MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	AAAGAG	2	12	1073	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
2	NC_012109	AAAAAT	2	12	5523	5534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012109	ACTGTT	2	12	6318	6329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012109	CATTTT	2	12	6473	6484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012109	CTTTCT	2	12	6655	6666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372003
6	NC_012109	TGTTTT	2	12	6706	6717	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224372003
7	NC_012109	GTTCTT	2	12	6746	6757	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372003
8	NC_012109	GCAAGG	2	12	9447	9458	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	224372006
9	NC_012109	TTCTCT	2	12	9669	9680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
10	NC_012109	CCTGGG	2	12	9904	9915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	224372006
11	NC_012109	TAGGCA	2	12	14503	14514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224372012
12	NC_012109	TGGTCA	2	12	14987	14998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012109	GGAATG	2	12	17742	17753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	224372016
14	NC_012109	GGCTAT	2	12	21471	21482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224372018
15	NC_012109	CGTACC	2	12	26849	26860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	224372025
16	NC_012109	TGAAGC	2	12	27487	27498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224372026
17	NC_012109	ATTGAA	2	12	37576	37587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372032
18	NC_012109	TGGAGA	2	12	41924	41935	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	224372035
19	NC_012109	TTCCTT	2	12	43181	43192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372037
20	NC_012109	GTTTTG	2	12	47871	47882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012109	TTCCTT	2	12	48928	48939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372045
22	NC_012109	GTTTTG	2	12	53618	53629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372051
23	NC_012109	CGGCTT	2	12	54216	54227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012109	CGCAGC	2	12	56022	56033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	224372056
25	NC_012109	CTCTTG	2	12	56683	56694	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	224372057
26	NC_012109	TTTTGC	2	12	57146	57157	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372058
27	NC_012109	TTTTTA	2	12	57276	57287	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012109	AGGTGA	2	12	59022	59033	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	224372061
29	NC_012109	TTGCTT	2	12	61825	61836	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372064
30	NC_012109	TCCACG	2	12	62767	62778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	224372065
31	NC_012109	CAAAAA	2	12	65579	65590	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	224372067
32	NC_012109	TAACCC	2	12	67492	67503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.