MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	GGT	2	6	226	231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224371994
2	NC_012109	TTA	2	6	296	301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371994
3	NC_012109	AAC	2	6	361	366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371994
4	NC_012109	ATT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371994
5	NC_012109	AAG	2	6	806	811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371994
6	NC_012109	GAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371994
7	NC_012109	AAC	2	6	846	851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371994
8	NC_012109	CAA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
9	NC_012109	AAC	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
10	NC_012109	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
11	NC_012109	AAC	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
12	NC_012109	ACA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
13	NC_012109	ACA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
14	NC_012109	CCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224371995
15	NC_012109	ACT	2	6	1559	1564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371995
16	NC_012109	CTC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224371995
17	NC_012109	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
18	NC_012109	ACA	2	6	1659	1664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
19	NC_012109	AAC	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
20	NC_012109	ACA	2	6	1691	1696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
21	NC_012109	ACA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
22	NC_012109	ACA	2	6	1715	1720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
23	NC_012109	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224371995
24	NC_012109	ATT	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371995
25	NC_012109	TGA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224371995
26	NC_012109	CAT	2	6	1907	1912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371995
27	NC_012109	AGC	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224371995
28	NC_012109	GTG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224371995
29	NC_012109	GAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
30	NC_012109	ACA	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
31	NC_012109	ATT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371995
32	NC_012109	CAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
33	NC_012109	AGA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
34	NC_012109	CAT	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371996
35	NC_012109	TTG	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224371996
36	NC_012109	CCA	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224371997
37	NC_012109	TGA	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372000
38	NC_012109	ACT	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372000
39	NC_012109	CAT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372000
40	NC_012109	ATA	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372000
41	NC_012109	GAT	2	6	3511	3516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372000
42	NC_012109	CTA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372001
43	NC_012109	TTA	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372001
44	NC_012109	ATA	2	6	3674	3679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372001
45	NC_012109	CCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372001
46	NC_012109	TGA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372001
47	NC_012109	CTG	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372002
48	NC_012109	TCT	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372003
49	NC_012109	CAT	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372003
50	NC_012109	ATT	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372003
51	NC_012109	CCG	2	6	7046	7051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224372004
52	NC_012109	GTG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372004
53	NC_012109	ATC	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372004
54	NC_012109	AAC	2	6	7404	7409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
55	NC_012109	AAG	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372004
56	NC_012109	GAG	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224372004
57	NC_012109	AAT	2	6	7723	7728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372004
58	NC_012109	TGA	2	6	7800	7805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372004
59	NC_012109	GGT	2	6	7837	7842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372004
60	NC_012109	AAC	2	6	7875	7880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
61	NC_012109	ACC	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372004
62	NC_012109	AAC	2	6	8013	8018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
63	NC_012109	TAA	2	6	8112	8117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372004
64	NC_012109	ATA	2	6	8167	8172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372004
65	NC_012109	AGA	2	6	8214	8219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372004
66	NC_012109	TTG	2	6	8447	8452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372004
67	NC_012109	CAA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
68	NC_012109	TTG	2	6	8696	8701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372005
69	NC_012109	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372005
70	NC_012109	ACA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372005
71	NC_012109	CGG	2	6	8849	8854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224372005
72	NC_012109	ATC	2	6	9110	9115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372006
73	NC_012109	GTT	2	6	9190	9195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372006
74	NC_012109	TCT	2	6	9234	9239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
75	NC_012109	TTA	2	6	9258	9263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372006
76	NC_012109	GAA	2	6	9303	9308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372006
77	NC_012109	TTC	2	6	9386	9391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
78	NC_012109	TTC	2	6	9638	9643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
79	NC_012109	CTT	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
80	NC_012109	TCT	2	6	9777	9782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
