MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	CCTAA	2	10	733	742	40 %	20 %	0 %	40 %	224371994
2	NC_012109	TTTTG	2	10	2423	2432	0 %	80 %	20 %	0 %	224371996
3	NC_012109	CTTTT	2	10	2674	2683	0 %	80 %	0 %	20 %	224371997
4	NC_012109	CTCAA	2	10	4284	4293	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012109	ATTAA	2	10	5859	5868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012109	TTAAA	2	10	6334	6343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012109	GGAAA	2	10	6969	6978	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012109	CCGAA	2	10	7985	7994	40 %	0 %	20 %	40 %	224372004
9	NC_012109	AATGT	2	10	8631	8640	40 %	40 %	20 %	0 %	224372004
10	NC_012109	TCCCC	2	10	8929	8938	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_012109	TATTT	2	10	9116	9125	20 %	80 %	0 %	0 %	224372006
12	NC_012109	AGGTA	2	10	10235	10244	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012109	AGCTC	2	10	11608	11617	20 %	20 %	20 %	40 %	224372009
14	NC_012109	GAACA	2	10	17632	17641	60 %	0 %	20 %	20 %	224372016
15	NC_012109	CCAAC	2	10	19134	19143	40 %	0 %	0 %	60 %	224372016
16	NC_012109	ATTTG	2	10	19722	19731	20 %	60 %	20 %	0 %	224372016
17	NC_012109	TGATT	2	10	21843	21852	20 %	60 %	20 %	0 %	224372018
18	NC_012109	TCTAA	2	10	21865	21874	40 %	40 %	0 %	20 %	224372018
19	NC_012109	TTTTA	2	10	22215	22224	20 %	80 %	0 %	0 %	224372018
20	NC_012109	TATCC	2	10	24109	24118	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012109	CATCC	2	10	24174	24183	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_012109	AAGAA	2	10	24695	24704	80 %	0 %	20 %	0 %	224372019
23	NC_012109	TGAAT	3	15	24897	24911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012109	ATGCA	2	10	25498	25507	40 %	20 %	20 %	20 %	224372021
25	NC_012109	AGCCA	2	10	26004	26013	40 %	0 %	20 %	40 %	224372023
26	NC_012109	CAACC	2	10	27949	27958	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_012109	CCCAC	2	10	27999	28008	20 %	0 %	0 %	80 %	224372027
28	NC_012109	ACTCA	2	10	32755	32764	40 %	20 %	0 %	40 %	224372029
29	NC_012109	CTCTT	2	10	33965	33974	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012109	TTTAT	2	10	34268	34277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012109	TCTCT	2	10	38859	38868	0 %	60 %	0 %	40 %	224372032
32	NC_012109	TTTCC	2	10	39009	39018	0 %	60 %	0 %	40 %	224372033
33	NC_012109	GGCCC	2	10	44989	44998	0 %	0 %	40 %	60 %	224372041
34	NC_012109	AGGAT	2	10	45519	45528	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012109	AGACC	2	10	46720	46729	40 %	0 %	20 %	40 %	224372043
36	NC_012109	GGCCC	2	10	50736	50745	0 %	0 %	40 %	60 %	224372048
37	NC_012109	AGGAT	2	10	51266	51275	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012109	AGACC	2	10	52467	52476	40 %	0 %	20 %	40 %	224372050
39	NC_012109	GACCA	2	10	54080	54089	40 %	0 %	20 %	40 %	224372051
40	NC_012109	AGCCG	2	10	54201	54210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_012109	ATTTC	2	10	54386	54395	20 %	60 %	0 %	20 %	224372052
42	NC_012109	AATCC	2	10	55743	55752	40 %	20 %	0 %	40 %	224372055
43	NC_012109	AATTG	2	10	56326	56335	40 %	40 %	20 %	0 %	224372056
44	NC_012109	TTTTG	2	10	56909	56918	0 %	80 %	20 %	0 %	224372057
45	NC_012109	ATTTG	2	10	60561	60570	20 %	60 %	20 %	0 %	224372062
46	NC_012109	TAACA	2	10	60752	60761	60 %	20 %	0 %	20 %	224372063
47	NC_012109	AATGC	2	10	62331	62340	40 %	20 %	20 %	20 %	224372064
48	NC_012109	CTCGT	2	10	64314	64323	0 %	40 %	20 %	40 %	224372066
49	NC_012109	CATTT	2	10	67567	67576	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.