MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 chromosome

Total Repeats: 57160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012108	ATA	2	6	127	132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367125
2	NC_012108	CTG	2	6	440	445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367125
3	NC_012108	ATT	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367125
4	NC_012108	GAT	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367125
5	NC_012108	TGA	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367125
6	NC_012108	AGA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367125
7	NC_012108	TGC	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367125
8	NC_012108	GTC	2	6	886	891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367125
9	NC_012108	ATC	2	6	1057	1062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367125
10	NC_012108	GAT	3	9	1072	1080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367125
11	NC_012108	AAT	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367125
12	NC_012108	AAC	2	6	1136	1141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224367126
13	NC_012108	GGT	2	6	1267	1272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367126
14	NC_012108	ACA	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224367126
15	NC_012108	TCA	2	6	1323	1328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367126
16	NC_012108	CGG	2	6	1441	1446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367126
17	NC_012108	CGG	2	6	1703	1708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367126
18	NC_012108	CAT	3	9	1744	1752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367126
19	NC_012108	GAT	2	6	1778	1783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367126
20	NC_012108	TTG	2	6	1812	1817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367126
21	NC_012108	CAA	2	6	1945	1950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224367126
22	NC_012108	GGT	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367126
23	NC_012108	GAT	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367126
24	NC_012108	TAG	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367126
25	NC_012108	GCC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367126
26	NC_012108	CAG	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367126
27	NC_012108	AAG	2	6	2524	2529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367126
28	NC_012108	TGA	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367126
29	NC_012108	TCA	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367126
30	NC_012108	CTG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367126
31	NC_012108	GCC	2	6	2731	2736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367126
32	NC_012108	TCT	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224367126
33	NC_012108	AGA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367126
34	NC_012108	GAA	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367126
35	NC_012108	GCC	2	6	3238	3243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367126
36	NC_012108	GGT	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367126
37	NC_012108	TAT	2	6	3316	3321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367126
38	NC_012108	TAT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367127
39	NC_012108	GCT	3	9	3727	3735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367127
40	NC_012108	TGT	2	6	3742	3747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367127
41	NC_012108	CAG	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367127
42	NC_012108	CCA	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367127
43	NC_012108	CCT	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224367127
44	NC_012108	GGT	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367127
45	NC_012108	GCA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367127
46	NC_012108	CAC	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367127
47	NC_012108	GTA	2	6	4695	4700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367127
48	NC_012108	AAT	2	6	4736	4741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367127
49	NC_012108	CAG	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367127
50	NC_012108	AGA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367127
51	NC_012108	GAA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367127
52	NC_012108	ATA	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367127
53	NC_012108	CAA	2	6	4959	4964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224367127
54	NC_012108	GTT	2	6	5015	5020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367128
55	NC_012108	TGA	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367128
56	NC_012108	CTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224367128
57	NC_012108	CTG	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367129
58	NC_012108	GGC	2	6	5732	5737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367129
59	NC_012108	GGC	2	6	5748	5753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367129
60	NC_012108	CCA	2	6	5903	5908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367129
61	NC_012108	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367129
62	NC_012108	GCT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367129
63	NC_012108	GAG	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224367130
64	NC_012108	GGT	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367130
65	NC_012108	GCC	2	6	6258	6263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367130
66	NC_012108	CAT	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367130
67	NC_012108	CGG	2	6	6362	6367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367130
68	NC_012108	TTA	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367130
69	NC_012108	GTT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367130
70	NC_012108	CCA	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367130
71	NC_012108	TGC	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367130
72	NC_012108	TGG	2	6	6793	6798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367131
73	NC_012108	ATG	2	6	6843	6848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367131
74	NC_012108	TGG	2	6	6874	6879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367131
75	NC_012108	CAT	2	6	6908	6913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367131
76	NC_012108	AAG	2	6	6980	6985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367131
77	NC_012108	CCT	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224367131
78	NC_012108	GAT	2	6	7274	7279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367131
79	NC_012108	TCC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224367131
80	NC_012108	CCT	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224367131
81	NC_012108	GAT	2	6	7601	7606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367131
82	NC_012108	CTG	2	6	7613	7618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367131
83	NC_012108	TTC	2	6	7662	7667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224367131
84	NC_012108	AGC	2	6	7724	7729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367131
85	NC_012108	CAT	2	6	8045	8050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367131
86	NC_012108	TGC	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367131
87	NC_012108	CCA	2	6	8187	8192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367132
88	NC_012108	TGT	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367132
89	NC_012108	AAC	2	6	8351	8356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224367132
90	NC_012108	ATT	2	6	8572	8577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367132
91	NC_012108	CAA	2	6	8769	8774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224367132
