MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	GACC	2	8	4091	4098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012109	ACCT	2	8	4387	4394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012109	ATAG	2	8	4541	4548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012109	ATTT	2	8	4796	4803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012109	ATAG	2	8	5098	5105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012109	TTGC	2	8	5202	5209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012109	GCAA	2	8	5610	5617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012109	TTTG	2	8	5841	5848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012109	AATT	2	8	6240	6247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012109	CAAA	2	8	9013	9020	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012109	TTTA	2	8	10079	10086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012109	TGGC	2	8	16124	16131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012109	TTCG	2	8	16365	16372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012109	TCTA	2	8	20725	20732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012109	TTCG	2	8	20910	20917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012109	AATT	2	8	32280	32287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012109	TCTT	2	8	33979	33986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012109	TTAA	2	8	34169	34176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012109	GCAG	2	8	42376	42383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012109	TGAT	2	8	42752	42759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012109	GTTG	2	8	42917	42924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012109	TATC	2	8	48047	48054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012109	GCAG	2	8	48123	48130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012109	TGAT	2	8	48499	48506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012109	GTTG	2	8	48664	48671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012109	GAAT	2	8	54228	54235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012109	CTGG	2	8	54922	54929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012109	GATG	2	8	55273	55280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012109	ATGC	2	8	58720	58727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012109	CGAA	2	8	60156	60163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012109	TCTA	2	8	60222	60229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012109	TAAA	2	8	61160	61167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012109	GAAC	2	8	63573	63580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012109	CGAA	2	8	63587	63594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012109	GCCA	2	8	66435	66442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012109	ATCT	2	8	67407	67414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.