MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter lari RM2100 megaplasmid pCL2100

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012040	AAAAT	2	10	836	845	80 %	20 %	0 %	0 %	222778488
2	NC_012040	CTTTT	2	10	1555	1564	0 %	80 %	0 %	20 %	222778489
3	NC_012040	TAAAT	2	10	1752	1761	60 %	40 %	0 %	0 %	222778489
4	NC_012040	TATAT	2	10	2075	2084	40 %	60 %	0 %	0 %	222778489
5	NC_012040	TAATT	2	10	5498	5507	40 %	60 %	0 %	0 %	222778489
6	NC_012040	AATAA	2	10	5996	6005	80 %	20 %	0 %	0 %	222778489
7	NC_012040	CTTTC	2	10	7108	7117	0 %	60 %	0 %	40 %	222778489
8	NC_012040	ATAGA	2	10	7148	7157	60 %	20 %	20 %	0 %	222778489
9	NC_012040	TGTTT	2	10	7219	7228	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012040	CTATA	2	10	9111	9120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012040	TGTTT	2	10	9185	9194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012040	ATAAA	2	10	10493	10502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012040	TTATT	2	10	11771	11780	20 %	80 %	0 %	0 %	222778496
14	NC_012040	AATTT	2	10	12090	12099	40 %	60 %	0 %	0 %	222778496
15	NC_012040	TAAAT	2	10	12344	12353	60 %	40 %	0 %	0 %	222778496
16	NC_012040	TAATT	2	10	12863	12872	40 %	60 %	0 %	0 %	222778496
17	NC_012040	TTATT	2	10	13865	13874	20 %	80 %	0 %	0 %	222778496
18	NC_012040	AAAAC	2	10	14329	14338	80 %	0 %	0 %	20 %	222778496
19	NC_012040	CAAAG	2	10	16081	16090	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012040	TAATT	2	10	16370	16379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012040	AAAGC	2	10	16693	16702	60 %	0 %	20 %	20 %	222778499
22	NC_012040	TTATT	2	10	16776	16785	20 %	80 %	0 %	0 %	222778500
23	NC_012040	AAAGC	2	10	17033	17042	60 %	0 %	20 %	20 %	222778500
24	NC_012040	ATTTT	2	10	17932	17941	20 %	80 %	0 %	0 %	222778501
25	NC_012040	GGTTG	2	10	18709	18718	0 %	40 %	60 %	0 %	222778502
26	NC_012040	AAGAT	2	10	18914	18923	60 %	20 %	20 %	0 %	222778502
27	NC_012040	CAAAG	2	10	19154	19163	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012040	ATCAA	2	10	19370	19379	60 %	20 %	0 %	20 %	222778503
29	NC_012040	TAGCC	2	10	19978	19987	20 %	20 %	20 %	40 %	222778504
30	NC_012040	AATAA	2	10	20447	20456	80 %	20 %	0 %	0 %	222778504
31	NC_012040	AGAAA	2	10	20467	20476	80 %	0 %	20 %	0 %	222778504
32	NC_012040	AAGAG	2	10	20482	20491	60 %	0 %	40 %	0 %	222778504
33	NC_012040	ATTTT	2	10	21131	21140	20 %	80 %	0 %	0 %	222778505
34	NC_012040	AACTC	2	10	23113	23122	40 %	20 %	0 %	40 %	222778507
35	NC_012040	AAGAT	2	10	23631	23640	60 %	20 %	20 %	0 %	222778507
36	NC_012040	CTTTT	2	10	25648	25657	0 %	80 %	0 %	20 %	222778509
37	NC_012040	AGAAA	2	10	25911	25920	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012040	AAAAT	2	10	25968	25977	80 %	20 %	0 %	0 %	222778510
39	NC_012040	TAATT	2	10	28411	28420	40 %	60 %	0 %	0 %	222778513
40	NC_012040	GATTG	2	10	28805	28814	20 %	40 %	40 %	0 %	222778513
41	NC_012040	ATTAA	2	10	29318	29327	60 %	40 %	0 %	0 %	222778513
42	NC_012040	AAAGC	2	10	29388	29397	60 %	0 %	20 %	20 %	222778513
43	NC_012040	AAAAG	2	10	30667	30676	80 %	0 %	20 %	0 %	222778514
44	NC_012040	AAAAT	2	10	32236	32245	80 %	20 %	0 %	0 %	222778515
45	NC_012040	AAACA	2	10	35059	35068	80 %	0 %	0 %	20 %	222778515
46	NC_012040	AAATC	2	10	35225	35234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012040	ATATT	2	10	35930	35939	40 %	60 %	0 %	0 %	222778517
48	NC_012040	TAAGA	2	10	36446	36455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012040	TAAGA	2	10	36848	36857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012040	TTTAT	2	10	36949	36958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012040	GAAAT	2	10	37056	37065	60 %	20 %	20 %	0 %	222778518
52	NC_012040	ATGAA	2	10	38489	38498	60 %	20 %	20 %	0 %	222778520
53	NC_012040	TAAAT	2	10	38875	38884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012040	TTAAT	2	10	40204	40213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012040	TCAAA	2	10	42744	42753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012040	AAATT	2	10	42754	42763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012040	ATGAA	2	10	42858	42867	60 %	20 %	20 %	0 %	222778525
58	NC_012040	TAAAT	2	10	43244	43253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012040	ATGTT	2	10	45076	45085	20 %	60 %	20 %	0 %	222778527
60	NC_012040	GTTTT	2	10	45150	45159	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012040	TTTTG	2	10	45392	45401	0 %	80 %	20 %	0 %	222778528
62	NC_012040	ATAAA	2	10	45820	45829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.