92	NC_012108	ACT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367133
93	NC_012108	TAA	2	6	9186	9191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367133
94	NC_012108	ATA	2	6	9312	9317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367133
95	NC_012108	ACG	2	6	9342	9347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367133
96	NC_012108	ATT	2	6	9368	9373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367133
97	NC_012108	TGA	2	6	9745	9750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367133
98	NC_012108	ACG	2	6	9835	9840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367133
99	NC_012108	GAT	2	6	9995	10000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367133
100	NC_012108	GTT	2	6	10042	10047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367133
101	NC_012108	TCA	2	6	10050	10055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367133
102	NC_012108	TCA	2	6	10434	10439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367134
103	NC_012108	GTC	2	6	10606	10611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367134
104	NC_012108	GAT	2	6	10627	10632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367134
105	NC_012108	AAT	2	6	10699	10704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367134
106	NC_012108	TGT	2	6	10746	10751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367134
107	NC_012108	ATC	2	6	10958	10963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367134
108	NC_012108	TAG	2	6	11228	11233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367134
109	NC_012108	CAA	2	6	11325	11330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224367134
110	NC_012108	GCT	2	6	11445	11450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367134
111	NC_012108	CTG	2	6	11456	11461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367134
112	NC_012108	TAT	2	6	11470	11475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367134
113	NC_012108	ATG	2	6	11607	11612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367135
114	NC_012108	GAA	2	6	11656	11661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367135
115	NC_012108	TTC	2	6	11792	11797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224367135
116	NC_012108	TGA	2	6	11854	11859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367135
117	NC_012108	TCA	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367135
118	NC_012108	CAG	2	6	12156	12161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367135
119	NC_012108	CAG	2	6	12248	12253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367135
120	NC_012108	TGA	2	6	12499	12504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367135
121	NC_012108	TCA	2	6	12522	12527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367135
122	NC_012108	TCC	2	6	12647	12652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224367135
123	NC_012108	AGC	2	6	12660	12665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367135
124	NC_012108	CAT	2	6	12706	12711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367135
125	NC_012108	GCG	2	6	12756	12761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367135
126	NC_012108	GGC	2	6	12839	12844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367135
127	NC_012108	TCA	2	6	12876	12881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367135
128	NC_012108	GCC	2	6	13176	13181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367135
129	NC_012108	CCA	2	6	13243	13248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367135
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253	NC_012108	GCT	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367142
254	NC_012108	TGG	2	6	26302	26307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367142
255	NC_012108	CAT	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367142
256	NC_012108	GGC	2	6	26447	26452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367142
257	NC_012108	AGA	2	6	26453	26458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367142
258	NC_012108	AGG	2	6	26462	26467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224367142
259	NC_012108	TTA	2	6	26471	26476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367143
260	NC_012108	CCA	2	6	26610	26615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367143
261	NC_012108	GCC	2	6	26630	26635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367143
262	NC_012108	CAG	2	6	26680	26685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224367143
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265	NC_012108	TGG	3	9	26822	26830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367143
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269	NC_012108	GTG	2	6	27082	27087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367143
270	NC_012108	GAT	2	6	27102	27107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367143
271	NC_012108	GAT	2	6	27132	27137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367143
272	NC_012108	TAT	2	6	27247	27252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367143
273	NC_012108	GGT	2	6	27463	27468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367143
274	NC_012108	TGG	2	6	27611	27616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224367143
275	NC_012108	GCC	2	6	27716	27721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367143
276	NC_012108	AGA	2	6	27755	27760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367143
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278	NC_012108	GGC	2	6	27929	27934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224367144
279	NC_012108	TGC	2	6	27940	27945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224367144
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283	NC_012108	CCA	2	6	28447	28452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224367144
284	NC_012108	AGA	2	6	28559	28564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224367144
285	NC_012108	ATC	2	6	28641	28646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367144
286	NC_012108	GCC	2	6	28701	28706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367144
287	NC_012108	ATT	2	6	28901	28906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367144
288	NC_012108	ATT	2	6	29043	29048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367145
289	NC_012108	TGA	2	6	29312	29317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367145
290	NC_012108	ATC	2	6	29922	29927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224367146
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292	NC_012108	TGA	2	6	30082	30087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367146
293	NC_012108	ATT	2	6	30105	30110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367146
294	NC_012108	CGC	2	6	30121	30126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367146
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297	NC_012108	CGC	2	6	30326	30331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224367146
298	NC_012108	GTT	2	6	30395	30400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367146
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310	NC_012108	ATT	2	6	31372	31377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224367147
311	NC_012108	GTT	2	6	31536	31541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224367147
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323	NC_012108	TGA	2	6	32501	32506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367148
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369	NC_012108	ATA	2	6	37446	37451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224367152
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373	NC_012108	GAT	2	6	37787	37792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224367152
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