81	NC_012109	TTG	2	6	10021	10026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372006
82	NC_012109	ATC	2	6	10307	10312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372007
83	NC_012109	CCA	2	6	10340	10345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372007
84	NC_012109	GAA	2	6	10466	10471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372007
85	NC_012109	TGG	2	6	10591	10596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372008
86	NC_012109	TTG	2	6	10644	10649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372008
87	NC_012109	GAC	2	6	10718	10723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372008
88	NC_012109	ATA	2	6	10779	10784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372008
89	NC_012109	CAA	2	6	10790	10795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372008
90	NC_012109	GAA	3	9	10994	11002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372008
91	NC_012109	TAT	2	6	11123	11128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372008
92	NC_012109	TGA	2	6	11151	11156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372008
93	NC_012109	ACC	2	6	11481	11486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372009
94	NC_012109	TCA	2	6	11626	11631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372009
95	NC_012109	AAG	2	6	11975	11980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372010
96	NC_012109	AGA	2	6	12110	12115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372010
97	NC_012109	TGA	2	6	12138	12143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372010
98	NC_012109	CAG	2	6	12178	12183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372010
99	NC_012109	CAA	2	6	12186	12191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372010
100	NC_012109	GTT	2	6	12309	12314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372010
101	NC_012109	GAT	2	6	12472	12477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372010
102	NC_012109	AGT	2	6	12501	12506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372010
103	NC_012109	GTC	2	6	12521	12526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372010
104	NC_012109	AAT	2	6	12548	12553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372010
105	NC_012109	TCC	2	6	12606	12611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224372011
106	NC_012109	TGC	2	6	12797	12802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372011
107	NC_012109	TTG	2	6	12952	12957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372011
108	NC_012109	GGT	2	6	12990	12995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372011
109	NC_012109	TTC	2	6	13020	13025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372011
110	NC_012109	TGG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372011
111	NC_012109	GAC	2	6	13117	13122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372011
112	NC_012109	AAT	3	9	13138	13146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372011
113	NC_012109	TTG	2	6	13328	13333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372011
114	NC_012109	GAT	2	6	13426	13431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372011
115	NC_012109	ATG	2	6	13545	13550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372011
116	NC_012109	GCA	2	6	13560	13565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372011
117	NC_012109	ATG	2	6	13668	13673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372011
118	NC_012109	CAA	2	6	13678	13683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372011
119	NC_012109	GGT	3	9	13718	13726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372011
120	NC_012109	TGC	2	6	13731	13736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372011
121	NC_012109	TTC	2	6	13779	13784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372011
122	NC_012109	ATC	2	6	13812	13817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372011
123	NC_012109	AGA	2	6	13917	13922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372011
124	NC_012109	ATA	2	6	14060	14065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372011
125	NC_012109	TAA	2	6	14136	14141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372012
126	NC_012109	AAG	2	6	14151	14156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372012
127	NC_012109	CAC	2	6	14177	14182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372012
128	NC_012109	GTT	2	6	14296	14301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372012
129	NC_012109	ACA	2	6	14428	14433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372012
130	NC_012109	ATG	2	6	14566	14571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372012
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252	NC_012109	ATT	2	6	27280	27285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372026
253	NC_012109	ATC	2	6	27334	27339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
254	NC_012109	ATC	2	6	27351	27356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
255	NC_012109	AAG	2	6	27375	27380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372026
256	NC_012109	ATC	2	6	27475	27480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
257	NC_012109	CAT	2	6	27728	27733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
258	NC_012109	CTG	2	6	27756	27761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372026
259	NC_012109	AGA	2	6	27802	27807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372026
260	NC_012109	GGC	2	6	28094	28099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224372027
261	NC_012109	GCT	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372027
262	NC_012109	TAA	2	6	28274	28279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372027
263	NC_012109	TCG	2	6	28284	28289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372027
264	NC_012109	GTT	2	6	28297	28302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372027
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279	NC_012109	TGG	2	6	29647	29652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372027
280	NC_012109	CAT	2	6	29708	29713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372027
281	NC_012109	TCA	2	6	29740	29745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372027
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288	NC_012109	TCA	2	6	30255	30260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372027
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383	NC_012109	GCA	2	6	39997	40002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372034
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