MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	ATTG	2	8	580	587	25 %	50 %	25 %	0 %	224371994
2	NC_012109	ATAA	2	8	760	767	75 %	25 %	0 %	0 %	224371994
3	NC_012109	TTTC	3	12	964	975	0 %	75 %	0 %	25 %	224371994
4	NC_012109	AGCA	2	8	1179	1186	50 %	0 %	25 %	25 %	224371995
5	NC_012109	AGCA	2	8	1722	1729	50 %	0 %	25 %	25 %	224371995
6	NC_012109	GACA	3	12	1744	1755	50 %	0 %	25 %	25 %	224371995
7	NC_012109	ATCT	2	8	1773	1780	25 %	50 %	0 %	25 %	224371995
8	NC_012109	AAAG	2	8	2087	2094	75 %	0 %	25 %	0 %	224371995
9	NC_012109	ATGA	2	8	2129	2136	50 %	25 %	25 %	0 %	224371995
10	NC_012109	TGTT	2	8	2786	2793	0 %	75 %	25 %	0 %	224371998
11	NC_012109	CTGC	2	8	2989	2996	0 %	25 %	25 %	50 %	224371998
12	NC_012109	CTTT	2	8	3064	3071	0 %	75 %	0 %	25 %	224371999
13	NC_012109	ATTG	2	8	3657	3664	25 %	50 %	25 %	0 %	224372001
14	NC_012109	ACGG	2	8	3901	3908	25 %	0 %	50 %	25 %	224372001
15	NC_012109	GACC	2	8	4091	4098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012109	ACCT	2	8	4387	4394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012109	ATAG	2	8	4541	4548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012109	ATTT	2	8	4796	4803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012109	ATAG	2	8	5098	5105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012109	TTGC	2	8	5202	5209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012109	GCAA	2	8	5610	5617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012109	TTTG	2	8	5841	5848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012109	AATT	2	8	6240	6247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012109	AATA	2	8	6505	6512	75 %	25 %	0 %	0 %	224372003
25	NC_012109	GTCA	2	8	7005	7012	25 %	25 %	25 %	25 %	224372004
26	NC_012109	AAGA	2	8	7526	7533	75 %	0 %	25 %	0 %	224372004
27	NC_012109	CAAA	2	8	7553	7560	75 %	0 %	0 %	25 %	224372004
28	NC_012109	GATC	2	8	7590	7597	25 %	25 %	25 %	25 %	224372004
29	NC_012109	CAAA	2	8	9013	9020	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012109	ATTT	2	8	9154	9161	25 %	75 %	0 %	0 %	224372006
31	NC_012109	TTGA	2	8	9290	9297	25 %	50 %	25 %	0 %	224372006
32	NC_012109	TTTC	2	8	9574	9581	0 %	75 %	0 %	25 %	224372006
33	NC_012109	TTTA	2	8	10079	10086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012109	AGAT	2	8	10407	10414	50 %	25 %	25 %	0 %	224372007
35	NC_012109	GCCG	2	8	10606	10613	0 %	0 %	50 %	50 %	224372008
36	NC_012109	TCAA	2	8	10802	10809	50 %	25 %	0 %	25 %	224372008
37	NC_012109	CTGG	2	8	10938	10945	0 %	25 %	50 %	25 %	224372008
38	NC_012109	ACCA	2	8	10984	10991	50 %	0 %	0 %	50 %	224372008
39	NC_012109	TTTG	2	8	11494	11501	0 %	75 %	25 %	0 %	224372009
40	NC_012109	GTTG	2	8	11961	11968	0 %	50 %	50 %	0 %	224372010
41	NC_012109	TCTT	2	8	12024	12031	0 %	75 %	0 %	25 %	224372010
42	NC_012109	ACCT	2	8	12064	12071	25 %	25 %	0 %	50 %	224372010
43	NC_012109	ATGC	2	8	12410	12417	25 %	25 %	25 %	25 %	224372010
44	NC_012109	TCTT	2	8	12446	12453	0 %	75 %	0 %	25 %	224372010
45	NC_012109	TACT	2	8	12903	12910	25 %	50 %	0 %	25 %	224372011
46	NC_012109	AATG	2	8	13211	13218	50 %	25 %	25 %	0 %	224372011
47	NC_012109	GACA	2	8	13441	13448	50 %	0 %	25 %	25 %	224372011
48	NC_012109	GATC	2	8	14086	14093	25 %	25 %	25 %	25 %	224372011
