077
108	NC_012115	TAT	2	6	8385	8390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
109	NC_012115	GTT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372077
110	NC_012115	TTG	2	6	8592	8597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372077
111	NC_012115	TAG	2	6	8622	8627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372077
112	NC_012115	AAG	2	6	8643	8648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372077
113	NC_012115	TTA	2	6	8738	8743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
114	NC_012115	TAT	3	9	8866	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
115	NC_012115	TCT	2	6	8894	8899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372077
116	NC_012115	AAT	2	6	8947	8952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372077
117	NC_012115	ATT	2	6	8990	8995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
118	NC_012115	GAA	2	6	9048	9053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372077
119	NC_012115	CTA	2	6	9078	9083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372077
120	NC_012115	ATT	2	6	9113	9118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
121	NC_012115	ATT	2	6	9263	9268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
122	NC_012115	TAA	3	9	9291	9299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372077
123	NC_012115	TAT	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
124	NC_012115	GGA	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224372077
125	NC_012115	TAA	2	6	9532	9537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372077
126	NC_012115	TAA	2	6	9610	9615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372077
127	NC_012115	ATA	2	6	9707	9712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372077
128	NC_012115	ATT	2	6	9764	9769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372078
129	NC_012115	TAT	3	9	9808	9816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372078
130	NC_012115	TAT	2	6	9853	9858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372078
131	NC_012115	TAA	2	6	9868	9873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372078
132	NC_012115	ATT	2	6	9954	9959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372078
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254	NC_012115	AAG	2	6	18521	18526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372090
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256	NC_012115	TGG	2	6	18725	18730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372090
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258	NC_012115	GGA	2	6	18806	18811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224372090
259	NC_012115	GAA	2	6	18845	18850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372090
260	NC_012115	GAA	2	6	18854	18859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372090
261	NC_012115	ATA	2	6	18924	18929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372090
262	NC_012115	ATC	2	6	18966	18971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372090
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281	NC_012115	AAT	2	6	20009	20014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372092
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289	NC_012115	AAT	2	6	20530	20535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372092
290	NC_012115	TTC	2	6	20585	20590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372092
291	NC_012115	ATT	2	6	20600	20605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372092
292	NC_012115	TTA	2	6	20617	20622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372092
293	NC_012115	GTA	2	6	20644	20649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372092
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383	NC_012115	GCC	2	6	29396	29401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224372103
384	NC_012115	ATA	2	6	29647	29652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372104
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494	NC_012115	ACA	2	6	38177	38182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372114
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498	NC_012115	AAG	3	9	38539	38547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372115
499	NC_012115	TGA	2	6	38635	38640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372115
500	NC_012115	GTG	2	6	38677	38682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372115

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