MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100 megaplasmid pCL2100

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012040	AT	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	222778488
2	NC_012040	GA	4	8	1057	1064	50 %	0 %	50 %	0 %	222778488
3	NC_012040	AT	3	6	2119	2124	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
4	NC_012040	TC	3	6	2430	2435	0 %	50 %	0 %	50 %	222778489
5	NC_012040	TA	3	6	3202	3207	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
6	NC_012040	AT	3	6	3427	3432	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
7	NC_012040	AT	3	6	3441	3446	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
8	NC_012040	TA	4	8	4174	4181	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
9	NC_012040	AT	3	6	4678	4683	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
10	NC_012040	TA	3	6	5897	5902	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
11	NC_012040	AT	3	6	6163	6168	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
12	NC_012040	GT	3	6	6403	6408	0 %	50 %	50 %	0 %	222778489
13	NC_012040	TA	3	6	6784	6789	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
14	NC_012040	TC	3	6	6970	6975	0 %	50 %	0 %	50 %	222778489
15	NC_012040	AT	3	6	7378	7383	50 %	50 %	0 %	0 %	222778490
16	NC_012040	TC	4	8	7609	7616	0 %	50 %	0 %	50 %	222778490
17	NC_012040	CA	3	6	8902	8907	50 %	0 %	0 %	50 %	222778492
18	NC_012040	AT	3	6	9289	9294	50 %	50 %	0 %	0 %	222778493
19	NC_012040	TA	3	6	10022	10027	50 %	50 %	0 %	0 %	222778493
20	NC_012040	AT	3	6	10081	10086	50 %	50 %	0 %	0 %	222778493
21	NC_012040	TA	3	6	12460	12465	50 %	50 %	0 %	0 %	222778496
22	NC_012040	AT	3	6	12558	12563	50 %	50 %	0 %	0 %	222778496
23	NC_012040	AT	3	6	13451	13456	50 %	50 %	0 %	0 %	222778496
24	NC_012040	TA	3	6	14295	14300	50 %	50 %	0 %	0 %	222778496
25	NC_012040	GA	3	6	14842	14847	50 %	0 %	50 %	0 %	222778497
26	NC_012040	TA	3	6	18139	18144	50 %	50 %	0 %	0 %	222778501
27	NC_012040	AT	3	6	18246	18251	50 %	50 %	0 %	0 %	222778501
28	NC_012040	GT	3	6	18418	18423	0 %	50 %	50 %	0 %	222778501
29	NC_012040	TC	3	6	19573	19578	0 %	50 %	0 %	50 %	222778503
30	NC_012040	AT	3	6	19580	19585	50 %	50 %	0 %	0 %	222778503
31	NC_012040	CA	3	6	19835	19840	50 %	0 %	0 %	50 %	222778503
32	NC_012040	GT	3	6	20631	20636	0 %	50 %	50 %	0 %	222778504
33	NC_012040	AT	3	6	21030	21035	50 %	50 %	0 %	0 %	222778505
34	NC_012040	TA	3	6	21514	21519	50 %	50 %	0 %	0 %	222778505
35	NC_012040	AT	3	6	23040	23045	50 %	50 %	0 %	0 %	222778506
36	NC_012040	AG	3	6	24076	24081	50 %	0 %	50 %	0 %	222778508
37	NC_012040	TA	3	6	24212	24217	50 %	50 %	0 %	0 %	222778508
38	NC_012040	GA	3	6	24685	24690	50 %	0 %	50 %	0 %	222778508
39	NC_012040	TA	3	6	24716	24721	50 %	50 %	0 %	0 %	222778508
40	NC_012040	TA	3	6	24883	24888	50 %	50 %	0 %	0 %	222778508
41	NC_012040	AG	3	6	25046	25051	50 %	0 %	50 %	0 %	222778508
42	NC_012040	TC	3	6	25299	25304	0 %	50 %	0 %	50 %	222778508
43	NC_012040	GA	3	6	25828	25833	50 %	0 %	50 %	0 %	222778509
44	NC_012040	TA	3	6	26445	26450	50 %	50 %	0 %	0 %	222778510
45	NC_012040	AG	3	6	26547	26552	50 %	0 %	50 %	0 %	222778510
46	NC_012040	GA	3	6	26562	26567	50 %	0 %	50 %	0 %	222778510
47	NC_012040	CA	3	6	27930	27935	50 %	0 %	0 %	50 %	222778512
48	NC_012040	AG	3	6	27948	27953	50 %	0 %	50 %	0 %	222778512
49	NC_012040	AT	3	6	28437	28442	50 %	50 %	0 %	0 %	222778513
50	NC_012040	AT	3	6	28528	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	222778513
51	NC_012040	AT	3	6	29938	29943	50 %	50 %	0 %	0 %	222778513
52	NC_012040	AT	3	6	30111	30116	50 %	50 %	0 %	0 %	222778513
53	NC_012040	AC	3	6	30481	30486	50 %	0 %	0 %	50 %	222778514
54	NC_012040	AT	3	6	30796	30801	50 %	50 %	0 %	0 %	222778515
55	NC_012040	AC	3	6	30892	30897	50 %	0 %	0 %	50 %	222778515
56	NC_012040	AT	3	6	31449	31454	50 %	50 %	0 %	0 %	222778515
57	NC_012040	AC	3	6	31500	31505	50 %	0 %	0 %	50 %	222778515
58	NC_012040	AT	3	6	32362	32367	50 %	50 %	0 %	0 %	222778515
59	NC_012040	AG	3	6	32433	32438	50 %	0 %	50 %	0 %	222778515
60	NC_012040	AT	3	6	34362	34367	50 %	50 %	0 %	0 %	222778515
61	NC_012040	TA	3	6	35769	35774	50 %	50 %	0 %	0 %	222778517
62	NC_012040	AT	3	6	36026	36031	50 %	50 %	0 %	0 %	222778517
63	NC_012040	AT	3	6	36977	36982	50 %	50 %	0 %	0 %	222778518
64	NC_012040	TA	3	6	36986	36991	50 %	50 %	0 %	0 %	222778518
65	NC_012040	TA	3	6	37252	37257	50 %	50 %	0 %	0 %	222778518
66	NC_012040	TC	3	6	38124	38129	0 %	50 %	0 %	50 %	222778519
67	NC_012040	AT	3	6	38676	38681	50 %	50 %	0 %	0 %	222778520
68	NC_012040	AG	3	6	39246	39251	50 %	0 %	50 %	0 %	222778521
69	NC_012040	AT	3	6	40059	40064	50 %	50 %	0 %	0 %	222778521
70	NC_012040	AT	3	6	40423	40428	50 %	50 %	0 %	0 %	222778522
71	NC_012040	TG	3	6	40491	40496	0 %	50 %	50 %	0 %	222778522
72	NC_012040	TC	3	6	40513	40518	0 %	50 %	0 %	50 %	222778522
73	NC_012040	AT	3	6	41404	41409	50 %	50 %	0 %	0 %	222778523
74	NC_012040	TA	3	6	42253	42258	50 %	50 %	0 %	0 %	222778524
75	NC_012040	AT	3	6	42300	42305	50 %	50 %	0 %	0 %	222778524
76	NC_012040	AT	3	6	43045	43050	50 %	50 %	0 %	0 %	222778525
77	NC_012040	AG	3	6	43615	43620	50 %	0 %	50 %	0 %	222778526
78	NC_012040	AC	3	6	45012	45017	50 %	0 %	0 %	50 %	222778527
79	NC_012040	TC	3	6	45379	45384	0 %	50 %	0 %	50 %	222778528

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.