49	NC_012109	CATC	2	8	15118	15125	25 %	25 %	0 %	50 %	224372013
50	NC_012109	CAAT	2	8	15130	15137	50 %	25 %	0 %	25 %	224372013
51	NC_012109	CATC	2	8	15199	15206	25 %	25 %	0 %	50 %	224372013
52	NC_012109	TGGC	2	8	16124	16131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012109	TTCG	2	8	16365	16372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012109	TGAA	2	8	16892	16899	50 %	25 %	25 %	0 %	224372016
55	NC_012109	AGAA	2	8	16955	16962	75 %	0 %	25 %	0 %	224372016
56	NC_012109	TGAA	2	8	17057	17064	50 %	25 %	25 %	0 %	224372016
57	NC_012109	ATGG	2	8	17414	17421	25 %	25 %	50 %	0 %	224372016
58	NC_012109	TTTA	2	8	17550	17557	25 %	75 %	0 %	0 %	224372016
59	NC_012109	GATG	2	8	17784	17791	25 %	25 %	50 %	0 %	224372016
60	NC_012109	TTCT	2	8	17875	17882	0 %	75 %	0 %	25 %	224372016
61	NC_012109	TTTC	2	8	18106	18113	0 %	75 %	0 %	25 %	224372016
62	NC_012109	TCAG	2	8	19121	19128	25 %	25 %	25 %	25 %	224372016
63	NC_012109	TGGT	2	8	20166	20173	0 %	50 %	50 %	0 %	224372017
64	NC_012109	GATC	2	8	20246	20253	25 %	25 %	25 %	25 %	224372017
65	NC_012109	GCGG	2	8	20374	20381	0 %	0 %	75 %	25 %	224372017
66	NC_012109	TCTA	2	8	20725	20732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012109	TTCG	2	8	20910	20917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012109	GAAT	2	8	21281	21288	50 %	25 %	25 %	0 %	224372018
69	NC_012109	TATT	2	8	21791	21798	25 %	75 %	0 %	0 %	224372018
70	NC_012109	TGAT	2	8	21854	21861	25 %	50 %	25 %	0 %	224372018
71	NC_012109	TTCT	2	8	21933	21940	0 %	75 %	0 %	25 %	224372018
72	NC_012109	TATT	2	8	22203	22210	25 %	75 %	0 %	0 %	224372018
73	NC_012109	ATGC	2	8	22267	22274	25 %	25 %	25 %	25 %	224372018
74	NC_012109	CCTC	2	8	22869	22876	0 %	25 %	0 %	75 %	224372018
75	NC_012109	CAAA	2	8	22944	22951	75 %	0 %	0 %	25 %	224372018
76	NC_012109	CGTT	2	8	22992	22999	0 %	50 %	25 %	25 %	224372018
77	NC_012109	AGAC	2	8	23229	23236	50 %	0 %	25 %	25 %	224372018
78	NC_012109	TTTA	2	8	23453	23460	25 %	75 %	0 %	0 %	224372018
79	NC_012109	AGAA	2	8	23526	23533	75 %	0 %	25 %	0 %	224372018
80	NC_012109	AGAA	2	8	24784	24791	75 %	0 %	25 %	0 %	224372019
81	NC_012109	GAAT	2	8	24836	24843	50 %	25 %	25 %	0 %	224372019
82	NC_012109	AACA	2	8	25163	25170	75 %	0 %	0 %	25 %	224372020
83	NC_012109	TTCA	2	8	25713	25720	25 %	50 %	0 %	25 %	224372022
84	NC_012109	GGTC	2	8	26530	26537	0 %	25 %	50 %	25 %	224372024
85	NC_012109	TGAT	2	8	27258	27265	25 %	50 %	25 %	0 %	224372026
86	NC_012109	AAAT	2	8	27628	27635	75 %	25 %	0 %	0 %	224372026
87	NC_012109	TGGT	2	8	28734	28741	0 %	50 %	50 %	0 %	224372027
88	NC_012109	TCAT	2	8	28818	28825	25 %	50 %	0 %	25 %	224372027
89	NC_012109	GGTT	2	8	29206	29213	0 %	50 %	50 %	0 %	224372027
90	NC_012109	GCAG	2	8	30325	30332	25 %	0 %	50 %	25 %	224372027
91	NC_012109	TGTC	2	8	30466	30473	0 %	50 %	25 %	25 %	224372027
92	NC_012109	AGCA	2	8	30483	30490	50 %	0 %	25 %	25 %	224372027
93	NC_012109	ATCC	2	8	31307	31314	25 %	25 %	0 %	50 %	224372027
94	NC_012109	TGCA	2	8	31780	31787	25 %	25 %	25 %	25 %	224372027
95	NC_012109	AATT	2	8	32280	32287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012109	TGAT	2	8	32468	32475	25 %	50 %	25 %	0 %	224372029
97	NC_012109	TTCA	2	8	32548	32555	25 %	50 %	0 %	25 %	224372029
98	NC_012109	AAGC	2	8	32792	32799	50 %	0 %	25 %	25 %	224372029
99	NC_012109	TTTG	2	8	32814	32821	0 %	75 %	25 %	0 %	224372029
100	NC_012109	GTTT	3	12	33237	33248	0 %	75 %	25 %	0 %	224372029
101	NC_012109	AAAG	2	8	33776	33783	75 %	0 %	25 %	0 %	224372029
102	NC_012109	ATTT	2	8	33943	33950	25 %	75 %	0 %	0 %	224372029
103	NC_012109	TCTT	2	8	33979	33986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012109	TTAA	2	8	34169	34176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012109	GTTG	2	8	35550	35557	0 %	50 %	50 %	0 %	224372031
106	NC_012109	GCCC	2	8	35632	35639	0 %	0 %	25 %	75 %	224372031
107	NC_012109	AGGC	2	8	36869	36876	25 %	0 %	50 %	25 %	224372032
108	NC_012109	TGGA	2	8	37055	37062	25 %	25 %	50 %	0 %	224372032
109	NC_012109	GATT	2	8	38010	38017	25 %	50 %	25 %	0 %	224372032
110	NC_012109	CAAA	2	8	38674	38681	75 %	0 %	0 %	25 %	224372032
111	NC_012109	ATTG	2	8	39987	39994	25 %	50 %	25 %	0 %	224372034
112	NC_012109	TTGT	2	8	40459	40466	0 %	75 %	25 %	0 %	224372034
113	NC_012109	ATCA	2	8	40516	40523	50 %	25 %	0 %	25 %	224372034
114	NC_012109	ACCG	2	8	41337	41344	25 %	0 %	25 %	50 %	224372034
115	NC_012109	GGCT	2	8	41882	41889	0 %	25 %	50 %	25 %	224372035
116	NC_012109	GCAG	2	8	42376	42383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012109	TGAT	2	8	42752	42759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012109	GTTG	2	8	42917	42924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012109	GGTC	2	8	43338	43345	0 %	25 %	50 %	25 %	224372037
120	NC_012109	TGTC	2	8	43466	43473	0 %	50 %	25 %	25 %	224372037
121	NC_012109	GTAA	2	8	45999	46006	50 %	25 %	25 %	0 %	224372042
122	NC_012109	TATT	2	8	46028	46035	25 %	75 %	0 %	0 %	224372042
123	NC_012109	ATAA	2	8	46086	46093	75 %	25 %	0 %	0 %	224372042
124	NC_012109	TAAG	2	8	46165	46172	50 %	25 %	25 %	0 %	224372042
125	NC_012109	TGCC	2	8	46178	46185	0 %	25 %	25 %	50 %	224372042
126	NC_012109	TTTC	2	8	46247	46254	0 %	75 %	0 %	25 %	224372042
127	NC_012109	AACA	2	8	46591	46598	75 %	0 %	0 %	25 %	224372043
128	NC_012109	TTTC	2	8	46610	46617	0 %	75 %	0 %	25 %	224372043
129	NC_012109	ATTT	2	8	46664	46671	25 %	75 %	0 %	0 %	224372043
130	NC_012109	AAAC	2	8	47387	47394	75 %	0 %	0 %	25 %	224372043
131	NC_012109	TATC	2	8	48047	48054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012109	GCAG	2	8	48123	48130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012109	TGAT	2	8	48499	48506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012109	GTTG	2	8	48664	48671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012109	GGTC	2	8	49085	49092	0 %	25 %	50 %	25 %	224372045
136	NC_012109	TGTC	2	8	49213	49220	0 %	50 %	25 %	25 %	224372045
137	NC_012109	GTAA	2	8	51746	51753	50 %	25 %	25 %	0 %	224372049
138	NC_012109	TATT	2	8	51775	51782	25 %	75 %	0 %	0 %	224372049
139	NC_012109	ATAA	2	8	51833	51840	75 %	25 %	0 %	0 %	224372049
140	NC_012109	TAAG	2	8	51912	51919	50 %	25 %	25 %	0 %	224372049
141	NC_012109	TGCC	2	8	51925	51932	0 %	25 %	25 %	50 %	224372049
142	NC_012109	TTTC	2	8	51994	52001	0 %	75 %	0 %	25 %	224372049
143	NC_012109	AACA	2	8	52338	52345	75 %	0 %	0 %	25 %	224372050
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.